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DNA聚合酶分子马达精确动态工作机理研究取得进展（图）
DNA聚合酶分子 马达 确动态工作机理
2023/1/6
从细胞最基本的各种功能原件开始，精确认识其动态工作机理，是认识生命、有效干预生命过程具备基本意义的第一步。伴随冷冻电镜技术的突破，蛋白质静态晶体结构目前能够高效获取，为突破生命科学认知局限提供了巨大便利。之后，解析蛋白质分子内部复杂部件的动态反应机理，是生命科学未来亟需突破的难题。其中，DNA/RNA聚合酶等马达分子精确动态工作机理的明晰，将为高效研发控制病毒复制的有效药物提供可行前提。遗憾的是，...
转录调控蛋白质机器由转录因子（transcirption factor，TF）、转录辅助因子（transcirptional coregulator， TC）等构成，其在几乎所有生物学进程（如分化、发育、细胞周期控制和细胞凋亡等）中都发挥着关键作用。基因的转录过程依赖于转录调控蛋白质机器与DNA结合并行使相应功能，二者的结合是基因启动转录的前提。真核生物基因组中的染色质有一些区域经染色质重塑后呈现...
具有Borromean三体关联的量子液滴态（图）
Borromean束缚 三体关联 量子液滴态 量子少体束缚态
2023/1/6
探究多体体系中主导的少体关联效应是物理学研究的重要内容，而新奇的量子少体束缚态的出现为揭示多体物理体系中奇特的少体关联提供了崭新的视角。 Borromean束缚就属于这样一类少体束缚态，如图1中的Borromean环链所示，它指的是只有三个物体同时存在才能相互束缚，而任意两个物体都不能形成束缚态，代表了一类特别的量子三体关联效应。在物理体系中，Borromean束缚的著名例子包括11Li和6He原...
Genome-wide identification of NF-YA gene family in cotton and the positive role of GhNF-YA10 and GhNF-YA23 in salt tolerance
全基因组分析 雷蒙德氏棉 亚洲棉 海岛棉 陆地棉
2024/5/17
本研究基于全基因组分析，在雷蒙德氏棉、亚洲棉、海岛棉和陆地棉基因组中分别鉴定得到16、16、31和29个NF-YA基因。通过进化树分析将NF-YA基因分为4个亚组。结构分析表明NF-YA基因在棉属进化过程中相对保守。荧光定量显示GhNF-YAs可能通过ABA和 MeJA的调控通路响应盐和干旱。VIGS沉默GhNF-YA10和GhNF-YA23的表达，能显著降低棉花对盐的抗性，表明这两个基...
Open-Bud Duplicate Loci Are Identified as MML10s, Orthologs of MIXTA-Like Genes on Homologous Chromosomes of Allotetraploid Cotton
棉花 开发花蕾 ob1基因
2024/5/17
通过图位克隆鉴定了控制开发花蕾的ob1基因，是位于D13染色体上的MIXTA-like MYB基因，解释了ob2位点的因果变异。运用全基因组转录组分析技术，发现ob突变体中部分MYB基因和细胞壁生物发生、毛状体分化、细胞分裂素信号转导和细胞分裂的相关基因受到抑制，花瓣生长可能因此受到抑制。
A Retrotransposon Insertion in GhMML3_D12 Is Likely Responsible for the Lintless Locus li 3 of Tetraploid
图位克隆 棉花纤维 起始基因 Li3
2024/5/17
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论文简介：利用无纤维突变体，通过图位克隆了纤维起始基因Li3，该基因是位于染色体D12（GhMML3_D12）上的R2R3-MYB转录因子。借助序列分析和遗传分析，发现li3是一个功能缺失的等位基因，和N3是一对具有加性效应的同源突变体，对纤维(绒或棉)的起始具有加性作用。这些发现为影响棉花纤维起始的遗传因素提供了新的信息。
系统鉴定和分析了棉花SUN家族蛋白，通过病毒诱导的敲除和CRISPR/cas9介导的GbSUN5敲除，发现尽管花粉活力仍然正常，但是其败育率较高。本研究结果表明：SUN3和SUN5在生物学功能上存在差异，在生殖发育中发挥重要作用。
Genomic analyses reveal the genetic basis of early maturity and identification of loci and candidate genes in upland cotton (Gossypium hirsutum L.)
陆地棉 全基因组 重测序方法 SNP变异图谱
2024/5/17
本研究利用收集的436份国内外变异广泛的陆地棉材料，采用全基因组重测序方法，构建了群体的SNP变异图谱，通过对包含136份早熟棉资源在内的356份陆地棉材料进行深度重测序，并结合公共数据库中的80份陆地棉材料共获得了10,118,884个高质量的SNPs。利用全基因组关联分析（GWAS）鉴定到控制陆地棉早熟性的307个显著遗传位点和重要调控基因。两个早熟遗传热点区域位于 D03和A05&...
Systematical characterization of YUCCA gene family in five cotton species, and potential functions of YUCCA22 gene in drought resistance of cotton
棉花 YUC基因家族 生长素合成
2024/5/17
生长素在植物的正常生长发育中起着至关重要的作用。TAA/YUCCA基因家族编码色氨酸氨基转移酶（tryptophan aminotransferase），是生长素合成的关键酶。然而，棉花中YUCCA（YUC）基因家族尚未见报道。为了揭示YUC基因在棉花中的功能，我们系统地鉴定了五个棉种中的YUC基因家族，包括成员分析、特征描述、基因组内复制和共线关系。转录组学分析表明，GhYUCs参与了棉花的非生...
GhTULP34, a member of tubby-like proteins, interacts with GhSKP1A to negatively regulate plant osmotic stress
Tubby-like 蛋白基因 环境胁迫 棉花 组织发育
2024/5/17
Tubby-like蛋白基因(TULPs)以大型多基因家族的形式存在，在环境胁迫中发挥重要作用。然而，关于棉花中TULP家族基因的研究却知之甚少。本研究系统地对4种棉花TULPs的隶属关系、特征及其进化关系进行了鉴定和分析。转录组分析表明GhTULPs参与了环境胁迫和棉花组织发育。同时，我们还预测和分析了TULPs可能的分子调控机制和功能。GhTULP34作为候选基因，在盐胁迫下显著降低转基因拟南...
DNA是由脱氧核糖核苷酸组成的大分子聚合物，具备较好的稳定性和可编程性，已被广泛作为一种通用型生物材料用于构建各式各样具有精确尺寸和特定形状的纳米结构。另一方面，自上世纪90年代以来，生化学家发现DNA像RNA和蛋白质一样具备酶活性，可催化一系列化学反应，包括在特定位点切割DNA或RNA。当结构和酶这两种不同类型的DNA相遇时产生了一系列火花，一些新的研究领域有望因此而诞生。
浙江大学生命科学研究院2021年8月17日宋海卫和黄俊课题组在Cell Discovery上合作发表论文解析了INTS3/INTS6蛋白质复合物参与DNA损伤修复的分子与结构基础（图）
宋海卫 黄俊 蛋白质复合物 基因
2022/10/25
2021年8月17日，浙江大学生命科学研究院宋海卫课题组和黄俊课题组合作在Cell Discovery上发表了题为“Crystal structure of the INTS3/INTS6 complex reveals the functional importance of INTS3 dimerization in DSB repair”的研究论文。该论文在分子水平上揭示了INTS3的二聚化...
生物高效育种技术创新与应用学科主要研究方向为分子细胞工程育种技术创新与应用、合成生物学、特色作物营养与功能技术创新与应用、转基因检测与安全评价技术创新与应用等。
神秘蛋白质可使人类DNA形态演变成不同结构（图）
DNA形态 蛋白质 凝缩素 细胞核
2022/1/27
北京时间6月9日消息，人类和蚊子的细胞核都具有自己的形状，目前，研究人员发现这两种生物DNA变体非常微妙，可以转化为不同形态，甚至能使人类DNA结构像蚊子DNA一样。