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中山大学脊椎动物基因组复制数据库DupScan的构建及其应用（图）
脊椎动物进化 基因复制 分子遗传育种
2022/9/26
脊椎动物进化中的基因复制事件普遍存在，它们在获得新基因和新性状方面发挥着重要作用。而全基因组复制（WGD）可以通过增加基因组的灵活性和复杂性为自然选择提供重要原料，是基因复制的重要来源之一。此外，WGD也是脊椎动物进化的驱动力，对物种，特别是具有复杂WGD模式的鱼类物种多样性有很大贡献（图1）。
从水生到陆生是脊椎动物演化史上的一次飞跃，也是脊椎动物演化中最重要的科学问题之一。脊椎动物登陆事件发生于有颌类的硬骨鱼类。现生硬骨鱼类包含肉鳍鱼类和辐鳍鱼类。这两个类群中物种数量最为繁盛的是肉鳍鱼类中的四足动物（成功登陆的脊椎动物类群）以及辐鳍鱼类中的真骨鱼类。相对于这两个最为繁盛的类群，硬骨鱼类的基部类群物种数量相对稀少，但却隐藏着祖先演化所遗留的痕迹，有“活化石”之称。2021年2月5日凌晨，...
脊椎动物DMRT基因家族的系统发生及同线性分析
DM结构域 同线性 基因家族 性别分化
2008/1/25
摘要 利用本室克隆的DMRT/Dmrt基因以及多个基因数据库中收集的DMRT/Dmrt基因全（或部分）序列，构建了DMRT/Dmrt基因的系统发生树，DMRT/Dmrt基因明显地聚类为7类（DMRT/Dmrt1~DMRT/Dmrt7）。以已克隆的斑马鱼Dmrt1基因序列及数据库中人和小鼠的DMRT/Dmrt基因序列，结合基因组数据的比对分析，发现脊椎动物DMRT/Dmrt基因家族成员在基因组中的定...
脊椎动物Sox基因家族的系统发生分析
Sox基因 HMG盒 系统发生 脊椎动物
2007/12/7
摘要脊椎动物Sox基因是一类高度保守的基因家族,它们编码一类转录因子,参与多种发育过程的调控.这个家族的共有特征是Sox蛋白具有一个约79个氨基酸,可与DNA特异结合的HMG盒区.该基因家族成员众多复杂,对它们的基因结构、功能及进化关系的研究有助于对该基因家族的全面认识.利用已克隆的全部脊椎动物全长核苷酸/蛋白质数据,对这些数据进行序列比对及进化树的构建,分析Sox基因家族成员的分类及分子进化模式...
摘要：在无脊椎动物的分子系统学研究中，作为对线粒体DNA信息的重要补充，人们越来越多地采用核DNA的核糖体内转录问隔区(1TS)作为分子标记。本文介绍了ITS的组成和性质．并对近年来ITS在无脊椎动物分子系统学研究中的应用进行了总结，同时提出并讨论了目前在该领域存在的一些问题。