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基于PCR-DGGE和拟杆菌(Bacteroides)16S rRNA的岩溶地下水粪便污染来源示踪研究:以重庆南山老龙洞地下河系统为例
岩溶地下水 粪便污染 大肠菌群 拟杆菌 PCR-DGGE
2016/12/7
岩溶地下水的微生物污染日益严重,其来源的研究得到国际学术界的广泛关注.本研究以重庆南山老龙洞岩溶地下河系统为对象,采用滤膜法监测地下水中的总细菌、大肠杆菌、粪大肠菌及粪链球菌等微生物指标,以拟杆菌(Bacteriodes)为指示细菌,采用PCR-DGGE示踪地下水中大肠杆菌/粪大肠杆菌的来源.结果表明,老龙洞地下河流域各类细菌含量严重超标,总细菌数为10~2.9×107CFU·mL-1,大肠菌群总...
应用PCR-DGGE对巴氏消毒乳中腐败细菌的污染溯源研究
PCR-DGGE 巴氏杀菌乳 腐败微生物 污染溯源
2016/6/29
运用PCR-DGGE技术分析了巴氏杀菌乳从原料乳到杀菌、灌装这两个加工关键控制点的微生物动态变化和差异性,容易发生污染的环节是挤乳环节、杀菌后的加工管道和包装环节。原料乳中易携带的细菌是乳酸链球菌(Lactococcus lactis subsp.)和乳酸杆菌(Lactobacillus sp.);挤乳环节中易受无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)污染;杀菌后的加工管道易...
利用变性梯度凝肢电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术,对混菌发酵及藏过程中马克斯
克鲁维酵母与乳酸菌之间的相互作用进行分析,进而对整个过程中微生物优势菌群及其稳定性进行跟踪监测。结果
表明:混菌发酵及贮藏过程中微生物组成比较稳定,优势菌为嗜热链球菌 (Streptococcus thermophilus , 60) ;发酵过程中,...
利用变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术,对混菌发酵及贮藏过程中马克斯克鲁维酵母与乳酸菌之间的相互作用进行分析,进而对整个过程中微生物优势菌群及其稳定性进行跟踪监测。结果表明:混菌发酵及贮藏过程中微生物组成比较稳定,优势菌为嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus,ST);发酵过程中,马克斯克鲁维酵...
天山北坡绵羊面部湿疹高发草场病原真菌分离及PCR-DGGE分析
面部湿疹 真菌 PCR-DEEG
2014/12/25
旨在探讨天山北坡放牧绵羊面部湿疹发病区草场真菌的种类及多样性,查明疾病发生与放牧地理位置、真菌群落分布的相关性。调查发病地区的地理环境特征,采集发病季节绵羊面部湿疹发病区域和非发病区域牧草和土壤样本,进行真菌分离培养,形态学观察,真菌种类及分布统计分析;提取真菌总DNA,利用18S rDNA的变性梯度凝胶电泳(DGGE)和测序技术,进行真菌多样性分析。结果显示发病地区地理位置为N44.016~44...
本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性。试验采用羧甲基纤维素(CMC)培养基、蛋白胨纤维素(PCS)培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析(PCA)几种方法分析瘤胃菌群多样性。结果表明:37℃条件下,不同培养基...
采用Biolog和PCR-DGGE技术对椒江口6个站位表层沉积物群落水平的微生物代谢功能和以16S rRNA基因标记的细菌遗传多样性进行分析,并对其代谢功能和群落结构与沉积物污染物等参数进行冗余梯度分析(Redundancy gradient analysis,RDA)和典范对应分析(Canonical correspondence analysis,CCA).Biolog分析结果表明,微生物群落...
以1日龄纯系的优质肉鸡A系(♂,A组)和惠阳胡须鸡(♂,B组)为实验动物,研究比较两纯系鸡1~28日龄胃肠道黏膜细菌微生物丛组成与动态变化特点。采用l6S rDNAV3 PCRDGGE的方法,分析第1、3、7、14、21、28日龄2组鸡胃肠道黏膜细菌基因组DNA。DGGE图谱中显示,28日龄2组鸡回肠泳道的条带数差异明显,嗉囊、腺胃及盲肠黏膜菌群结构的相似性均大于70%,十二指肠与空肠的相似性分...
以采集自中国杭州和菲律宾的稻虱缨小蜂Anagrus nilaparvatae为研究对象, 采用巢式PCR扩增Wolbachia的16S rDNA和wsp基因片段, 并用DGGE分析稻虱缨小蜂体内Wolbachia的多样性。基于16S rDNA基因的分析结果准确地检测到稻虱缨小蜂体内细菌主要是Acinetobacter sp., Methylophilus sp., Acidovorax sp., ...
微生物制剂对养殖池塘细菌群落影响的PCR-DGGE分析
微生物制剂 细菌群落 水体 沉积物
2013/1/15
为了解微生物制剂在水产养殖环境修复中的作用机制,采用聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳(PCR DGGE)方法,研究不同微生物制剂对养殖池塘上覆水和沉积物中细菌群落的影响。结果显示,施用微生物制剂前后,试验塘上覆水样品中细菌的DGGE优势条带无明显变化,细菌群落组成没有明显差异,提示微生物制剂对试验塘上覆水中的细菌群落组成影响很小。相对而言,施用过微生物制剂的池塘相对于对照池塘其细菌群落结构发生的变...
PCR-DGGE技术解析A2/O工艺好氧单元中微生物群落结构
PCR-DGGE 活性污泥系统 微生物群落结构 优势菌
2012/6/19
GE方法,追踪了汉沽工业废水处理中好氧工艺的活性污泥系统中微生物群落结构动态变化过程及其微生物群落结构组成。研究结果表明:系统中的微生物群落结构随水质变化而变化,随着培养时间的延长,微生物群落结构趋于稳定,分别属于5大类群,与γ、δ、α、ε变形杆菌(Proteobacterias)、芽孢杆菌(Bacilli)的亲缘关系较近。其中γ变形杆菌是该废水处理过程中的主要菌群,包括Pseudomonas s...
PCR-DGGE技术用于处理苯乙烯废气的生物滴滤塔中微生物优势菌种解析
恶臭废气 苯乙烯 PCR-DGGE 微生物
2012/6/20
采用生物滴滤塔能够有效去除含苯乙烯恶臭气体,塔内微生物中含有大量的球菌和杆状菌。采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究处理苯乙烯恶臭气体的生物滴滤塔填料表面的微生物,结果表明,去除苯乙烯生物滴滤塔中有5种菌为降解苯乙烯的优势菌种;通过16S rDNA基因扩增测序同源性比对,结果显示嗜甲基杆菌属(methylophilus)丰度为50.5%,2种变形菌属(alpha pro...
患病与健康虾夷马粪海胆(Strongylocentrotus intermedius)体腔液菌群的PCR-DGGE分析比较
虾夷马粪海胆 体腔液 16S rDNA PCR-DGGE 疾病
2012/2/16
分析比较患病与健康虾夷马粪海胆体腔液菌群的PCR-DGGE指纹图谱,并通过切胶、克隆测序等步骤分析患病虾夷马粪海胆体腔液中的特异菌群。结果显示,健康海胆体腔液中菌群的PCR-DGGE指纹图谱具7个条带,其中有5个与患病海胆相同,2个为不同条带,表明健康海胆体腔液中至少含7种细菌,其中2种以上细菌随机体环境变化而消亡;患病海胆具11个条带,其中包括6条特异条带并分别对应单一细菌,包括1个鞘氨醇单胞菌...
浸矿体系中的菌群结构及其演替规律与浸出率具有密切的关系,为了解硫化镍矿浸矿体系中的这种关系以提高浸出率,利用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术结合16S rRNA基因序列对体系的细菌种群结构进行分析.研究表明,在硫化镍矿浸矿体系中,菌群组成菌属为嗜酸氧化亚铁硫杆菌属(Acidithiobacillus),并在浸矿体系中具有明显的演替现象,浸矿体系中的菌株演替和浸出率具有明显的相关性,经过21...
Inactivation of food spoilage bacteria by high pressure processing: Evaluation with conventional media and PCR–DGGE analysis
High pressure processing RNA extraction DGGE Active species Sliced cooked ham
2012/8/14
Microbial diversity and dynamic changes of sliced vacuum-packed cooked ham during refrigerated storage (0–90 days) after high pressure processing (400 MPa at 22 _C for 10 min) was investigated by usin...