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微生物残体DNA广泛存在于陆地和水域生态系统中。从水环境样品中提取的微生物DNA通常来自活体微生物和死亡微生物残体。环境DNA高通量测序技术的应用，显著提高了微生物群落检测的效率和通量，而无法区分微生物细胞的死活状态。因此，基于环境DNA的微生物群落分析会造成一些微生物多样性和群落组成的错误估计。已有研究使用叠氮溴化丙锭（Propidium monoazide，PMA）染色方法，可选择性地结合死细...
线粒体是真核细胞的动力工厂，在能量代谢、凋亡调控、免疫反应、信号传导、生物质合成、胞质钙离子调节等众多细胞功能中都具有重要作用。作为人类细胞中唯一拥有独立遗传系统的细胞器，其遗传物质线粒体DNA（mtDNA）的突变与疾病及衰老密切相关。单细胞中存在成百上千拷贝的mtDNA，这使突变型与野生型的mtDNA共存形成mtDNA异质性。常见的致病性mtDNA突变也多以异质性形式存在，这些mtDNA突变在衰...
中国科学院青岛能源所揭示植物DNA损伤调控新机制（图）
植物DNA损伤 土壤盐碱 电离辐射 生物体遗传
2023/9/2
DNA是生物体遗传信息的载体，是正常生长、发育和繁衍所需的遗传模板，维持DNA的完整性和稳定性至关重要。紫外线、辐射和环境污染等引起的DNA损伤影响人和动物的衰老，导致疾病乃至癌症。对植物而言，外界环境因子，如土壤盐碱、重金属、电离辐射、紫外线、洪涝等胁迫，同样会导致DNA损伤，严重影响植物生长发育甚至对作物生产造成危害。然而DNA损伤响应及修复的机制在动物和植物中并不完全相同，在植物中的研究较为...
地衣型真菌是一类能与蓝细菌或藻类共生形成稳定有机体的特化真菌，其物种演化和分类界定仍在不断地探索中。茶渍科是地衣型真菌的第五大科，含1000余种，是地衣分类中问题最多、最为复杂的类群之一。其中，多形茶渍Lecanora polytropa (Hoffm.) Rabenh为世界广布种，不同材料间形态差异较大，使该种下亚种、变种和变型多达40余个。
浙江大学微生物研究所张珂-吴雪昌实验室在PNAS和AEM发文合作揭示细胞DNA聚合酶功能分工新机制（图）
浙江大学微生物研究所 张珂 吴雪昌 PNAS AEM 细胞DNA 聚合酶 功能分工
2022/5/31
2022年3月15日，美国科学院院刊PNAS在线发表浙江大学生命科学学院微生物研究所特聘研究员张珂为第一作者的研究论文Global genomic instability caused by reduced expression of DNA polymerase ε in yeast。该研究揭示了DNA聚合酶epsion表达限制诱导的全局性基因组不稳定规律和遗传机制。
中国科大在DNA复制、抗菌策略研发领域取得重要进展（图）
DNA复制 抗菌策略 DNA聚合酶 生物遗传
2022/11/18
DNA复制是生物遗传的基础和物种保持独特性的根本。自1953年，美国遗传学家沃森和英国物理学家克里克在《自然》上揭示了DNA的双螺旋结构，并于1962年和英国分子生物学家莫里斯·威尔金斯分享了诺贝尔生理学或医学奖以来，人类一直在探索DNA的复制过程。DNA复制过程中，高度保守的DNA聚合酶对DNA复制至关重要。DNA聚合酶的b亚基是DNA复制过程中的持续性-启动因子（processivity-pr...
微生物污染已成为国内外突出的食品安全问题，而由此引发的食源性疾病严重危害了人类的健康。我国每年的官方通报中，细菌性食物中毒的报告数和波及人数最多。因此，开展食源性致病菌的快速、准确监测具有十分重要的意义。
科技日报北京2021年1月13日电 （记者冯卫东）据最新一期《自然·化学生物学》杂志报道，美国研究人员通过CRISPR技术，将数字电子信号直接转换为存储在活细胞基因组中的遗传数据，这或是迈向开发用于长期数据存储新介质的关键一步。
国际著名期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）近期发表药学院王连荣教授课题组在细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，揭示了DNA磷硫酰化修饰的位点选择性及其与DNA三维结构和DNA甲基化修饰的关系，阐明了在同一种细菌中两种完全不同类型DNA修饰之间的相互影响。论文题为“Epigenetic competition reveals density-dependent regulation and t...
上海交通大学生命科学技术学院吴更团队在细菌DNA硫化修饰研究方面取得新进展（图）
吴更 细菌DNA 硫化修饰 磷硫酰化
2020/5/20
近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室吴更教授与武汉大学王连荣、陈实教授团队合作，揭示了细菌DNA硫化修饰中催化第一步反应的半胱氨酸脱硫酶发生构象变化，使其活性位点半胱氨酸朝向底物半胱氨酸移动5.5埃以发起攻击的催化机制。最新研究成果以“Structural Analysis of an L-Cysteine Desulfurase from an Ssp DNA Phosp...
国际著名期刊《自然·微生物学》（Nature Microbiology）近日在线发表了武汉大学药学院王连荣教授课题组在细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统---DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统，并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。
科学家首次详细分析细菌DNA在人体内脏中分布情况
科学家 细菌DNA 人体内脏 分布情况
2020/3/11
据英国《自然·代谢》杂志2020年3月9日发表的一项最新研究，科学家首次详细分析了细菌脱氧核糖核酸（DNA）在人体内脏中的分布情况。我们都知道，人类体表和肠道布满了细菌，如肠道内寄生着多达10万亿个细菌，它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险，同时控制人体对癌症治疗药物的反应。但长期以来，我们对内脏的情况并不清楚，虽然内脏一般是无菌的，但是在肥胖症等疾病中，细菌片段可以从肠道转...
细菌DNA在人体内脏中分布揭秘
细菌DNA 人体内脏 细菌分布
2020/3/11
据英国《自然·代谢》杂志9日发表的一项最新研究，科学家首次详细分析了细菌脱氧核糖核酸（DNA）在人体内脏中的分布情况。我们都知道，人类体表和肠道布满了细菌，如肠道内寄生着多达10万亿个细菌，它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险，同时控制人体对癌症治疗药物的反应。但长期以来，我们对内脏的情况并不清楚，虽然内脏一般是无菌的，但是在肥胖症等疾病中，细菌片段可以从肠道转移至血液，从而...
嗜盐古菌是大多生活在极端高盐环境（如盐湖、盐矿和晒盐场）中的一类化能异养型单细胞原核微生物，具有特殊的代谢能力，并且在生物医学材料，高盐废水处理，食品加工等方面具有重要的应用前景。大多嗜盐古菌能分泌一种类似于细菌素的蛋白类抗生素，即嗜盐菌素。这在嗜盐古菌竞争营养物质和有限的生存空间方面发挥重要作用。
中国科学院微生物研究所建立无痕迭代DNA组装新方法（图）
中国科学院微生物研究所 无痕迭代 DNA组装 新方法
2019/7/22
中国科学院微生物研究所病原室温廷益研究组建立了基于IIP和IIS型限制性内切酶（RE）的DNA组装方法，命名为PS-Brick。与在两端加入RE识别序列的现有DNA组装技术不同，本方法仅在PS-Brick供体DNA的一端巧妙设计了毗邻的IIP和IIS型RE识别序列，并且保留了另外一端的PCR产物特性，解决了目前基于RE的DNA组装方法普遍存在“疤痕”序列问题。该技术使用IIP型RE切割供体DNA产...