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三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性
三疣梭子蟹 线粒体基因组 SNP 高分辨率熔解曲线
2019/1/21
为获得三疣梭子蟹线粒体全基因组（mtDNA）SNP突变位点，本研究针对其mtDNA全序列设计了179对引物，采用高分辨率熔解曲线（HRM）检测技术对SNP进行了筛查。在179对引物中，有89对引物具有特异性扩增结果；进一步研究表明，89对引物中共有22对引物的扩增区域含有SNP突变位点，共包含24个SNPs。统计结果显示，三疣梭子蟹线粒体基因组中的SNP分布频率为0.15/100 bp，其中转换突...
基于单核苷酸多态性的基因互作分析方法学进展
SNP/基因互作 模型依赖 数据挖掘算法 下游功能学分析
2014/2/6
基于单核苷酸多态性的关联分析已成为当前解析人类常见复杂疾病遗传机制的重要手段之一, 然而, 目前普遍使用的单位点分析策略仅能发现部分单独效应显著的易感SNP位点, 因此遗漏了重要的遗传力组分——基因上位效应或联合效应。识别全基因组多基因间复杂的互作关系已成为全面解析复杂疾病致病分子机制必不可少的一项任务。已有很多方法被应用于全基因组交互作用分析, 加深了人类对复杂疾病遗传机制的进一步认识。基于各类...
湖羊、东湖杂种羊POMC基因外显子3单核苷酸多态性及其与生长性状的关联分析
阿黑皮素原 PCR-RFLP 绵羊 生长性状
2013/10/30
阿黑皮素原(Pro-opiomelanocortin, POMC)在动物采食和能量平衡调控中发挥重要作用, 文章对绵羊POMC基因外显子3进行扩增和测序, 筛选多态性位点, 并分析多态位点与湖羊和东弗里生×湖羊杂种羊生长性状的相关性。测序后发现湖羊POMC基因外显子3有2个单碱基突变(g.273 T/C和g.456 G/A), 根据273位点处发生的T/C突变, 建立PCR-RFLP分析方法, 并...
EGLN1基因6个单核苷酸多态性与高海拔低氧适应的相关性
高海拔低氧适应 脯氨酰羟化酶 单核苷酸多态性 单倍型
2013/10/30
为了研究脯氨酰羟化酶2 (EGLN1或PHD2)基因5′UTR区和内含子区的单核苷酸多态性(SNP)与高海拔低氧适应的相关性, 文章使用Sequenom MassArray基因分型系统对152例西藏藏族(海拔3 650 m)和192例湖北汉族(海拔500 m) EGLN1基因的6个单核苷酸多态性位点(rs2066140、rs2808584、rs2491405、rs2486741、rs2486734...
鸡Myostatin基因单核苷酸多态性的群体遗传学分析
鸡 Myostatin基因 单核苷酸多态性
2008/1/29
摘要肌肉生长抑制素是控制骨骼肌生长发育的重要细胞因子,采用PCR-SSCP和测序的方法发现了5个位于Myostatin基因5'-和3'-调控区的单核苷酸多态性位点,对北京油鸡、白耳鸡、石歧杂、矮小黄鸡、小型黄鸡、惠阳胡须鸡、隐性白羽鸡、海兰、AA鸡等不同鸡种的该单核苷酸多态性分析结果表明:Myostatin基因的5'调控区引物P60/P61扩增片段多态性是由3个核苷酸的改变而产生的[分别是G→A(...
摘要以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭, 山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料, 根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物, 用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析。结果发现引物4扩增片段上共存有7个单碱基突变, 第430、457、523处的G-A 、A-G、T-C单碱基突变导致第144、153、175个氨基酸分别由丙氨酸（A）变为苏...
摘要 报道了内皮素Ａ型受体反义寡聚核苷酸（ＯＤＮｓ）对大鼠血管平滑肌细胞（ＶＳＭＣ）增殖及内皮素受体基因表达的影响．~３Ｈ－ＴｄＲ参入结果显示，内皮素Ａ型受体反义ＯＤＮｓ处理细胞可显著抑制内皮素诱导的ＶＳＭＣ的ＤＮＡ合成，反转录－ＰＣＲ及受体结合实验结果表明，ＯＤＮｓ的上述作用与降低ＶＳＭＣ内皮素Ａ型受体基因表达活性有关．
期刊信息
篇名
Strand compositional asymmetries of nuclear DNA in eukaryotes(真核生物细胞核DNA双链核苷酸组成的不对称性)
语种
英文
撰写或编译
撰写
作者
牛登科,林魁,张大勇
第一作者单位
北京师范大学生命科学学院
刊物名称
Journal of Molecular Evolution
页面
325-334
出版日期
2003年...