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2024年4月29日，国际顶级学术期刊《自然植物（Nature Plants）》以“iJAZ-based approach to engineer lepidopteran pest resistance in multiple crop species”为题，发表了中国农业科学院棉花研究所李付广研究员团队的最新科研成果，详细介绍了研究团队在棉花中发现的具有广谱应用价值的新型高效杀虫蛋白的分子机制...
新型碱基编辑器助力工业底盘菌株创制（图）
新型碱基编辑器 工业底盘 菌株创制
2024/5/24
近年来，生物制造产业发展迅速，已成为推动我国经济社会可持续发展的重要引擎。工业菌株是生物制造的“灵魂”，性能优良的工业微生物就像一个个高效的“细胞工厂”，只需要摄取简单的营养甚至废料，便可合成我们日常所需的各种产品，如蛋白质、生物药品、化妆护肤成分、生物染料等。
美国企业拟开发新一代基因编辑工具
基因编辑工具 拜耳医药 基因突变
2024/2/29
Moderna 曾表示，双方的合作不是为了仅仅敲除一个基因、修改一个碱基，或是修复一个基因突变，而是要创造新的基因编辑工具，让科学家能有更好的工具可用，让医生能更好地治疗遗传疾病。
英国成立功能基因组学实验室
英国 功能基因组学 实验室
2024/1/17
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。
在有丝分裂过程中，染色体向子细胞的正确分配依赖于在染色体着丝粒上组装的动粒蛋白复合物。动粒和纺锤体微管的附着受到纺锤体组装检查点(Spindle assembly checkpoint，SAC)严格监控，以延迟细胞进入后期，直到所有动粒正确附着。拟南芥KNL1仅在两个功能域上与动物相关，其余氨基酸序列几乎没有同源性，所以植物同源物能否在SAC信号传导中起作用？高度分化的KNL1家族蛋白在不同植物谱...
法国巴黎时间2023年11月5日，国际基因工程机器大赛（iGEM）在巴黎Paris Expo-Porte de Versailles落下帷幕。本次大赛中，南京大学生命科学学院参赛团队Nanjing-China在全球400余支队伍中脱颖而出，斩获全球银奖。
法国巴黎时间2023年11月5日，国际基因工程机器大赛（iGEM）在巴黎Paris Expo-Porte de Versailles落下帷幕。2023年，来自44个国家和地区的393支队伍参加了此次大赛，南京大学生命科学学院iGEM参赛团队NJU-China从中脱颖而出，荣获2023年大赛金牌和最佳新基础部件提名。
美国绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱
美国 小鼠全脑 单细胞 空间转录组图谱
2024/1/15
美国麻省理工学院和布罗德研究所的科研人员绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱，为深入理解大脑结构与功能提供了重要基础。该团队基于109万个高质量空间分辨单细胞基因表达定义出小鼠大脑更精细的组织区域，绘制出的大规模分子空间图谱囊括了超100万个细胞及其基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分子组织区域类型，以及遗传操作可及性。相关研究成果发表于《Nature》期刊。
近年来，随着测序技术和算法的开发，大量动植物基因组被陆续测序和组装，但是基因组组装质量参差不齐，存在不同程度的组装错误，影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法，然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值，没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
中国林业科学研究院华北林业实验中心开发出精准性高的小型化Cas9基因编辑工具（图）
精准性高 小型化 Cas9基因 编辑工具
2023/11/20
RNA引导的CRISPR-Cas9系统被广泛应用于哺乳动物细胞的基因组编辑，在基因遗传病的治疗中展现出巨大的发展潜力。限制基因编辑工具应用的主要因素包括编辑活性、PAM限制、蛋白大小、特异性问题等。识别NGG PAM的SpCas9编辑活性高，是最常用的基因编辑工具。但SpCas9特异性较差，使用时往往伴随大量的有害突变。且当SpCas9用于基因治疗时，SpCas9太大无法被单个AAV递送。SaCa...
韩国DNA纳米技术可将DNA像纸一样折叠
韩国 DNA纳米技术 DNA 折叠
2024/1/15
韩国首尔大学团队开发出DNA纳米技术，可以像折纸一样折叠或展开厚度为人类头发千分之一的DNA纳米结构。
科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱
细胞游离 DNA单分子 全基因组 突变图谱
2024/1/15
体细胞突变是肿瘤发生的标志，可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱，用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Single-molecule genome-wide mutation profiles of cell-free DNA for non-invasive detection of can...
科学家利用大规模基因组关联分析确定青光眼风险位点
基因组 关联分析 青光眼 风险位点
2024/1/16
青光眼是导致不可逆失明的主要原因，是一种高度遗传相关的人类疾病。过去的全基因组关联研究已经为最常见的原发性开角型青光眼确定了100多个风险位点。澳大利亚昆士兰医学研究院伯格霍夫医学研究所利用大规模、多特征全基因组关联分析确定了数百个青光眼风险位点。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Large-scale multitrait genome-wide associ...
科学家利用迁移学习建立计算大模型预测基因调控研究
迁移学习 计算大模型 预测基因调控
2024/1/16
基因网络绘制需要大量转录组数据用于建立基因之间的联系，这也阻碍了一些数据有限场景（如罕见病）等研究。最近，利用迁移学习的机器学习技术在自然语言和计算机视觉等领域带来了变革性进展，其通过在大规模通用数据集上进行大模型预训练，而后迁移到数据量有限的特定任务进行微调。美国博德研究所等研究团队提出了一个深度学习模型Geneformer可实现特定生物学任务与背景中的预测。该研究成果于近日发表在《Nature...
Nature Genetics|中国农业大学农学院赖锦盛教授团队发表全基因组所有染色体端粒到端粒完整无间隙玉米基因组组装（图）
全基因组 染色体端粒 端粒完整 无间隙 玉米 基因组组装
2024/5/21
2023年6月15日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心、玉米生物育种全国重点实验室赖锦盛教授团队以题为“A complete telomere-to-telomere assembly of the maize genome”在国际知名期刊Nature Genetics《自然·遗传学》上在线发表了玉米全基因组所有染色体端粒到端粒完整无间隙组装结果，在复杂动植物基因组中第一个实现真正意义上的全基...