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中国科学院科学家研发出单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法(图)
细胞 空间 学习算法
2024/2/22
环形RNA是一类广泛表达的非编码RNA,有较高的细胞类型及组织表达特异性,在器官发育及肿瘤发生等过程中起着重要调控作用。环形RNA由3‘端的受体位点和5’端的供体位点共价连接形成,这一过程被称为反向剪接,然而由于缺少poly(A)尾,环形RNA无法被经过polyA富集等转录组建库方式有效捕获。因此,环形RNA的表达信息在绝大部分单细胞以及空间转录组数据中缺失。为了获得丰富的单细胞及空间水平的环形R...
中国科学院大连化学物理研究所专利:一种产油微生物RNA的提取方法
中国科学院大连化学物理研究所 专利 产油 微生物 RNA 提取方法
2024/1/26
中国科学院遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器(图)
遗传发育 引导编辑器 基因
2024/1/12
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器(prime editors,PEs)可同时实现任意碱基类型的精准替换,以及小片段的精准插入、替换和删除。目前,几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成,但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点,限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器(prime editors, PEs)能同时实现任意碱基类型的精准替换,及小片段的精准插入、替换和删除。目前,几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成,但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点,限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
科学家开发一款多功能植物小RNA分析工具(图)
RNA 数据分析 科学家
2024/1/5
近日,《科学通报》在线发表了华南农业大学园艺学院教授夏瑞团队最新研究成果,他们研究开发出一款多功能植物小RNA分析工具——sRNAminer,可便于研究人员进行一站式小RNA分析及可视化。
2023年12月6日,中国科学院微生物研究所邓涛研究团队在期刊Journal of Virology在线发表论文,题为“Twenty natural amino acid substitution screening at the last residue 121 of influenza A virus NS2 protein reveals the critical role of NS2 i...
科学家发现古菌向导RNA识别底物的新规则
科学家 古菌 RNA 新规则
2023/12/16
2023年11月30日,中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组在《中国科学:生命科学》在线发表论文,揭示了古菌中2'-O-甲基化修饰全局图谱以及C/D RNA识别底物的新模式。
中国科学院水生所揭示细菌RNA代谢调控新机制(图)
细菌 代谢调控 核酸
2023/11/30
2023年11月30日,中国科学院水生生物研究所张承才团队关于细菌中RNA代谢调控机制的研究取得了进展。相关成果以《蓝藻中RNase E受一个保守蛋白调控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in cyanobacteria)为题,在线发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Re...
中国科学院微生物所研究团队揭示RNA结合蛋白复合体转录后调控真菌次级代谢的新机制(图)
蛋白复合体 真菌 代谢
2024/2/28
2023年11月14日,中科院微生物研究所尹文兵研究团队在Nature Communications上发表题为“Fungal secondary metabolism is governed by an RNA-binding protein CsdA/RsdA complex” 的研究论文。该研究揭示了RNA结合蛋白与全局调控因子RsdA形成复合体,并在转录后水平控制其表达,介导真菌全局次级代谢...
中国科学院上海营养与健康所钱友存研究组发现内源Z-RNA形成及其在抗肿瘤治疗中的新功能(图)
钱友存 抗肿瘤治疗 蛋白
2023/11/30
2023年11月2日,国际期刊Cell Reports在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所钱友存研究组题为“Triggering endogenous Z-RNA sensing for anti-tumor therapy through ZBP1-dependent necroptosis” 的最新研究成果。研究发现在氧化应激的条件下内源Z-RNA可以被诱导产生,并聚集于应激颗粒...
科学家发现环状RNA疗法治疗鱼类弧菌感染机制(图)
环状RNA疗法 上海海洋大学 细胞通讯
2023/11/22
近日,上海海洋大学教授徐田军团队在环状RNA疗法治疗鱼类弧菌感染研究方面取得新进展,相关成果已在《细胞通讯》发表。