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南京农业大学农学院《Molecular Plant》发表万建民院士团队“The RNA binding protein EHD6 recruits the m6A reader YTH07 and sequesters OsCOL4mRNA into phase-separated ribonucleoprotein condensates to promote rice flowering”(图)
万建民 蛋白 相分离过程
2024/6/11
2024年5月9日,万建民院士团队与北京大学贾桂芳团队合作在Molecular Plant发表了题为The RNA binding protein EHD6 recruits the m6A reader YTH07 and sequesters OsCOL4mRNA into phase-separated ribonucleoprotein condensates to promote ric...
2023年9月18日,中国科学院上海营养与健康研究所翟琦巍研究组在国际学术期刊Nature Communications在线发表了题为“Discovery of the major 15-30 nt mammalian small RNAs, their biogenesis and function”的研究论文。该研究通过生化分析、新型高通量测序等多种分析鉴定技术,发现了哺乳动物中长度为15-3...
2022年2月28日,Developmental Cell在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室张蘅研究组与中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪研究组合作的题为“Liquid-liquid phase separation of RBGD2/4 is required for heat stress resistance in...
基因如何在恰当的时间和组织器官中正确表达是现代生物学的核心问题,RNA介导的染色质沉默在其中起到了关键作用。然而囿于研究手段,到目前为止,人们对这一过程具体机制的了解还很有限。在模式植物拟南芥中,抑花基因FLC是研究RNA介导的染色质沉默的经典模型。
遗传物质相同的雌性蜜蜂幼虫,因食物不同而发育为两个迥异的社会级型:蜂王和工蜂。蜜蜂级型分化一直是科学界的研究热点,至今仍未完全阐释其机理。DNA表观遗传学被发现参与此过程,但RNA表观遗传学是否对其具有调控功能至今未有报道。近日,北京大学化学与分子工程学院贾桂芳课题组与中国农业科学院蜜蜂研究所吴黎明团队和中山大学骆观正团队合作,首次发现RNA修饰 N 6-甲基腺嘌呤(m6A)在蜜蜂发育和级型分化中...
近期,清华大学生命学院方显杨课题组与美国南加州大学化学系Peter Z. Qin教授课题组针对现有长链RNA位点特异性自旋标记技术的局限性,合作建立了长链RNA位点特异性自旋标记新方法及其应用。该标记策略的成功建立将促进电子顺磁共振技术在长链RNA的结构与动态特性研究中的应用,并推动建立长链RNA的整合结构生物学研究方案。
复旦大学生物医学研究院顾宏周团队与合作者发现非编码Riboswitch RNA可通过同时感应SAM和tRNA配体精确调控基因表达(图)
复旦大学生物医学研究院 顾宏周 非编码 Riboswitch RNA可 SAM RNA配体 核糖开关 基因表达
2020/6/24
核糖开关(Riboswitches)是一类非编码RNA元件,主要存在于细菌mRNA的5′非编码区(5′UTR),通常由适配体(aptamer)和表达平台(expression platform)两个功能域组成。当特定分子(ligand,配体)结合适配体域时,会引起表达平台域的局部构象发生变化,从而打开或关闭下游基因的表达。核糖开关广泛存在于细菌中,它们在细菌的硫代谢、辅酶合成、氨基酸合成等基础代谢...
在国家自然科学基金委、科技部和中国科学院的支持下,中科院化学研究所分子识别与功能重点实验室研究员程靓团队长期从事该领域的基础研究,发展了一系列针对重要RNA表观遗传修饰的高选择、高灵敏、时空分辨的化学转化、荧光标记的原理和方法。他们前期报道了首例在蓝光照射下,维生素B2选择性促进核苷水平的m6A去甲基化研究(Chem. Commun. 2017, 53, 10734),为后续在细胞水平调控m6A奠...
北京大学化学与分子工程学院何川/贾桂芳课题组报道RNA修饰m6A去甲基酶FTO对多种RNA修饰底物的去甲基分子机理(图)
北京大学化学与分子工程学院 何川 贾桂芳 课题组 RNA修饰m6A 去甲基酶FTO 去甲基分子机理
2019/2/25
近日,北京大学化学与分子工程学院的何川/贾桂芳课题组在Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America(PNAS)在线发表了题为“Structural insights into FTO’s catalytic mechanism for the demethylation of mult...
2016年2月10日,北京大学生命科学学院伊成器研究组在《自然·化学生物学》(Nature Chemical Biology)杂志在线发表题为“Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N1-methyladenosine methylome”的研究论文(DOI: 10.1038/NCHEMBIO.2040)。文章首次报道了...
中科院上海生科院营养科学研究所研究员翟琦巍小组在一项研究中,建立了一种同时检测单个RNA样品中超过40种核苷的方法,发现小鼠肝脏小RNA中存在多种修饰,并初步发现小RNA修饰和糖尿病存在相关性。相关论文在线发表于《分析化学》。
通过紫外-可见光谱和荧光光谱滴定、稳态荧光猝灭和溴化乙啶竞争键合实验研究了Ru(Ⅱ)配合物[Ru(bpy)(H2iip)2](ClO4)2{bpy=2,2′-联吡啶, H2iip=2-(吲哚-3-基)-咪唑[4,5-f][1,10]-邻菲罗啉}的酵母RNA键合性质. 结果表明, 二者键合模式为嵌入键合, 其键合常数为7.09×106 L/mol, 比小牛胸腺DNA的键合常数大, 且比同类配合物[R...
生物质谱技术及其在RNA检测中的应用
质谱技术 RNA/蛋白相互作用 核酸定量 RNA转录后修饰
2010/2/23
生命科学的需求促进质谱技术的发展,现代的质谱技术为生命科学研究提供丰富的检测手段,本文重点介绍生物质谱技术的特点、性能以及质谱技术的进展;及质谱技术在RNA研究领域的方法学,包括核酸的纯化方法、核酸的离子化技术、核酸的分子量检测技术和核酸质谱数据的解析方法及其软件;以及质谱在核酸领域的具体应用,包括质谱在测序、定量、转录后修饰、核酸的指纹识别、蛋白和核酸相互作用等方面的应用。