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中国科学院上海营养与健康研究所邵振研究组建立用于多样本ChIP-seq数据分组定量比较的MAnorm2计算模型（图）
邵振 多样本ChIP-seq 数据分组 定量比较 MAnorm2 计算模型
2020/12/2
2020年11月19日，Genome Research在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所中科院计算生物学重点实验室（马普伙伴计算生物学研究所）邵振课题组的方法学论文“MAnorm2 for quantitatively comparing groups of ChIP-seq samples”，报道了其开发的新一代MAnorm2计算模型。该模型能够对多样本ChIP/ATAC-seq数据按照特...
ChIP-Seq是在全基因组水平上研究活体细胞中蛋白质和DNA相互作用谱的有效手段. 近年来, 随着高通量短序列DNA测序技术的快速发展, 研究基于新一代DNA测序方法的ChIP-Seq分析算法已经成为热点之一. 然而, 目前报道的分析方法主要是基于对免疫共沉淀获得的DNA片段进行片段大小选择后的ChIP-Seq数据, 也就是主要针对Solexa系统获得的数据进行分析的算法. SOLiD系统是目前...