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5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析
泥蚶 RAPD 遗传多样性 亲缘关系
2009/9/11
采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术，对5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的20个随机引物中共检测到154个扩增片段，长度在300 bp~2300 bp之间，每个个体扩增条带在1~11条不等。利用Popgen 3.2和PHILIP统计软件，获得实验数据，确立了5个群体间的亲缘关系。结果表明：（1）泥蚶的5个地理群体分化不明显，没有形成不同的地理种群；（2）聚类分析显示，韩国群体与浙江群...
群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析
群体遗传结构 RAPDistance DCFA 进化距离
2009/9/11
近年来，RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而，由于RAPD标记具显性特点，加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善，使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程，同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance，并详述了将DCFA与WINAMOVA联用，对RAPD数据进行AMOVA分析...
利用RAPD和SSR分子标记结合拟测交策略，对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)“黄海1号”雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1代，采用RAPD和SSR 两种分子标记技术初步构建了中国对虾雌、雄遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选，共选出61个RAPD引物和20对SSR引物，用于对父母本和82个F1个体进行遗传分析。共得到母本分离标记14...
黑龙江省强壮水螅遗传多样性的RAPD分析
强壮水螅 遗传多样性 RAPD 聚类分析
2009/6/23
应用RAPD技术对黑龙江省10个分布区17个种群的强壮水螅(Hydra robusta)进行了遗传多样性分析。从80个随机引物中筛选出19个引物，共扩增出320条带，分子量在0.3～3.0 kb，其中多态性带数299个，占93.44%，表现出高度的遗传多样性。17个种群的遗传相似系数(GI)平均值为0.7158，相应的遗传距离(GD)平均值0.3425；分布区内种群间的差异(GD平均值0.169...
家蚕耐氟基因RAPD分子标记的筛选及其克隆
家蚕 近等基因系 耐氟性 RAPD标记
2009/6/23
以家蚕耐氟品种T6和高敏感品种733新为材料，并构建其近等基因系，采用300个随机引物进行RAPD扩增，获得了与家蚕耐氟性有关的一个分子标记S207，并在F[2]代分离个体中得到验证，证明了此分子标记的可靠性，进而将此标记克隆进T载体pUCm-T中，完成了测序，分析发现此序列是新的未有报道的序列。计划下一步将此RAPD标记转化成SCAR标记，建立分子标记辅助育种技术体系。
利用RAPD 分子标记技术对5 个居群的90 个大针茅个体间的遗传关系以及RAPD 多态性与所在生境的相关性进行了研究。16 个引物共扩增得到310 个RAPD 位点, 利用几种多元分析方法对所得位点进行分析, 结果显示: 主轴法分析能够在三维坐标下将90 个大针茅个体按居群来源进行分类, 前三个轴虽然只解释了总变异的21 . 91% , 却能将所研究的居群完全分开; 典范判别分析可以将97 .8...
用正交设计优化荔枝RAPD反应体系
荔枝 RAPD 反应体系 正交设计
2008/12/29
以改良CTAB法提取的荔枝基因组DNA为模板,应用L25(56)正交表,研究了Taq、Mg2+、随机引物、dNTPs和DNA模板5种RAPD反应组分浓度变化对扩增结果的影响,量化分析结果表明:正交设计可以应用于RAPD反应体系的建立.用这种方法建立的荔枝RAPD-PCR优化反应体系为:25 μL 反应体系中含1×Buffer、 2.0 mmol/L Mg2+、 2.0 U Taq DNA聚合酶、 ...
中国啤酒大麦品种RAPD标记的遗传多样性分析
啤酒大麦 RAPD 遗传多样性 聚类分析
2008/12/15
采用RAPD技术对中国38个啤酒大麦品种的遗传资源进行了聚类分析.结果表明:从筛选出的28个有多态性的随机引物中,共扩增出153条谱带,其中91条谱带具有多态性,占59.4%.每个引物可扩增出1～8条多态性谱带,平均3.3条.聚类分析表明,在遗传距离GD值0.27水平上38个啤酒大麦品种可聚成两大类,下分5个亚类.品种间遗传距离GD变幅为0.009 52～0.378 46.RAPD标记揭示出这38...
摘要石远321是从海岛棉×野生色伯氏棉×陆地棉三元杂种后代中选育而成的种间杂交新品种。其细胞学鉴定结果、形态学基本特征以及栽培特性均为陆地棉型。但在丰产性、棉纤维品质及抗逆性等许多农艺性状和经济性状方面,该品种明显综合了多棉种多亲本的遗传特性。为了从分子水平上认识石远321的三元杂种性质及其变异水平,用等电聚焦电泳和RAPD技术,对石远321及其不同棉种亲本进行了遗传分析。主要结果如下:(1)酯酶...
用RAPD标记评估我国棉花品种遗传多样性
棉花 RAPD 遗传多样性 遗传相似性
2008/2/8
摘要利用RAPD标记对17个不同来源的我国棉花品种(系)进行遗传多样性评估。200个随机引物扩增出113条多态性片段。17个品种(系)依据染色体组的不同可以分为3大类。它们之间的遗传相似性系数从0.2000到0.8451。3个大面积推广品种鄂荆1号,中棉所12号和苏棉3号遗传基础十分相近。陆地棉与阔叶棉杂交产生的野生种质系7581,与其他陆地棉品种(系)遗传差异显著。不同育种单位在育种过程中种质使...
应用RAPD指纹探讨黄麻属种间遗传多样性及其亲缘关系
黄麻 RAPD 遗传多样性 聚类分析
2008/1/30
摘要采用RAPD标记构建了黄麻属（Corchorus）植物10个种27份材料的指纹图谱，从119个随机引物中筛选出清晰且多态性高的25个引物，共扩增出329条DNA片段，分子量在0.3～3.0 kb之间，其中294条谱带具有遗传多态性，多态比率（PPB）为89.36％，平均每个引物扩增出13.16条带。用Biol D++数据分析软件，计算Nei氏相似性系数，建立了UPCMA聚类图。结果表明：（1）...
大豆突变基因的遗传分析及窄叶突变基因的RAPD标记
大豆 突变基因 遗传分析 RAPD标记
2008/1/22
摘要宽叶、无4粒荚大豆品种鲁豆4号（代号LD4）经烷化剂EMS诱变处理选育出窄叶和4粒荚同时发生突变的稳定突变系E182。突变系与亲本杂交遗传分析表明，“宽叶与窄叶”和“无4粒荚与有4粒荚”2对性状均符合孟德尔单因子的31分离比率，说明窄叶和4粒荚突变性状均受单个隐性核基因控制。F2群体4种性状类型株数明显偏离2对独立基因的9331分离比率，表现连锁遗传，连锁交换值为11.24%±0.81%。对突...
RAPD和ISSR标记对水稻化感种质资源遗传多态性的分析
化感水稻 遗传多态性 RAPD ISSR
2008/1/21
摘要 运用RAPD和ISSR技术分析水稻化感种质资源的遗传多态性。从供试材料中筛选到具有多态性的RAPD引物12条，ISSR引物7条。RAPD引物共扩增到85条清晰的多态性条带，多态性条带比率为69.4%。ISSR引物共扩增到34条清晰的多态性条带，多态性条带比率为53.0%。对两种标记结果进行UPGMA聚类分析，结果极其类似，呈极显著的正相关(r=0.74 )。聚类结果表明，地理位置相近的品种聚...
用RAPD分子标志方法研究氧化亚铁硫杆菌遗传多样性Studies of Polymorphisms of Thiobacillus Ferrooxidans Using RAPD
氧化亚铁硫杆菌 RAPD 亲缘关系
2008/1/10
摘要
本文对采自7个不同环境的氧化亚铁硫杆菌进行了随机扩增多态性DNA（RAPD）分析，20个引物中筛选出扩增效果较好的4个引物，每个引物能产生1~9条DNA条带。通过4个引物的RAPD分析获得的平均相似性系数表明不同来源的菌之间的相关系数在44%~83%之间。
Abstract:Random amplified polymorphic DNA(RAPD) was used in analy...