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线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育
系统发育 D-loop 东方鲀属
2009/8/26
东方鲀属的红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中,利用东方鲀属11种鱼类(18尾)的D-loop基因序列,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后,分析中D-loop序列有841个位点,其中395个位点为可变位点,267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯方法构建了分子系统...
基于线粒体COI基因序列的文蛤属(软体动物门:帘蛤科)系统发育关系(英文)
文蛤属 文蛤 COI基因 系统发育
2009/6/23
测定了4种文蛤属贝类的15个个体的COI基因序列,并从GenBank下载了短文蛤 (M. petechialis)的相应序列。比对后的序列长度为574 bp,包括93个简约信息位点,A、T、C和G的平均含量分别为21.15%、44.71%、14.05%和20.09%。通过对序列的分析,共定义了12个单倍型:文蛤 (M. meretrix) 4个,斧文蛤 (M. lamarckii) 2个,丽文蛤 ...