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“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划推动中国该领域跨越式发展（图）
细胞编程 细胞 癌症 神经
2018/3/5
2018年1月2日，国家自然科学基金委员会（以下简称基金委）批准“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划（以下简称该计划）结题。该计划于2008年10月启动，2016年底资助项目结题，累计资助项目156项，其中包括培育项目68项、重点项目23项和集成项目59项。申请项目涉及生命、化学和信息等学部，资助经费1.9亿元。
10月26日，中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心何跃辉研究组，以Embryonic epigenetic reprogramming by a pioneer transcription factor in plants为题的研究论文，在线发表在Nature上。2016年12月，何跃辉研究组在Nature Genetics报道了模式开花植物拟南芥在营养生长阶段如何利用长期低温（...
中国科学院昆明动物研究所等揭示非洲家犬抵御疟原虫侵害遗传机制（图）
中国科学院昆明动物研究所 非洲家犬 疟原虫 遗传机制
2017/10/13
中国科学院院士张亚平团队对收集到的非洲尼日利亚6个城市的15个家犬样品，以及来自非洲不同国家的4只非洲金豺(Canis anthus)样品进行了全基因组测序。群体遗传结构分析显示，非洲家犬有独立的遗传组分。群体历史模拟显示，家犬约1万4千年前迁移到非洲（图1）。经历一次强烈的瓶颈效应后，非洲家犬与非洲金豺发生基因交流。全基因组选择信号扫描分析显示，非洲家犬群体在抗疟疾、免疫反应、紫外线保护等相关信...
中国科学院昆明动物研究所揭示实验大鼠起源和驯化遗传机制（图）
中国科学院昆明动物研究所 大鼠起源 驯化遗传机制
2017/9/20
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。研究人员利用群体遗传学方法，FST与cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等，在全基因范围内...
近日，国际重要学术期刊《Scientific reports》在线发表上海交通大学生命科学技术学院乔中东教授团队最新研究成果“Paternal nicotine exposure defines different behavior in subsequent generation via hyper-methylation of mmu-miR-15b”。乔中东教授团队长期从事有关吸烟对男性生殖...
复叶作为单叶对于环境适应进化的产物, 更能适应恶劣的外界机械压力。绝大多数豆科植物具有典型的复叶结构, 其发育过程反映了植物复叶发育的基本特征。本文介绍了近年来大豆、豌豆、蒺藜苜蓿和百脉根4种豆科植物复叶发育分子机制的研究进展, 比较了它们在复叶发育过程中的异同, 以期明晰豆科叶片复杂的发育机制, 为豆科作物分子育种改良提供理论指导。
中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组在藏族高原适应遗传机制研究中取得重要进展（图）
宿兵课题组 藏族 高原 适应遗传机制
2017/1/20
藏族人群对高原低氧极端环境表现出了较好的适应能力，这种适应能力是长期自然选择的结果（Qi et al Mol Biol Evol 2013）。然而，藏族人群的遗传适应是如何通过分子水平的精细调控实现心、肺等氧交换和氧运输器官在高原低氧下的正常生理功能的仍是未解之谜。宿兵课题组与西藏大学高原医学中心的崔超英教授、青海省高原医学科学研究院吴天一院士通过多年的紧密合作，对高原藏族与平原汉族人群间的全基因...
组学技术揭示水稻杂种优势遗传机制
水稻 杂种优势 基因组学 全基因组关联分析
2018/6/28
杂种优势是杂交后代在生长或生殖性状上表现出优于亲本的现象。虽然杂种优势在农业生产上已广为应用, 但其分子机理仍不清楚。最近, 中国科学家通过分析17个代表性杂交稻(Oryza sativa)品种, 共10 074个F2个体的全基因组序列和表型, 对水稻产量杂种优势相关位点进行了系统定位和解析。此外, 中国另一个科研小组通过整合杂交稻亲本和杂交种的表型组、转录组及基因组等多层次数据, 深入研究了超级...
中国科学院昆明动物研究所在家鸡体型的遗传机制研究中获得新进展（图）
中国科学院昆明动物研究所 家鸡 元宝鸡 遗传机制研究 比较群体基因组学方法 进化
2016/10/18
中国科学院昆明动物研究所的研究人员选取了以小体型著称的元宝鸡为研究对象，对其进行全基因组重测序，利用比较群体基因组学方法揭示了家鸡体型大小进化的遗传机制。发现元宝鸡基因组中4个区域可能和其小体型相关，尤其是位于22号染色体上的BMP10基因在元宝鸡中表现出很强的选择信号。相关性分析表明BMP10与家鸡体重变异显著相关，可以解释元宝鸡体型22.41%变异。进一步分析发现BMP10上游启动子区域的突变...
对高海拔极端环境的适应性进化遗传机制研究一直是进化生物学研究的热点问题。通过对生活在高海拔环境下的人类和野生动物及家养动物的研究，已经鉴定出很多与高海拔适应相关的候选基因，包括与低氧，能量代谢和DNA修复等相关的基因。然而，目前我们所获知的与高原适应性相关的基因或信号通路，多数都是来自于对常染色体区域的分析，对性染色体的分析非常缺乏，因而其在高海拔适应中所扮演的角色并不清楚。
青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析，不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制，也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用，为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导，进一步促进青藏高原地区生态文明建设和生态经济可持续发展。
研究揭示抗病毒免疫应答新型表观遗传机制
抗病毒免疫应答新型表观遗传机制 中国工程院
2016/7/20
中国工程院院士曹雪涛团队发现，DNA甲基化酶Dnmt3a能使天然免疫细胞针对病毒感染处于一种敏感状态，一旦识别病毒入侵就可以显著产生干扰素和启动抗病毒天然免疫反应，该发现揭示了抗病毒免疫应答新型表观遗传机制，也为病毒感染性疾病防治提出了新的潜在分子靶标。成果近日发表于《自然—免疫学》。
近年来，基因组学特别是进化基因组学的发展，为系统和整体的揭示自然选择的遗传机制提供了前所未有的机会。云南大学于黎研究员课题组、中国科学院昆明动物研究所张亚平院士课题组和陈勇斌课题组、芝加哥大学吴仲义教授课题组和北京基因组所强强联合，成立联合攻关团队，对金丝猴属物种高海拔环境适应遗传机制开展研究。
中国科学院昆明动物研究所基因组研究揭示金丝猴属物种高海拔适应遗传机制（图）
动物研基因 金丝猴 高海拔 适应遗传机制
2016/7/13
金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目，猴科，疣猴亚科，包括5个近缘物种：滇金丝猴（R.bieti），怒江金丝猴(R.strykeri )，川金丝猴(R. roxellana)、黔金丝猴(R. brelichia)和越南金丝猴(R. avunculus)。所有物种均被列为红色物种名录濒危物种。除了重要保护生物学价值，金丝猴属物种不仅发展出以树叶为食的特化食性，而且占据了从低海拔到高海拔的...