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近年来，随着测序技术和算法的开发，大量动植物基因组被陆续测序和组装，但是基因组组装质量参差不齐，存在不同程度的组装错误，影响了后续的相关研究。高质量的参考基因组对于基因的精准注释和功能研究以及比较基因组学和调控元件的挖掘等至关重要。虽然目前已经有一些基因组组装质量评估的方法，然而它们大多数仅提供了一个概述性的评估值，没有能够针对特定区域设置特定碱基给出精准度的评估。
中国科学院植物研究所等在寄生花基因组进化及花发育机制研究中获进展（图）
寄生花 基因组进化 花发育机制
2023/6/21
寄生植物的起源和适应性机制是进化生物学的谜团之一。寄生花（Sapria himalayana）是内寄生植物中的典型代表，也是我国唯一分布的大花草科（Rafflesiaceae）植物。寄生花寄生于崖爬藤属（Tetrastigma）植物的根或茎中，在营养生长阶段以菌丝状的形态穿插在寄主植物的细胞间隙。当接收到开花信号，它就会进入生殖生长阶段，快速分裂、膨大，形成原球茎，冲破寄主的束缚，与世人相见。寄生...
中国科学院植物研究所揭示调控水稻籽粒大小的新通路（图）
水稻 籽粒大小 新通路 基因工程
2023/4/11
水稻是我国重要的主粮作物。籽粒大小是决定稻米外观品质和产量的重要农艺性状。近年来，水稻籽粒大小的调控机理研究取得了较大进展，许多重要相关基因被克隆和分析。然而，目前与之相关的遗传调控网络较少被报道，限制了人们对籽粒大小调控机理的认知，也制约了其在作物高产优质分子育种实践中的利用。
农作物应对全球气候变化引起的异常温度需要具备优异耐受模块，品种设计需依赖细胞寒害感知防御“信号网络”和“修复机制”的原理。
中国科学院植物研究所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱（图）
莱茵衣藻 m6A 转录组图谱
2022/9/20
m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰，与RNA命运相关。近年来，m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而，m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细胞结构的物种，在进化中具有重要地位。绿藻门的莱茵衣藻是一种单细胞、单倍体、且兼具动植物属性的藻类，是常被...
中国科学院植物研究所光合膜蛋白结构生物学研究团队与清华大学隋森芳研究团队合作，利用单颗粒冷冻电子显微镜技术解析了嗜热蓝藻（Thermosynechococcus vulcanus）PSII中间复合体Psb28-RC47和Psb28-PSII的近原子分辨率（3.14埃）三维结构，揭示了Psb28的精确结合位点及复合体的结构特征。研究表明Psb28-RC47复合体含有14个蛋白亚基，包括3个核心大亚基...
光形态建成是指植物发育过程中感受到光的存在之后所启动的一系列生物学变化过程。COP1作为一种泛素E3连接酶，在光形态建成的负调控中扮演核心角色。在黑暗下，COP1聚集在细胞核中并介导光形态建成的多个正向调节因子的泛素化修饰及降解；见光后，COP1活性降低，从而保证正常的光形态建成。然而，COP1活性的翻译后修饰调控机制尚不清楚。
表达模式是基因的基本属性，了解基因表达模式在进化中的改变及其分子机制是进化生物学研究的重要内容。然而，由于表达模式本身是个非常复杂的概念，前人对其进化分子机制的研究尚不深入，典型的例子并不多见。中国科学院植物研究所孔宏智研究组以拟南芥中的APETALA1（AP1）和CAULIFLOWER（CAL）基因为例，对重复基因表达分化的模式、过程和机制进行了研究。
中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室徐桂霞副研究员（图）
中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室 副研究员 基因家族的进化、重复基因的分化及RNA编辑的进化研究
2016/4/15
徐桂霞，2005年毕业于云南大学生命科学学院，获学士学位，同年被保送到中国科学院植物研究所，2010年7月毕业并获理学博士学位，同年留所工作。2012年5月至2013年7月在美国密歇根大学张建之教授实验室进行合作研究。目前主要从事基因家族的进化、重复基因的分化及RNA编辑的进化研究。主持了国家自然科学基金委青年科学基金项目“重复基因结构分化的机制及其偏好性研究”。参加了国家自然科学基金委重点基金项...
中国科学院植物研究所2015年攻读硕士学位研究生招生专业目录。
中国科学院植物研究所在被子植物两侧对称花起源的研究中取得新进展（图）
被子植物 两侧对称花 烟叶苣苔
2012/6/7
达尔文有关白垩纪中后期被子植物大爆发这一著名的“令人烦恼之谜”激励着植物系统发育学家和古生物学家为之不懈探索。目前，人们认识到作为被子植物系统演化中的一个关键创新事件，两侧对称花的出现及其和传粉昆虫之间的协同进化极大地促进了被子植物快速物种形成和多样化。两侧对称花的形态建成依赖于TCP转录因子家族的CYC2支系基因在花背部器官的持续表达。这一背特性功能在不同支系中的重复招募和两侧对称花的多次起源相...
中国科学院植物研究所等在甜高粱基因组变异研究中取得新进展 （图）
中国科学院植物研究所 甜高粱基因组变异研究 新进展
2011/11/28
作为世界第5大作物的高粱是世界干旱及半干旱区的主要粮食作物，也是我国最早栽培的禾谷类作物之一，有着上千年的历史，是重要的杂粮和酿酒、饲料、色素等工业的重要原料。甜高粱是高粱的一个自然变种，同普通籽实高粱相比有着诸多独特的生物学和农艺学性状，如高光合效率、大生物量和更强的耐逆性等。尤为突出是它的高秸杆含糖量，是我国和世界发展第1、2代生物质液体燃料的重要作物。但甜高粱和籽实高粱在基因组水平的差异尚未...