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植物所科研人员开发了基因组组装质量评估和改进的新方法(图)
基因 质量评估 光学图谱
2023/11/10
2023年来,随着测序技术和算法的开发,大量动植物基因组被陆续测序和组装,但是基因组组装质量参差不齐,存在不同程度的组装错误,影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法,然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值,没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
2022年11月14日,中国科学院上海光学精密机械研究所高功率激光单元技术实验室研究团队提出的玻璃结构基因模拟法 (GSgM) 可实现在有限数据下对玻璃性质及玻璃成分的准确模拟及设计,相关成果以“Genome-based approach to new Nd: Phosphate glass: Composition-structure-property statistical modeling ...
上海大学理学院物理系量子分子结构国际中心和材料基因组工程研究院与莱斯大学合作的科研成果在Science上发表(图)
上海大学理学院物理系 量子分子结构 材料基因组工程 莱斯大学 科研成果
2018/9/5
上海大学曹世勋教授团队与美国Rice大学Kono教授团队等国际同行在matter-matter系统中发现了第一个Dicke协同作用的实例,这一发现将有助于增进对磁现象的理解。曹世勋教授和Kono教授为共同通信作者,该研究成果以 “Observation of Dicke Cooperativity in Magnetic Interactions”为题今天在国际著名顶级期刊Science发表。该成...
三种不同光谱学方法测定转基因抗虫棉组织营养元素含量
转基因抗虫棉 光谱学方法 营养元素
2010/2/2
采用火焰原子吸收、火焰原子发射光谱法及分光光度法分析了三种不同转基因抗虫棉在不同生育时期不同组织内的11种营养元素含量的变化。结果表明,与非转基因对照比较,转基因抗虫棉植株体的营养化学组成发生了一定程度的改变,这种改变与转基因抗虫棉的品种、部位及生育时期相关。转基因抗虫棉全N含量的变化最为显著,其中转Bt抗虫棉Z30增幅最高达21%,这可能与外源基因导入及杀虫蛋白的表达有关。Mg, Na和Cu含量...
转金属硫蛋白(MT)基因植物具有清除重金属污染的能力,但是金属离子在植物体内的分布研究较少。文章以多代培育纯合的转MT烟草为材料,研究了转MT基因烟草积累铅和锌以及铅和锌在不同器官的分布情况。结果表明转基因植株的老叶、茎部和根部铅和锌积累量显著高于普通烟草植株,整株的铅和锌含量分别提高了21.8%和27.2%。铅和锌在植物体内的分布也发生了变化,转基因植株老叶和根中的铅含量分别高出普通烟草同位置的...
高光谱遥感技术在水稻转入基因表达的检测指示作用研究
转基因水稻 高光谱 内聚系数 均值光谱
2010/3/23
传统方法在转基因作物目的基因表达检测上做了很多工作,但仍有发展空间。该研究利用野外高光谱仪(ASD野外光谱仪),避免了实验室测量带来温度水分差异造成的影响,实地测量大田水稻样本光谱数据;通过引入内部聚类系数控制类内波段聚合度,使用均值光谱表征样本类光谱,计算与光合作用高度相关的边峰以及光化学植被指数等参数,快速定量了转基因组样本与亲本在光合作用波段的光谱表达差异。研究结果表明转入基因得到了表达、对...
弱激光对脂质体介导的血管平滑肌细胞基因转染的影响
2007/7/28
期刊信息
篇名
弱激光对脂质体介导的血管平滑肌细胞基因转染的影响
语种
中文
撰写或编译
撰写
作者
顾瑛,刘凡光,江亿平,朱建国,李峻亨
第一作者单位
解放军总医院激光科
刊物名称
激光生物学报
页面
81-87
出版日期
1999年
2月
日
文章标识(ISSN)
相关项目
低功率激光对血管平滑肌细胞转染基因的影响及机制
超声诱导对家蝇幼虫基因组DNA影响的谱学研究
家蝇幼虫基因组DNA 超声诱导 DNA二级结构
2010/2/4
超声诱导3日龄家蝇幼虫后提取对照和处理组的基因组DNA,利用紫外光谱、荧光光谱、红外光谱、核磁共振谱对其结构进行分析,并利用PCR对基因组中attacin基因的3′端序列进行测序比较。结果表明,超声诱导能够影响家蝇幼虫基因组DNA的二级结构和碱基堆积状态,进而在DNA复制时造成碱基错配最终导致DNA序列发生改变,但是超声诱导对DNA的化学基团和化学键没有明显的影响。