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为了探讨我国绵羊痒螨兔亚种的遗传变异特征和种群结构，利用PCR技术对我国5个地理区域（华北、华东、华中、西南、西北）的83个绵羊痒螨兔亚种株的线粒体16S rRNA全序列进行扩增和遗传多样性分析。结果显示，83个样品的16S rRNA全序列长度均为1 025 bp，共存在83个变异位点和52个单倍型；样品所代表的5个地理区域种群间的Fst值为-0.037 59~0.587 63，基因流值为-6.9...
以羊圈空气微生物为研究对象，了解羊圈空气中细菌群落结构以及致病菌属特征。将来自10个不同羊场的羊圈空气样本，应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定羊圈空气中细菌的16S rRNAV3-V4变异区序列，分析不同空气样本细菌群落组成。结果显示：空气样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为33 408，涵盖了25门、66纲、123目、253科、547属、444种的细菌。通过微生物多...
Comparison of Fecal Microbiota of Mongolian and Thoroughbred Horses by High-throughput Sequencing of the V4 Region of the 16S rRNA Gene
Fecal Microbiota 16S rRNA Gene High-throughput Sequencing Mongolian Horses
2016/11/10
The hindgut of horses is an anaerobic fermentative chamber for a complex and dynamic microbial population, which plays a critical role in health and energy requirements. Research on the gut microbiota...
对光滑河蓝蛤Potamocorbula laevis，黑龙江河蓝蛤Potamocorbula amurensis，焦河蓝蛤Potamocorbula ustulata，红肉河蓝蛤Potamocorbularub romuscula 4个野生种共40个个体的线粒体COI 和16S rRNA基因片段进行了扩增和测序，经过筛选和剪切，得到长度为650 bp和450 bp的片段。序列分析显示，序列的碱基组...
丝瓜18S rRNA基因克隆及其作为内参基因的应用
丝瓜 18S rRNA 内参基因 实时荧光定量PCR
2017/12/4
选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析(qRT-PCR)准确性的重要条件。18S rRNA基因表达范围广、表达量恒定,常作为内参基因应用于实时荧光定量PCR中。为了获得丝瓜18S rRNA基因,并设计合适的荧光定量PCR内参引物,解决丝瓜实时荧光定量PCR 检测中无内参基因的现状,通过PCR和序列测定,首次克隆到了丝瓜的18S rRNA基因序列,其长度为1 862 bp,GenBank登录...
2012年初，山东菏泽某羊场的羊群发病，从发病羊器官分离到2株病原细菌。对病原细菌进行鉴定，并对其与已知同种异源菌株相似性差异进行分析。从患病山羊内脏器官分离细菌，经形态特征、培养特性、生化试验、血清学试验及致病性试验进行鉴定；再通过设计通用引物扩增16S-23S rRNA ISR (intergenic spacer region)序列，将PCR产物经HinfⅠ单酶切获得3条可视条带，同时对扩增...
分析河南、陕西分离的14株鸡杆菌（Gallibacterium）之间的进化关系，及gyrB基因序列比较在该菌进化分析中的作用。PCR扩增鸡杆菌分离株的gyrB、16S rRNA和rpoB 3个看家基因，PCR产物纯化后直接测序。将鸡杆菌分离株、国外参考株的3个看家基因序列进行比较分析，用Phylip 3.67软件构建进化树。结果表明，14株鸡杆菌与鸭源鸡杆菌 （Gallibacterium ana...
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析，在18S rRNA 3′端和28S rRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物，以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS15.8S rRNAITS2序列，其大小为1 178 bp，其中ITS1序列长度为423 bp，5.8S rRNA为155 bp，ITS2为600...
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析，在18S rRNA 3′端和28S rRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物，以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列，其大小为1 178 bp，其中ITS1序列长度为423 bp，5.8S rRNA为155 bp，ITS2为600...
作者拟探讨禽源支原体对替米考星耐药的分子机制。体外诱导得到鸡毒支原体（R株、PG31株和S6株）、鸡滑液支原体、衣阿华支原体的替米考星耐药株；PCR扩增原始敏感株和诱导耐药株的23S rRNA基因V域，测序分析耐药相关碱基突变情况。结果鸡毒支原体R株、PG31株、S6株、鸡滑液支原体、衣阿华支原体分别通过9代、8代、6代、14代、9代诱导获得替米考星耐药（≥128 μg·mL-1）株；3种禽源支原...
多浆旱生植物霸王18S rRNA基因的克隆及序列分析
霸王 18S rRNA 基因 克隆 序列分析
2013/8/2
为探讨多浆旱生植物霸王(Zygophyllum xanthoxylum)的生物进化历程及与其他植物的亲缘关系，本研究以霸王叶基因组DNA为模板，使用通用引物扩增其18S rRNA 基因片段，并克隆到pGEMT载体，阳性克隆经鉴定后进行测序。核苷酸序列分析结果表明，该片段长1 808 bp，所得序列与GenBank中注册的18S rRNA基因序列的同源性均在96%以上。可见，高等植物18S rRN...
病犬大肠杆菌16S rRNA甲基化酶基因检测研究
病犬大肠杆菌 16S rRNA 甲基化酶 基因检测研究
2011/8/31
为了解郑州市发病犬大肠杆菌对氨基糖苷类药物高度耐药的16S rRNA甲基化酶流行情况，本研究测定了分离自河南郑州市宠物医院发病犬的123株大肠杆菌对氨基糖苷类代表药物阿米卡星的敏感性；分别设计6种16S rRNA甲基化酶基因特异性引物，对耐药分离株进行16S rRNA甲基化酶基因PCR扩增检测。检测结果显示，在发病犬大肠杆菌中仅检测到armA和rmtB，其检出率分别为3.25%（4/123）和38...
甘薯和巴西牵牛18S rRNA基因的克隆和序列分析
甘薯 巴西牵牛18S rRNA基因 克隆序列分析
2011/9/7
为甘薯和侵染甘薯病毒的基因表达研究提供内参基因序列信息。【方法】分别以‘商薯19’、‘北京553’两甘薯品种和巴西牵牛的基因组DNA为模板，利用PCR方法克隆甘薯和巴西牵牛18S rRNA基因序列。【结果】测序结果表明，获得的供试两甘薯品种和巴西牵牛的18S rRNA基因序列长度均为1630 bp；序列比对结果表明，甘薯和巴西牵牛与裂叶牵牛、烟草等双子叶植物的18S rRNA基因相应序列的一致性均...
牛无浆体16S rRNA基因的克隆测序及分析
牛无浆体 16S rRNA PCR 序列分析
2013/12/5
从自然感染无浆体的重庆黄牛无菌采集血液，提取全血基因组，用血营养菌16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增，得到长约1 500 bp的扩增片段，将其克隆到pMD18-T载体后进行测序，并与5条边缘无浆体、4条中央无浆体、4条牛无浆体、4条羊无浆体和3条嗜吞噬细胞无浆体16S rRNA基因序列进行系统发育分析。结果表明所克隆的基因片段长度为1 412 bp，GenBank登录号为FJ169957...
利用18S rRNA基因部分序列研究大豆种质资源的进化关系
野生大豆 栽培大豆 拟南芥 18S rRNA基因
2015/9/28
利用模式植物拟南芥的18S rRNA基因序列设计的引物，对3个野生大豆和3个栽培大豆的18S rRNA基因进行扩增，利用其序列特征研究大豆的进化关系。 结果3个野生大豆和3个栽培大豆均扩增得到1 000 bp左右的基因片段；野生大豆之间的同源性均为99%，而栽培大豆之间的同源性较低，相似性在97%~98%之间；通过18S rRNA基因序列研究不同豆科作物的进化关系，发现大豆的系统发育树分枝处于靠近...