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中国科学院大连化物所等发展出基于机器学习的苦味肽筛选新方法（图）
肽筛选新 细胞膜 蛋白质
2023/10/26
2023年10月8日，中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台研究员靳艳团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作，发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法。科研人员利用该方法在超高温处理（Ultra High Temperature treated，UHT）牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦味肽。
中国科学院大连化学物理研究所发展一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法（图）
机器学习 苦味肽筛选 蛋白质降解
2023/10/29
2023年9月18日，中国科学院大连化学物理研究所能源技术研究平台（DNL20）靳艳研究员团队与大连工业大学、内蒙古伊利实业集团有限公司合作，发展了一种基于机器学习的苦味肽筛选新方法，利用该方法从超高温处理（Ultra High Temperature treated, UHT）牛奶中筛选并验证了导致UHT牛奶发苦的苦味肽。
本发明为一种基于固载的混合蛋白质为筛选库的蛋白酶底物筛选方法。具体地说，是将混合蛋白质通过化学作用键合到固相载体上作为筛选库，将该蛋白库与蛋白酶孵育，蛋白库中蛋白酶的底物蛋白被酶切后所产生的肽段进入溶液，非底物蛋白不能被酶切而完整的保留在固相载体上，固液分离后，采用生物质谱进行溶液中底物肽段的定性定量鉴定，从而得到特异性蛋白酶的底物蛋白信息。本发明是利用蛋白酶与其底物的高度特异性作用，以及固液分离...
中国科学院上海有机化学研究所专利：筛选和表征具有相分离能力蛋白的方法
中国科学院上海有机化学研究所 专利 筛选 表征 相分离 能力蛋白
2023/5/26
中国科学院上海有机化学研究所专利：筛选和表征具有相分离能力蛋白的方法
2022年11月15日，中国科学院深圳先进技术研究院司同课题组在国际学术期刊ACS Synthetic Biology发表研究论文“Robotic Construction and Screening of Lanthipeptide Variant Libraries in Escherichia coli”。作者依托深圳合成生物研究重大科技基础设施（简称“大设施”），开发了羊毛硫肽（lanth...
高通量虚拟筛选CDK2/Cyclin A2靶点抑制剂
CDK2/CyclinA2 分子模拟 高通量虚拟筛选 抑制剂 自由能分解
2022/3/22
CDK2/CyclinA2复合蛋白的异常表达与乳腺癌、口腔癌、食管鳞状细胞癌的发生密切相关.CDK2/CyclinA2复合蛋白的活性位点不同于CDK2单体.至今临床上尚无靶向此复合蛋白的药物分子.针对CDK2/CyclinA2复合蛋白,以实验报道的10个抑制剂分子构建药效团模型,通过药物体外药代动力学（ADME）、Docking、聚类分析、毒性预测,从DrugBank,ChEMBL和TCM@Tai...
微米大小的细胞为了储存遗传信息，其遗传物质在细胞核内被紧密地包装和折叠。研究发现基因组的结构是有序的，至少有三个逐级复杂的维度。其中，三维结构是染色质的高级结构，该结构由特殊的结构蛋白质所介导（比如：Cohesin，CTCF等），这些结构蛋白将30 nm的染色质纤维折叠成具有“染色质环”的高级结构。“染色质环”不仅有利于精确地保存遗传信息，而且可以介导远距离染色质内和染色质间的相互作用，能将调控元...
目前，由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的COVID-19迅速发展成为全球性流行性疾病。尽管疫情暴发至今已有2月余，市面上仍然缺乏用于特异性预防和治疗COVID-19的药物。阻断性单克隆抗体具有极高的抗原特异性，是中和病毒感染的首选方案之一【1,2】。因此，制备能够特异性阻断SARS-CoV-2病毒进入宿主细胞的单克隆抗体，可高效地预防和治疗COVID-19。最新研究表明，与SARS-CoV相...
应用同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术筛选血清差异蛋白，为临床个性化治疗和判断疾病的预后提供参考依据。方法：选取确诊为局部晚期和晚期食管鳞癌患者52 例，进行常规放疗和化疗，观察疗效并随访，随访时间截止至2018年04月。根据不同生存期进行分组，应用iTRAQ技术筛选与食管癌患者生存期长短有关系的血清差异蛋白。观察这些差异蛋白的生物学特点，利用KEGG数据库将与肿瘤生存相关的优势蛋白筛选出...
近日，北京理工大学生命学院屈锋教授在生物技术领域顶级期刊《Biotechnology Advances》（IF="12.83）上发表毛细管电泳（CE）筛选核酸适配体（Aptamer）的综述论文“Evolution" of multi-functional capillary electrophoresis for high-efficiency selection of aptamers”。屈锋教...
本项目研究了七种抑制剂（分别为亚硫酸钠、明矾、O-异抗坏血酸、EDTA-2Na、CaCl2、多聚磷酸钠、柠檬酸亚锡二钠）对橄榄多酚氧化酶和过氧化物酶活力的影响,并采用两段模型分析了高温处理对橄榄果实多酚氧化酶(PPO)和过氧化物酶(POD)的钝化动力学。结果表明，橄榄中酚类化合物氧化分解与POD和PPO活性有关，在特定的环境条件下，O-异抗坏血酸和柠檬酸亚锡二钠抑制橄榄PPO酶和POD酶活性效果最...
上海交通大学团队在酶定向进化的超高通量筛选领域获进展（图）
上海交通大学 酶 定向进化 超高通量筛选
2018/3/20
近日，Nature Communications在线刊登了上海交通大学生命科学技术学院冯雁教授团队在酶超高通量筛选方面的最新研究进展“Efficient molecular evolution to generate enantioselective enzymes using a dual-channel microfluidic droplet screening platform”。杨广宇研...
中国科学院武汉植物园“一种快速筛选天然产物中拓扑异构酶I抑制剂的方法”获国家发明专利授权
中国科学院武汉植物园 天然产物 拓扑异构酶I抑制剂 国家发明专利授权 靶向药物 必需酶 原核 真核生物
2017/3/21
2017年3月20日，从国家知识产权局获悉中国科学院武汉植物园的发明专利“一种快速筛选天然产物中拓扑异构酶I抑制剂的方法”（ZL 201610249760.5）获国家发明专利授权。发明人：郭明全、陈桂林、田永强、张春云。DNA 拓扑异构酶I，是广泛存在于原核和真核生物体内的一种必需酶，其催化部位的酪氨酰残基攻击 DNA 单链，使得酶与DNA 3'-磷酸二脂键形成共价连接，造成 DNA 单链的断裂，...
一种鱼胶原蛋白抗衰老用量的筛选方法，包括如下步骤：取25~30g的健康雄性小鼠，皮下注射D?半乳糖；将小鼠灌胃给予不同剂量的分子量为1?3kDa的鱼胶原蛋白肽；8周后，测定小鼠的皮肤水分含量，且将小鼠摘眼球取血，留取血清，测定MDA含量、SOD、CAT和GSH?Px活性。上述鱼胶原蛋白抗衰老用量的筛选方法，通过往小鼠灌胃鱼胶原蛋白肽，饲养一段时间后，通过研究小鼠皮肤的水分及血清中的MDA含量、SO...
近日，分析化学领域的著名杂志Analytical Chemistry在线刊登了上海交通大学生命科学技术学院冯雁教授团队在酶超高通量筛选体系构建方面的突破性进展“Substrate Engineering Enabling Fluorescence Droplet Entrapment for IVC-FACS Based Ultrahigh-Throughput Screening”（DOI: 1...