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搜索结果: 31-45 共查到遗传学 转录相关记录90条 . 查询时间(0.338 秒)
2016年12月29日,北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在Nature Methods杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications”的综述论文(doi:10.1038/nmeth.4110)。表观转录组学(epitranscriptomics,又称“RNA表观遗传学”)是近年来兴起的前沿科...
生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的“分子桥梁”,控制DNA通过“转录”生成RNA。另外,DNA或染色质的修饰也能调控基因的转录,即表观遗传...
近日,记者从上海辰山植物园(中科院上海辰山植物科学研究中心)获悉,该园观赏植物资源与创新利用研究组的研究人员在荷花花蕾转录组分析及SSR标记开发开展研究中获得重要进展,相关研究结果已在线发表于学术期刊《公共科学图书馆·综合》。
2014年5月9日,中国科大生命科学学院蔡刚研究组在国际权威杂志《细胞研究》(Cell Research)在线发表了最新研究成果(“Redefining the Modular Organization of the Core Mediator Complex”),首次破解了“转录中央控制器”-中介体的模块化结构,颠覆了影响转录研究领域长达十余年的错误认识;对于揭示基因表达及其调控的分子机制,理解...
WRKY基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子, 参与植物许多生理生化过程, 如植物发育、代谢以及生物和非生物胁迫。目前, 已在多种植物中鉴定出WRKY基因家族, 但是关于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.) WRKY基因家族的系统分析鲜有报道。文章利用生物信息学方法, 从蒺藜苜蓿全基因组中共鉴定出93个WRKY基因, 包括81个标准的WRKY基因(19个Ⅰ型基因, 49个Ⅱ...
樟树(Cinnamomum camphora )是樟科植物的一个代表种, 具有材用、药用、香料、油用和生态环境建设等多种用途。叶精油中富含利用价值极高的樟脑、芳樟醇、1,8-桉叶油素、异-橙花叔醇和右旋龙脑等萜类化合物。依据叶精油中主要成分的种类和含量, 可将樟树划分为脑樟、芳樟、油樟、异樟、龙脑樟5种化学类型。文章采用Illumina HiSeq™ 2000高通量测序技术, 对5种化...
油桐是我国重要的木本油料植物, 过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种, 与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道。文章采用RNA-seq技术对油桐种子油脂合成的3个不同时期的转录组进行比较, 获得了大量差异表达的Unigene序列。在此基础上, 通过GO分类和Pathway富集性分析将这些差异表达Unigene归类于128个代谢途径, 其中包含与油脂合成相关的脂肪酸生物合成和甘油磷脂代谢...
间充质干细胞(Mesenchymal stem cells, MSCs)是一种多能性细胞, 可分化为软骨细胞、脂肪细胞、肌细胞等不同世系细胞。一些世系特异性转录因子, 如Runt相关转录因子2 (Runt related transcription factor 2, RUNX2)、过氧化物增殖子激活型受体γ (Peroxisome proliferator-activator receptor ...
第二代测序技术不仅推进了基因组学的研究, 而且也广泛应用到转录组学的研究中。原核生物转录组学的研究方法主要有Tiling芯片和RNA-seq, 后者因其较高的覆盖率和分辨率以及越来越低廉的成本而逐渐被更多的研究单位采用。根据对mRNA富集方法或rRNA去除方法的不同, 目前RNA-seq方法主要有6种, 其中dRNA-seq由于采用了5′单磷酸依赖的外切酶, 可以特异性地降解加工过的转录本, 从而...
YB类转录因子在调控逆境应答基因的表达起着重要的作用,是最大的植物转录因子之一。文章通过同源基因克隆方法和RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术,以毛竹幼苗为材料, 获得一个MYB类转录因子,命名PeMYB2。氨基酸序列分析表明,PeMYB2具有典型的R2R3-MYB特征,N端含有两个串联重复保守结构域, C端含有一个膜蛋白DUF3651; 进化树分析表明...
脊椎动物内耳发育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作为核心调控基因参与听基板的诱导过程。文章通过生物信息学方法,对小鼠内耳发育的核心转录因子进行保守性分析并研究其相互调控关系,得到小鼠内耳发育过程中核心转录因子的基因调控网络。与文献中已知的小鼠内耳发育基因调控关系相比, Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在内耳发育中仍...
HD-Zip转录因子属于Homeobox蛋白家族, 是植物特异转录因子, 由高度保守的HD(Homeodomain)结构域和Leu zipper(Zip)元件组成, 前者与DNA特异结合, 后者介导蛋白二聚体的形成。HD-Zip转录因子家族包括4个亚家族(HD-Zip Ⅰ-Ⅳ), 其成员通过与其他蛋白互作、参与激素介导的信号途径, 从而调控植物生长发育、光形态建成、花发育、果实发育和植物对逆境应答...
病原菌的侵染激发植物大量防御响应基因的表达, 其中转录因子在协调庞大的抗病防御网络中发挥重要作用。灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)是最具破坏力的死体营养型病原真菌之一, 在农业生产上造成严重的经济损失。文章综述了ERF(Ethylene response factors)、WRKY、MYB等家族中参与灰霉病防御反应的转录因子的功能研究进展。转录因子通过复杂的mRNA或蛋白水平的互作方...
非模式生物转录组研究     转录组  非模式生物  RNA-seq       2013/10/30
转录组代表细胞或组织内全部的RNA转录本(RNA transcripts), 反映不同生命阶段、不同组织类型、不同生理状态以及不同环境条件下表达的基因。转录组研究可以从整体水平上反映细胞中基因表达情况及其调控规律。非模式生物(Non-model organism)具有许多模式生物不具备的特征, 其转录组研究对解决基因进化、遗传育种以及生态等诸多方面的问题具有重要意义。但由于非模式生物缺乏参考基因组...
可诱导干细胞(iPS)的诱导过程伴随着体细胞表观遗传标签的去除和干性细胞表观遗传信号的建立。早期研究表明多种表观遗传修饰的抑制剂会显著增强iPS在四因子条件下的诱导效率,但是其机制需要深入探讨。

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