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2020年3月20日，国际期刊Proceedings of the National Academy of Sciences（PNAS）在线发表了中国科学院生物物理研究所柯莎（Sarah Perrett）研究组题为“Kinetics of the conformational cycle of Hsp70 reveals the importance of the dynamic and hete...
中国科学院生物物理研究所卫涛涛、李明等应用单分子技术解析促凋亡蛋白tBid引发膜通透的动力学过程（图）
中国科学院生物物理研究所 卫涛涛 李明 应用单分子技术 促凋亡蛋白tBid 膜通透 动力学过程
2019/10/22
2019年10月9日，国际学术期刊《Nano Letters》发表了中国科学院生物物理研究所卫涛涛课题组与中国科学院物理研究所李明课题组题为“Detection of tBid Oligomerization and Membrane Permeabilization by Graphene-Based Single-Molecule Surface-Induced Fluorescence At...
2018年1月22日，美国化学会权威期刊Journal of the American Chemical Society(JACS)在线发表了中国科学院生物物理研究所柯莎(Sarah Perrett)研究组题为“Direct Observation of Oligomerization by Single Molecule Fluorescence Reveals a Multistep Aggr...
2017染色体动力学戈登学术会议（The 2017 Gordon Research Conference on Chromosome Dynamics）
2017 染色体动力学戈登 学术会议
2017/2/14
Chromosomes provide the blueprint for all life. Because of its fundamental importance, chromosome biology is currently investigated by a large and diverse set of researchers using many different organ...
自振荡凝胶的动力学模型及可控性分析
智能凝胶 BZ反应 非线性振荡 周期性调控
2014/2/28
自振荡凝胶是一类在Belousov-Zhabotinsky化学反应（BZ反应）驱动下能够产生周期性收缩和膨胀大变形的智能软材料，简称为BZ凝胶，在微型激励器、传感器、药物释放、仿生材料等领域有着广泛的应用前景。基于BZ化学反应的Oregonator模型以及凝胶变形的力平衡方程，建立了由二阶微分方程表示的BZ凝胶的简化动力学模型，并通过对BZ凝胶的振荡动力学模型的分析，发现其在动力学相轨迹空间内呈现...
镱对大鼠海马神经元钠电流及其动力学的影响
海马神经元 钠通道 镱离子 膜片钳技术
2014/2/17
利用全细胞膜片钳技术，研究稀土镱离子对大鼠海马神经元电压门控性钠电流及其动力学的影响. 膜片钳记录到的钠电流经过滤波过滤后储存于计算机中. 结果发现，稀土镱离子对海马神经元钠电流的增大效应具有剂量依赖性和电压依赖性. 100 mmol/LYb3+使电压门控性钠电流的最大电流值由2154±163 pA增大到2807±60 pA，电流幅度增加了30.3%，这与镱抑制钾电流作用完全不同. 镱作用钠电流的...
分子动力学模拟与分子生物力学
分子动力学模拟 分子生物力学 微观结构动力学 结构-功能关系
2012/3/15
生物大分子的微观结构动力学决定其生物学功能,其力学-化学耦合规律是分子生物力学的重点关注方向。分子动力学模拟是耦合生物大分子力学-化学性质微观结构动力学基础的有效手段,其结果可用于预测结构-功能关系、指导实验设计和诠释实验结果。本文简要介绍了分子动力学模拟的方法学特点、基本工作原理及其在分子生物力学中的应用,并展望了未来可能的发展方向和应用前景。
p53-Mdm2相互作用在DNA损伤的细胞响应方面起着非常重要的作用。最新实验结果表明，在受到各种辐射损伤而引起DNA损伤后，细胞中的p53蛋白浓度在单体细胞和群体细胞情况下，表现为非衰减振荡和衰减振荡两种不同的动力学行为。通过研究p53 -Mdm2负反馈回路的非线性动力学，分析了各种（特别是DNA损伤，p53和Mdm2浓度三者之间的）动力学关系，提出了一个能同时描述这两种不同动力学行为的非线性模...
应用时间分辨荧光光谱技术，研究了高等植物光系统II(PSII)核心复合物中能量传递超快动力学。对实验测得的荧光衰减曲线，进行数据处理．解得荧光衰减的3个时间常数分别为3．9，20．4，930．5 ps，各蛆分荧光占总荧光的百分比分别为1_0% ，12．7% ，86．3% 。对由全局分析得到的荧光强度随波长变化曲线运用高斯多峰解叠运算．解得3个峰值波长分别为671．03．684．74．696．16 ...
p53蛋白质Gly249和Ser249替换型三维结构的分子动力学研究
p53蛋白质 分子动力学 R249残基替换
2008/10/16
利用p53蛋白质核心区晶体结构作分子动力学发现，除了生化方面的稳定性之外，该区还具有分子力学上的高度稳定性.在此基础上作的R249残基替换分子动力学研究显示，p53蛋白质核心区249位点精氨酸被其他残基替换后能引起p53蛋白质核心区L2、L3结构域间的密切联系趋于松散，正常的空间构象发生改变并使整个核心区结构稳定性受到破坏.这一研究从三维结构变化上，直观地解释了R249残基替换造成的p53...
人眼房水动力学系统的建模与仿真方法研究
房水流动(Aqueous humor flow) 动力学模型(Mathematic model) 眼压(Intraocular pressure) 数字仿真(Digital simulation)
2008/5/19
为从宏观上应用工程方法进一步研究房水运行机理，提出了人眼前节房水流动系统的动力学仿真模型。依据目前眼科界较为公认的房水运行和眼压反馈机制建立系统构架，基于对眼科解剖学与生理学相关理论的分析、流体力学基本原理和临床参数进行系统辨识与参数确定。运用数字仿真的方法分别在正常生理平稳状况和激发试验状况下对模型进行了仿真运行，获得了和临床结论较为一致的结果。能较好地模拟房水运行机制，在与临床可测量参数一...
心肌单细胞兴奋模式转迁的非线性动力学机理
Morris-Lecar模型(Morris-Lecar model) 分岔(Bifurcation) 延迟后去极化电位(Delayed after-depolarization) 早后去极化电位(Early after-depolarization) 随机因素(Stochastic fluctuation)
2008/5/15
利用Morris-Lecar模型研究实验观察到的培养心肌单细胞自发性兴奋模式转迁规律的动力学机理，确定性模型仿真，揭示了心肌单细胞随参数由“极化”静息经规则节律到“去极化”静息的节律变化规律。随机因素扰动下的模型仿真发现在分岔序列中的分岔点附近会出现含延迟后去极化电位、早后去极化电位的节律模式，其中，延迟后去极化节律产生于从“极化”静息到规则节律的分岔点附近，而早后去极化节律产生于从规则节律到“去...
心肌细胞团搏动整数倍节律的非线性动力学机制
非线性动力学 整数倍节律 心肌细胞团
2008/5/14
本文利用心肌细胞耦合模型研究实验观察到的心肌整数倍节律的动力学机理。确定性模型仿真揭示了心肌细胞团同步搏动加周期分岔的节律变化规律；随机模型仿真发现在加周期分岔序列中分岔点附近会出现整数倍节律，其中，0-1整数倍节律产生于从静息到周期1的Hopf分岔点附近，1-2整数倍节律产生于周期1和周期2极限环间的加周期分岔点附近；对系统相空间轨道的分析进一步揭示出整数倍节律由系统运动在相邻的两个轨道之间随机...
压强温度耦合作用下小蛋白去折叠过程的分子动力学模拟
分子动力学 去折叠 小蛋白 温度耦合
2008/5/14
在不同温度（280~540K）和压强（1×102~8×105 kPa）的耦合作用下，对GB1（the B1 domain of protein G）进行了56次独立分子动力学模拟，模拟时间达88.8 ns。在此基础上，研究了压强和温度对GB1去折叠过程的耦合效应。结果表明，压强对温度去折叠过程有明显影响，改变了蛋白质二级结构去折叠速度和蛋白质去折叠过程发生事件的先后次序。相同温度下，GB1的α-螺...
基于蛋白质-DNA复合物晶体结构的DNA结构动力学特性研究
蛋白质—DNA复合物(Protein-DNA complex) 晶体结构(Crystal structure) 力常数(Force constant) DNA 动力学结构(Dynamic Structure)
2008/3/7
依据最新NDB数据库中蛋白质-DNA复合物晶体结构数据， 考虑DNA结构的序列依赖特性，对10个二联体和36个约化的四联体计算了DNA动力学结构模型中的关键参数——力常数矩阵，矩阵中的非对角项反映了结构参数间的关联。利用改进的DNA结构动力学模型，可以方便地计算给定序列的结构动力学特性。Study on DNA Dynamic Structural Feature Based on DNA...