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2024年3月12日,华中科技大学生命学院朱斌教授团队与武汉大学王隆飞教授团队合作在《Nature》杂志发表题为“Structures and activation mechanism of the Gabija anti-phage system”的研究论文。
武汉大学华中科技大学携手发Nature，关于Gabija（图）
武汉大学 核酸内切酶 心血管病
2024/3/18
北京时间2024年3月12日，Nature（《自然》）以加速预览形式在线发表了武汉大学药学院、泰康生命医学中心、武汉大学中南医院心血管病医院王隆飞教授团队关于Gabija免疫系统防御机制的最新研究论文，题为Structures and activation mechanism of the Gabija anti-phage system。王隆飞教授和华中科技大学生命学院朱斌教授为该论文的共同通讯...
内蒙古大学王进研究员团队在Nature Protocols发表RNA端帽表观转录组系统级分析新技术的详细方法流程（图）
内蒙古大学 王进 Nature Protocols RNA端帽 表观转录组
2023/12/2
转录本的5' 端帽修饰发生于所有生物体中，并在核糖核酸（RNA）稳定性、RNA加工与核输出、信使核糖核酸（mRNA）翻译、固有免疫等方面具有重要作用。多种分析RNA端帽的方法被开发出来，但这些方法存在局限于单个端帽的分析、定量性差、缺乏灵敏度、需要放射性标记、或缺乏化学特异性等问题。我校王进研究员团队联合麻省理工学院（MIT）Peter C. Dedon教授团队等开发了一项能准确而灵敏地量化RNA...
2023年1月12日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队和美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队以及浙江大学冯钰团队合作在Nature上发表题为“Structural basis for intrinsic transcription termination”的研究论文，该研究捕获了细菌固有转录终止的中间状态冷冻电镜结构，揭示了细菌RNA聚合酶识...
蛋白质位点特异性糖基化的定量分析对于生理病理机制探索，疾病诊断和预后标志物的筛选以及抗体药物的开发尤为重要。随着基于质谱（MS）的分析方法和解析软件的发展，蛋白质组范围内大规模完整糖肽的鉴定取得了长足进步。但与之相配套的完整糖肽定量仍存在许多问题：由于糖肽的微观不均一性，糖肽信号比裸肽信号更难识别，完整糖肽定量的准确度和缺失值数都会受到影响；基于数据依赖采集（DDA）策略的糖蛋白组学定量水平受限于...
Nature Cell Biology | 生命科学中心杨崇林实验室揭示丙酸代谢中间物D-2HG和3-HP损伤线粒体的机制（图）
杨崇林实验室 丙酸 酮戊二酸 线粒体 葡萄糖 脂肪酸
2022/9/21
线粒体是细胞的能量工厂和代谢中心。葡萄糖、脂肪酸和多种氨基酸在线粒体氧化分解时，产生多种有机酸类中间物。正常情况下，这些有机酸中间物通过三羧酸循环(TCA)氧化，或作为前体用于合成新的大分子，因而在细胞内的浓度很低。相关代谢酶的缺陷可导致体内有机酸过量累积，表现为血液和尿液中有机酸浓度增高，引起一大类严重的遗传代谢性疾病：有机酸血(尿)症。目前，有机酸血(尿)症的分子细胞学机理极不清楚。
以往认为中心法则中DNA主要发挥模板的作用而信使RNA（mRNA）则扮演着信息传递者的角色。mRNA表观修饰的发现拓展了mRNA的功能。在RNA水平上的转录后修饰可通过顺式或者反式机理调控基因表达，对细胞功能、细胞命运决定至关重要。尽管科学家们长时间以来了解RNA上存在转录后修饰，而这些修饰直到近年来才被认为从另一层面增加了基因表达调控的复杂性。迄今为止，RNA上共发现有多于150种化学修饰，包括...
Nature：厦门大学林圣彩/张宸崧/邓贤明鉴定了二甲双胍的作用靶点
二甲双胍 糖尿病药物 腺苷酸环化酶 动脉粥样硬化
2022/9/15
2022年2月23日，厦门大学林圣彩，张宸崧及邓贤明共同通讯在Nature 在线发表题为“Low-dose metformin targets the lysosomal AMPK pathway through PEN2”的研究论文，该研究显示临床相关浓度的二甲双胍抑制溶酶体质子泵 v-ATP 酶，这是葡萄糖饥饿后 AMPK 激活的中心节点。该研究合成了一种光活性二甲双胍探针，并将 PEN2（γ...
2022年2月14日，云南大学生物医药研究院陈大华团队在Nature Communications上发表研究论文“Dynamic FMR1 granule phase switch instructed by m6A modification contributes to maternal RNA decay”，揭示了FMR1通过m6A修饰调控早期胚胎发育的分子机制。云南大学为第一完成单位，我院张...
四川大学生命科学学院朱晓峰课题组在Nature Communications报道了新一代健康甜味剂稀有甜味成分的规模化生物合成途径（图）
四川大学 生命科学学院 甜味剂 国家重点实验室
2024/3/5
生命科学学院、生物治疗国家重点实验室朱晓峰课题组2021年12月2日在Nature Communications (2021, 12:7030)发表了题为“Catalytic flexibility of rice glycosyltransferase OsUGT91C1 for the production of palatable steviol glycosides”的研究论文，报道了糖基...
蛋白质位点特异性糖基化的精准解析对于研究蛋白质糖基化功能、发现疾病潜在标志物及药物靶标十分重要。大规模、高准确性完整糖肽解析一直是蛋白质后修饰分析领域极具挑战性的工作。近年来，完整糖肽解析在生物质谱分析及计算糖蛋白质组领域都取得了重要进展；然而，目前解析方法仍有明显的局限性：大部分工具无法对糖链鉴定进行质控，尤其是复杂的糖型；检索速度慢；无法对多个糖基化位点精准定位；无法鉴定含有修饰糖单元的完整糖...
真核生物基因转录可分为起始，延伸和终止过程。其中终止过程涉及聚合酶减慢速度至停止，然后从基因组上解离。但相关研究比较有限，没有明确的分子机制模型。
RNA的甲基化具有多种生物学功能，在生物体内参与重要生命过程的核糖体RNA和转运RNA都是高度甲基化；信使RNA(mRNA)的帽子结构的鸟嘌呤有N-7甲基的；近年的研究发现: mRNA的内部的碱基的甲基化参与多种生物学功能的调控，这些研究已逐渐演化成一个全新的学科称为表观转录组学(Epitranscriptome)。目前研究中在生物体内催化RNA甲基化的都是蛋白质，它们利用体内普遍存在的硫腺苷甲硫...
蛋白质糖基化修饰的精准分析对于疾病机制研究、生物标志物发现，以及药物和疫苗开发至关重要。完整糖肽分析能获得特定糖基化位点与糖链的对应关系信息，是现代糖蛋白质组学研究中十分重要而极具挑战性的组成部分。目前，糖肽分析最常用的质谱采集模式是数据依赖性采集（DDA），存在母离子选择随机性的问题，其结果中存在较多的缺失值。近年来出现的数据非依赖性采集（DIA）模式能弥补DDA的缺点，已开始初步应用于糖蛋白质...
Springer Nature出版社出版武旭娜研究员主编的植物磷酸化蛋白质组学工具书《Plant Phosphoproteomics》（图）
武旭娜研究员 磷酸化蛋白质组学 云南大学生命科学学院
2022/9/21
2021年7月，Springer Nature杂志社在其“Methods in Molecular Biology”丛书系列正式出版了云南大学生命科学中心武旭娜研究员主编的植物磷酸化蛋白质组学工具书《Plant Phosphoproteomics》。该书聚焦植物磷酸化蛋白组学研究的前沿技术，汇集了国内外从事植物磷酸化蛋白组学的著名科学家撰写的最先进的植物磷酸化蛋白组学的综述和研究方法。每个研究方法...