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单细胞RNA测序(scRNA-seq)是鉴定样本中单个细胞转录组的主流方法。为了确保人们在实验过程中使用最佳方法,由西班牙国家基因组分析中心(CNAG-CRG)领导的国际研究团队对13种单细胞RNA测序方法开展了性能评估。他们于本周一将结果发表在《Nature Biotechnology》杂志上。
每一个点都是一个单独的 RNA 分子,由其与其它 RNA 的接近程度来定位。这种成像方法被称为 DNA 显微镜,因为它使用了 DNA 测序。
浙江大学贾俊岭实验室在Genome Biology报道新型单细胞RNA测序技术Holo-Seq揭示潜在肝癌肿瘤动力学模型(图)
浙江大学 贾俊岭 Genome Biology 单细胞RNA测序技术 Holo-Seq 潜在肝癌 肿瘤动力学模型
2018/10/22
2018年10月17日,浙江大学生命科学研究院贾俊岭团队和浙江大学第一附属医院郑敏团队在基因组学权威期刊Genome Biology杂志合作发表题为“Holo-Seq: single-cell Sequencing of holo-transcriptome”的文章。 基于单细胞cDNA扩增的单细胞RNA-Seq技术已经成为研究细胞异质性非常有力的手段,并且推动了许多发育生物学和癌症生物学的重要进...
中国科学院上海生命科学研究院通过单细胞RNA测序对躯体感觉神经元重新分类
中国科学院上海生命科学研究院 单细胞 神经元
2015/12/31
2015年12月22日的Cell Research 杂志在线报道,中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所张旭研究组研究发现,通过高覆盖的单细胞测序和以神经元大小为参考的层次聚类,可对小鼠背根神经节初级感觉神经元进行分类,又通过全细胞膜片钳在体记录结合单细胞PCR方法可检测各类初级感觉神经元对外周皮肤刺激的反应。该工作首次通过高覆盖的单细胞测序对初级感觉神经元进行了重新分类,并且建立了基因表达与...