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加拿大开发出DNA条形码融合技术
加拿大 DNA条形码融合技术
2016/4/28
据最新一期《分子系统生物学》报道，加拿大研究人员开发出一种新技术，可将DNA（脱氧核糖核酸）条形码拼接在单个细胞内，以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。
近年来，DNA条形码技术使科学家开展高并行试验（许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验）成为可能，而新一代DNA测序技术的发展，进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。
2015年8月21日，中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心研究员杜嘉木在国际学术期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology上发表了题为DNA methylation pathways and their crosstalk with histone methylation 的第一作者综述论文。该文系统性地总结了近年来在DNA甲基化和组...
How DNA ‘Proofreader’ Proteins Pick and Edit Their Reading Material
DNA Proofreader Proteins Pick Reading Material
2015/9/9
DNA mismatch repair (MMR) identifies and corrects errors made during replication. In all organisms except those expressing MutH, interactions between a DNA mismatch, MutS, MutL, and the replication pr...
Metnase is a novel bifunctional protein that contains a SET domain and a transposase domain. Metnase contains sequence-specific DNA binding activity and sequence non-specific DNA cleavage activity, as...
ELUCIDATING THE ROLE OF REDOX EFFECTS AND THE KU80 C-TERMINAL REGION IN THE REGULATION OF THE HUMAN DNA REPAIR PROTEIN KU
DNA-PKcs regulation Ku NHEJ
2015/5/25
DNA double strand breaks (DSB) are among the most lethal forms of DNA damage and can occur as a result of ionizing radiation (IR), radiomimetic agents, endogenous DNA-damaging agents, etc. If left unr...
Determining molecular mechanisms of DNA Non-Homologous End Joining proteins
DNA repair non-homologous end joining
2015/5/25
DNA double strand breaks (DSB), particularly those induced by ionizing radiation (IR) are complex lesions and if not repaired, these breaks can lead to genomic instability, chromosomal abnormalities a...
New lab technique simultaneously reveals structure and function of proteins critical in DNA repair
structure and function proteins critical DNA repair
2015/4/29
By combining two highly innovative experimental techniques, scientists at the University of Illinois at Urbana-Champaign have for the first time simultaneously observed the structure and the correlate...
为了优选快速、 灵敏、 特异的家蚕微孢子虫Nosema bombycis分子检测方法和DNA抽提方法， 本文通过对家蚕微孢子虫TaqMan探针荧光定量PCR检测方法和SYBR Green荧光定量PCR检测方法的建立以及反应体系优化， 并与普通PCR方法进行比较； 再采用4种不同DNA抽提方法分别对PCR和实时荧光定量PCR方法检测家蚕微孢子虫悬浮液的效果评价。结果显示: 不经过DNA抽提， 直接将...
SUMO与复制蛋白A复合物协同修复DNA
SUMO 蛋白A 复合物 修复DNA
2010/8/17
美国德州大学MD安德森癌症中心的科学家首次指出，小泛素相关修饰物SUMO可以与复制蛋白A（RPA）复合物结合在一起，促进DNA的修复。相关研究成果发表在《分子细胞》（Molecular Cell）杂志上。RPA70是名为RPA复合物的多蛋白机制的一种组成成分。RPA复合物在DNA复制与修复中扮演着重要角色。研究人员发现，当一部分细胞DNA复制发生时，RPA70与SUMO特异性蛋白酶——SENP6紧...
科学家已经观察到一个人类细胞中单个基因的表达。而对基因表达的实时动态掌握也许能帮助研究者来解释致癌过程中基因特征不同的细胞之间的差异，以及相关的分子进程。
基于小波变换的蛋白质与DNA相互作用的计算机预测
共鸣识别模型 离散小波变换 蛋白质与DNA相互作用 信噪比
2013/12/9
蛋白质与DNA的相互作用在细胞的转录调控和DNA修饰等活动中至关重要.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质与DNA的相互作用，运用小波变换找出阳性数据和随机数据的信噪比分布的差异，并通过阈值的选取达到了较好的预测结果.同时，将阳性数据与相应复合物的序列进行序列联配，找到了保守位点，进而从结合位点的角度验证了本方法的正确性.
美国冷泉港实验室科学家发现了一个已知DNA复制的关键激活蛋白质是如何在细胞中诱导这个过程的。这个蛋白质，称为DDK（Ddf4依赖性蛋白激酶），是一种酶，能够将一个磷酸盐分子附在其它蛋白质上来改变它们的活性。冷泉港实验室的研究小组发现，DDK执行的这项操作称为磷酸化，作用在一个称为Mcm4的蛋白质上，特定是在一个域上进行，这个域就像一个内嵌的刹车装置，能够防止DNA双螺旋结构出现松散情况。这个由DD...
R-藻红蛋白介导的光敏反应对DNA分子的生物学效应
藻红蛋白 肿瘤光动力治疗 DNA合成
2008/10/22
藻红蛋白(phycoerythrin, PE)是海藻中的重要捕光色素蛋白，具有强荧光性，易溶于水.在藻体内能将捕获的光能传递给光合反应中心; 在体外则能将光能传递给周围环境中的氧分子，产生如单线态氧等活性氧组分，可用来介导光动力效应治疗癌症.将纯化的藻红蛋白加入到瘤细胞培养基中，数小时后，采用488 nm波长的氩离子激光辐照，MTT法检测细胞存活数，计算细胞存活率. 3H-TdR掺入实验观察细胞D...
摘要在后基因组时代，DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比，染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是一种在体内研究DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与DNA芯片和分子克隆技术相结合，可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况，这将有助于深...