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基于CRISPR系统开发出的引导编辑系统（Prime Editing, PE）能够在基因组的靶位点处实现精准的片段插入、删除及碱基的任意替换，在基因治疗、育种改良、基础研究等方面展现出了巨大的应用前景。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组前期在水稻、小麦中建立并优化了植物引导编辑系统，实现了任意碱基精准的替换、增添或删除。然而在应用过程中，研究组也发现该系统依然存在效率偏低、设计复杂等问题...
昆明植物所研究团队发表被子植物系统发育基因组学与“生命之树”研究综述（图）
被子植物 系统发育 基因 生命之树
2023/5/14
达尔文根据共同祖先这一概念，提出可以将所有现存和已灭绝的生物门类和物种联系起来，描绘出“生命之树（Tree of Life）”，这也是他的名著《物种起源》唯一的插图。随着分子系统发育研究的兴起，重建一个反映真实物种亲缘关系的“生命之树”并阐述其起源与演化式样一直是生命科学研究的热点问题，也是生命科学其它分支学科研究的重要基础。
中国科学院上海营养与健康研究所发表新型RNA精准编辑系统（图）
新型RNA 精准编辑系统 基因工程
2022/8/31
2022年8月27日，中国科学院上海营养与健康研究所王泽峰团队在Nucleic Acids Research上，发表长文Programmable RNA base editing with a single gRNA-free enzyme。该研究报道了一种单一组分的新型可编程RNA单碱基编辑系统REWIRE（RNA editing with individual RNA-binding enzy...
中山大学骆观正团队利用CROss-seq技术系统鉴定多个CRISPR工具的脱靶效应（图）
骆观正 脱靶效应 基因编辑
2022/11/30
自从科学家们研究清楚CRISPR-Cas系统的作用机理并将其应用于真核细胞的基因编辑后，相关工具的开发、改造和应用呈爆发式增长，成为生物学研究的重要手段。目前主要的CRISPR编辑工具有Cas9、Base editor (BE)和Prime editor (PE)，及衍生的各种工具。CRISPR编辑工具在基因功能研究、转录调控、表观遗传修饰和基因治疗等众多研究领域具有重要应用和广阔前景。但是，CR...
CRISPR-Cas13是一类由RNA介导的靶向RNA的基因编辑技术。Cas13蛋白属于2类VI型多结构域单一蛋白RNA内切酶。体外研究表明Cas13蛋白激活后具有切割靶RNA的功能，并能对其周围的任意RNA（bystander RNA）进行非特异性地切割，这一特性用于开发RNA检测。2015年报道Cas13a(c2c2)以来，国内外报道了一批CRISPR-Cas13系统（Cas13b/c/d/X...
氮参与蛋白质、核酸等生命必需生物大分子的合成，是生物体中至关重要的成分。生物圈中的氮循环是氮的生物地球化学循环的重要组成部分之一。随着农业和畜牧业的发展，大量畜禽粪便和农作物秸秆被闲置、浪费，并被称为“农业废弃物”。种养循环技术模式是促进营养物质循环利用、提高农牧业生产效率的重要农业生产方式。然而，到目前为止，种养循环系统中关于氮循环效率及其调控的研究还非常薄弱。为此，中国科学院东北地理与农业生态...
蛋白质合成与降解间的平衡，对于维持细胞内稳态及机体的正常功能具有重要作用。泛素-蛋白酶体途径是真核细胞中蛋白降解的主要途径之一，目标蛋白的泛素化修饰由泛素活化酶（E1）、泛素结合酶（E2）和泛素连接酶（E3）协同完成。SCF （SKP1/Cullin1/F-box）E3连接酶是一类多亚基RING E3连接酶，由SKP1蛋白、Cullin1蛋白、RBX1蛋白和可变的F-box蛋白组成，广泛存在于真核...
蛋白质合成与降解间的平衡，对于维持细胞内稳态及机体的正常功能具有重要作用。泛素-蛋白酶体途径是真核细胞中蛋白降解的主要途径之一，目标蛋白的泛素化修饰由泛素活化酶(E1)、泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)协同完成。SCF (SKP1/Cullin1/F-box) E3连接酶是一类多亚基RING E3连接酶，由SKP1蛋白、Cullin1蛋白、RBX1蛋白和可变的F-box蛋白组成，广泛存在于真...
五邑大学建立新型安全高效的单碱基基因编辑系统（图）
五邑大学 单碱基 基因编辑系统 TALE
2023/5/10
单碱基编辑技术以其高效和精确的基因编辑能力，成为目前最有希望治愈各种遗传疾病的明星工具。但由于Cas9蛋白本身存在的Cas9依赖性脱靶一直无法解决，人们依然对其临床应用的安全性表示担忧。近日，五邑大学生物科技与大健康学院张焜教授、广东省医学大动物模型重点实验室赖良学研究员和邹庆剑副教授团队合作，以五邑大学为第一单位在MolecularTherapy（IF：11.45）在线发表了题为“Elimina...
江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室基因编辑团队在Plant Biotechnology Journal发布论文，系统评估了PAM松弛型CRISPR-Cas9植物基因组编辑工具的脱靶效应，提示ABE8e存在高比例脱靶
CRISPR-Cas9 基因编辑 水稻 脱靶效应
2023/8/9
CRISPR-Cas9基因编辑工具凭借其高效、易用、灵活特性极大的改变了传统育种手段，研究人员为了扩大其靶向范围，设计了一系列SpCas9变体，包xCas9（识别5′-NG-3′、5′-GAA-3′、5′-GAT-3′ PAM）、SpCas9-NGv1和SpCas9-NG（识别5′-NG-3′ PAM）以及PAM-less SpRY然而，这些PAM-relaxed Cas9核酸酶是否会造成向导RN...
一直以来，甘肃、青海、宁夏、内蒙和东北等地鼠害严重，对农作物、树木和草皮造成大面积破坏。过去五十年来，当地群众一直采用地箭射杀或者投毒等手段进行鼠害控制，但是无法有效控制其种群密度。地箭射杀成功率低，耗费大量的人力物力财力；投毒会误杀以其为食的物种，破坏食物链平衡，药物也会造成土壤、地下水污染，危害人类健康，与保护环境的基本国策和“两山论”相悖，急需寻找科学有效地控制害鼠种群大小的方法。
壳斗科植物系统基因组学研究取得进展（图）
壳斗科植物 系统基因组学 新生代
2022/9/22
新生代（Cenozoic）以来，全球气候变化导致北半球森林的组成发生剧烈演变。全球壳斗科植物有900多种，是目前北半球落叶阔叶林和常绿阔叶林的建群种，具有重要的生态地位。探究壳斗科物种多样性的形成过程和驱动机制，对阐释北半球森林生态系统的演化具有重要意义。
本发明实施例涉及一种全密闭细胞基底拉伸和流动剪切复合加载实验系统，能够实现对常规培养数量细胞的基底进行拉伸和流动剪切复合加载，并能够定量控制加载参数，自动化操作。利用电机带动驱动机构拉动两端拉杆，通过编程设定拉伸变形比例、拉伸速度、往复拉伸频率，即可实现定量控制的静态或动态拉伸。利用蠕动泵驱动培养液，通过设定蠕动泵流量即可实现定量控制的流动剪切。通过编程设定分别设定基底拉伸和流动剪切的作用时间即可...
复旦大学高分子科学系丁建东课题组揭示微纳米图案化表面的临界细胞黏附面积，并首次系统总结不同纳米间距对细胞黏附的调控作用（图）
微纳米图案化表面 临界细胞黏附面积 不同纳米间距 调控细胞黏附
2022/7/1
细胞与细胞外基质（ECM）的黏附对细胞的生理和病理过程至关重要，揭示仿ECM的生物材料表面的细胞黏附规律、尤其是相关调控细胞行为的nanocue，对于组织工程、再生医学和肿瘤靶向等均有重要的基础意义，也是指导面向生物医学和生物技术应用的新型材料设计的关键之一。
