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摘要根据 23个等位基因不同外显子(EN)的核苷酸(NT)替换及同义密码子使用谱(SCU)偏移研究了哺乳类7种动物MHC DQA座位的系谱发育关系。发现:( 1)在大时间尺度内,MHC DQA基因进化速率(1.0×10 E-9,其中EN2为1.3×10 E-9N T/位点/年)与一般核基因相似; 鼠类DQA基因的NT替换速率大致是其他哺乳类的2倍; (2)证实DQA等位基因多态性是在哺乳动物分化以...
黑素皮质激素受体1(MC1R)基因系统发育树与犬的毛色
犬 毛色 MC1R 基因 系统发育树
2007/12/21
犬的驯养迄今约有1万多年,由于不同环境和不同目的人工选择形成了犬品种间或品种内极丰富的毛色多样性,经证实,这些犬的很多毛色类型与MC1R相关 ,MC1R在一些物种中有同源基因 本文阐述了犬MC1R多态性研究进展,并选择其它9个有代表性的哺乳动物物种与犬MC1R同源基因进行了比较,以此建立系统发育树。结果显示,10个物种的MC1R基因的分子进化关系与物种的经典分类学地位基本相符。
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鳜类鱼类的线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析
鳜类 mtDNA控制区 结构 系统关系
2007/12/7
摘要鳜类为低等鲈形目鱼类,是东亚特有类群。然而,关于其系统位置、分类以及一些物种的有效性等尚有争议。采用PCR扩增直接测序的方法,获得了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜线粒体DNA控制区基因的序列。对比其他已报道鱼类控制区的结构识别序列,对鳜类鱼类控制区的结构进行了分析,识别了终止序列区、中央保守区和保守序列区,并找到了DNA复制终止相关的序列ETAS和中央保守区的保守序列CSB...
基于核内核糖体小亚基序列的蝗总科系统发育关系分析
蝗总科 SSU rDNA 分子系统发育
2007/8/5
题目:基于核内核糖体小亚基序列的蝗总科系统发育关系分析
作者:印红1, 李新江1,王文强1,2,印象初1,3
摘要:用核糖体SSURdna全序列对蝗总科(Acridoidea)进行了分子系统学研究。依据测定的8种蝗虫的SSU Rdna全序列 (平均 1.844 bp),并从GenBank中选取了6种内群种类和2种外群种类的SSU Rdna同源序列,进行序列分析。利用Clustal、MEGA 和 ...
摘要:
生物多样性保护面临两个基本问题:如何确定生物多样性测度以及如何保护生物多样性。传统的生物多样性测度是以物种概念为基础的,用生态学和地理学方法确定各种生物多样性指数。其测度依赖于样方面积的大小,并且所有的物种在分类上同等对待。系统发育多样性测度基于系统发育和遗传学的理论和方法,能确定某一物种对类群多样性的贡献大小。该方法比较复杂,只有在类群的系统发育或遗传资料比较齐全时方能应用。本文认为,物...