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北京基因组所（国家生物信息中心）合作揭示衰老抑制再生能力的关键机制（图）
再生能力 骨骼肌 生理功能
2023/11/21
“什么控制着器官再生？”和“我们可以阻止自己衰老吗？”是《科学》杂志公布的全球最具挑战性的科学问题。“再生”是机体组织应对损伤进行修复及重塑的生物学过程，对维持器官功能稳态有重要作用，这体现了生命自我修复与组织重建的能力。而衰老是随时间的推移，生物体功能逐渐下降、身体结构逐渐受损的生物学过程，体现了生命的有限性与定向性。“再生”和“衰老”都是高度复杂的系统生物学过程，二者既相互对立，又紧密联系。然...
MACdb数据库系统建立了癌症-代谢物关联关系的收集标准，通过使用一系列本体体系（Ontology）对癌症类型、特征、代谢物标准化，构建了高一致性的综合知识集合。当前版本的知识库共收录了462篇文献，提取了40,710个癌症-代谢物关联关系对，共涉及到269个癌症特征，涵盖17类高发病率或高死亡率癌症类型，是当前涵盖癌症类型最全的癌症-代谢物关联知识库。MACdb构建了便捷高效的检索和过滤系统，支...
023年6月5日，国际学术期刊EMBO Molecular Medicine在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所翟琦巍研究组题为“AAV induces hepatic necroptosis and carcinoma in diabetic and obese mice dependent on Pebp1 pathway”的研究论文。该研究发现腺相关病毒(Adeno-associated...
2023年4月24日，《细胞》（Cell）以Research Article的形式，在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心孟飞龙研究组等撰写的题为Mesoscale DNA Feature in Antibody-Coding Sequence Facilitates Somatic Hypermutation的最新成果。该研究基于经典生化方法与高通量测序技术，建立了体外检测抗体基因超突变的...
中国科学院北京基因组研究所郭彩霞研究员（图）
DNA 非编码RNA 糖基化 磷酸化
2023/4/19
郭彩霞研究员,研究方向:1.DNA损伤应答与基因组稳定性：从蛋白（包括多种翻译后修饰，如泛素化、糖基化、磷酸化、乙酰化等）、非编码RNA等水平研究DDR通路调控机理。2.核酸代谢与疾病：研究DDR通路调控异常与肿瘤发生、发展以及耐药的关系，寻找新的治疗靶点；研究环境污染物对基因组稳定性的影响及其与疾病发生、发展关系等。
中国科学院北京基因组研究所陈非研究员（图）
重症肺炎 陈非研究员 单细胞
2023/4/19
陈非研究员，研究方向1）重大呼吸系统疾病精准基因组学研究：以致病微生物所引起的新冠、重症肺炎及结核等重大呼吸道疾病临床样本或细胞、动物模型为研究对象，应用多组学研究手段（基因组、转录组、蛋白组、代谢组、表观组、表型组、单细胞及空间组等），集成机器学习和数学统计模型，深入探究微生物致病机制及宿主免疫机制，致力于发现上述疾病临床诊治靶标，切实解决实际临床瓶颈问题等。
2022年2月23日，中国医学科学院阜外医院顾东风和鲁向锋团队在European Heart Journal在线发表题为“A polygenic risk score improves risk stratification of coronary artery disease: a large-scale prospective Chinese cohort study”的研究论文。本研究建立了...
2022年5月19日，中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）张磊主任、杨仁池主任与华东理工大学肖啸教授团队合作开展的亚洲首个肝脏靶向腺相关病毒（AAV）血友病B基因治疗（clinicaltrial.gov:NCT041353000）的研究成果——“Safety and activity of an engineered, liver-tropic adeno-associated ...
尿路上皮癌 (UC) 是泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,包含上尿路上皮癌和膀胱癌。目前诊断和监测尿路上皮癌 (UC) 通常使用侵入性方法，价格昂贵，并且灵敏度和特异性并不理想，对低级别、早期和术后的微小残留病灶 (MRD)效果不佳。
中国科学院昆明植物研究所利用砂生槐基因组分析揭示蔗糖代谢对其干旱适应性的作用（图）
砂生槐 基因 蔗糖代谢
2023/3/19
砂生槐（Sophora moorcroftiana）是西藏地区分布极广的一种多年生的豆科类灌木，其根系发达，具有极强的耐干旱、耐贫瘠、抗风沙的生态特征。作为西藏高原生态恢复的理想树种, 砂生槐也是西藏放牧地区天然草地上的重要植物构成。因此该植物是研究高原地区植物适应性进化和抗旱的优良材料。然而，对该植物基因组学以及抗旱性的分子机制的研究仍相对较少。
尿路上皮癌（UC）是最常见的泌尿系统肿瘤之一，发生在下尿路（膀胱和尿道）或者上尿路（肾盂和输尿管）。膀胱尿路上皮癌（UCB）的发病率大约占UCs的90-95%，而上尿路尿路上皮癌（UTUC）仅占UCs的5-10%，但其恶性程度显著高于UCB。免疫检查点抑制剂能够影响局部晚期或转移性UC（mUC）的治疗，但是仍有多数患者对检查点抑制剂没有反应，识别可能从免疫治疗中受益的患者仍然是临床上主要的挑战之一...
华中农业大学精准营养与代谢团队揭示哺乳动物假基因的演化和功能（图）
代谢 哺乳动物 基因 演化
2022/11/22
2022年11月8日，华中农业大学生命科学技术学院、生物医学与健康学院精准营养与代谢团队陈振夏课题组在国际学术期刊Genome Biology在线发表最新研究成果，该研究系统地分析了人和小鼠基因组中假基因的演化历程、表达模式、在发育过程中的转录调控、翻译活性以及在癌症中的功能。该研究鉴定到一批参与复杂调控网络并有潜力作为癌症生物标志物的假基因，为后续表型和机制研究奠定基础。
中国科学院广州生物院发现肿瘤-睾丸基因能造成持久的染色体不稳定现象（图）
肿瘤-睾丸基因 染色体 复合物蛋白 生殖细胞
2022/10/14
2022年10月13日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员Alexander Strunnikov团队在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上，发表了题为Ectopic expression of meiotic cohesion generates chromosome instability in cancer cell line的研究论文。
DNA 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 是由组织特异性的5-甲基胞嘧啶（5mC）动态氧化过程产生的，且在包括泌尿生殖系统肿瘤内的多种癌症中发生了5hmC的丢失。然而，5hmC存在细胞特异性，且其特异性可能存在于分化的肿瘤细胞和癌症干细胞间。因此，5hmC与癌症相关的变化可能由肿瘤组织内不同的肿瘤细胞引起，但该生物学过程的调控机制依然存在未知。