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中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛,联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海,在《基因组研究》(Genome Research)上,在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preimplantation embryos reveals regulatory elements def...
2023年10月13日,国际学术期刊Nucleic Acid Research在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)石建涛研究组与上海交通大学合作的最新研究成果“mHapBrowser: a comprehensive database for visualization and analysis of DNA methylation haplotypes”。这...
2023年9月14日,《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心石建涛组完成的最新合作研究成果(用福尔马林固定的石蜡包埋组织进行 DNA 甲基化分析以确定转移癌的原发部位)。 该研究开发了新方法,即利用医学病理学中常用的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,构建DNA甲基化信息图谱,并结合机器学习方法,准确预测转移性癌症的原发部位。
近日,上海海洋大学教授胡鹏与宾夕法尼亚大学遗传系Hao Wu团队在《自然-生物技术》发表论文,探讨了单细胞胞嘧啶甲基化和羟甲基化修饰联合分析技术,并揭示其特异的基因调控作用。
急性髓系白血病(AML)是一种常见的血液系统恶性癌症,其治愈率低、预后较差,5年生存率仅为30-35%, 且AML患者对药物治疗的反应存在高度异质性。部分老年、复发难治的高危AML患者,不适合接受标准剂量的诱导化疗。一项I期临床试验结果表明,利用DNA甲基化酶抑制剂阿扎胞苷(AZA)进行表观干预5天后,再使用高剂量阿糖胞苷联合米托蒽醌(HiDAC-Mito)进行治疗,是一种有效且耐受性良好的治疗方...
2021年7月5日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)鲍岚研究组的最新研究进展“α-TubK40me3 is required for neuronal polarization and migration by promoting microtubule formation”。该研究揭示了α微管蛋白上新...
CD8+ T细胞是机体识别与杀伤肿瘤细胞的关键免疫细胞,其功能却常常被复杂的肿瘤微环境所抑制。前期研究表明,肿瘤细胞可利用多种表观修饰机制调节T细胞介导的抗肿瘤免疫应答,从而实现免疫逃逸。而m6A作为一种动态可逆的表观转录组修饰,影响mRNA的稳定性及翻译等过程,在肿瘤的发生发展中起到重要的作用。然而,肿瘤细胞的m6A修饰如何参与调节肿瘤免疫微环境,调控T细胞介导的免疫监视,目前仍不太清楚。
2021年3月30日,中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组、北京大学现代农学院王玉秋博士和中科院遗传与发育研究所李家洋课题组合作在《Nucleic Acids Research》发表了题为"Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis thaliana"的论文。论文系统检测了模式植物拟南芥中多种RNA上的2'氧甲基化修饰谱,并对指导修饰的sn...
2021年3月8日,《Nature Protocols》在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰实验室的论文,题目为"Simultaneously measuring the methylation of parent and daughter strands of replicated DNA at the single-molecule level by Hammer-seq"。在先前的工作中(...
近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展,蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态分析等检测技术不断涌现,其中很多技术(如DNase-seq和ATAC-seq等)依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性。在这些新技术中,全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术(NOMe-seq)能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性区域,结合亚硫酸氢盐转换,NOMe-seq能够同时检...
2020年12月24日,南方科技大学生物系高级研究学者李婉秋携手北京师范大学教授王占新团队、纪念斯隆-凯瑟琳癌症研究中心教授Dinshaw J. Patel团队和斯坦福大学教授Or Gozani团队在《自然》(Nature)杂志在线发表了题为“Molecular basis of nucleosomal H3K36 methylation by NSD methyltransferases(NSD...
2020年6月24日,《Cell Research》在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰实验室的研究论文"Kinetics and mechanisms of mitotic inheritance of DNA methylation and their roles in aging-associated methylome deterioration"。该工作解析了细胞有丝分裂中DNA甲基化...
染色体浓缩是细胞分裂的前提基础,有丝分裂和减数分裂都需要将复制后的细长染色体浓缩成棒状的染色体,进而保证后期的正确分离。相比之下,有丝分裂中染色体从前期到中期是快速的一步浓缩,而减数分裂包括减数分裂I和II,其中减数分裂I是该细胞分裂方式所特有,前期I又包括细线期、偶线期、粗线期、双线期和终变期,过程主要涉及到父母同源染色体之间的配对、联会和重组。为了保证这些核心事件的有序进行,染色体的浓缩是逐步...
2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jaenisch联合其他课题组在Molecular Cell上发表文章Dynamic Enhancer DNA Methylation as Basis for Transcriptional and Cellular Heterogeneity of ESCs。研究人员选择了Sox2和miR290-295的超级增强子作为研究对象。这...
胚胎着床是包括人类在内的哺乳动物发育过程中的里程碑事件,生理状态下超过半数以上的人类胚胎由于无法顺利着床导致不孕。既往研究通常使用小鼠和食蟹猴等模式生物对这一过程展开探索,然而调控围着床时期胚胎发育的分子机制和形态学变化特征在不同物种之间存在较大差异,这使得在小鼠等模式生物研究中获得的调控规律较难为人类胚胎发育研究提供有价值的线索。然而,由于人类胚胎着床发生在受精卵形成后一周左右的时间点,这使得研...

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