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中国科学院上海营养与健康研究所邵振研究组建立用于多样本ChIP-seq数据分组定量比较的MAnorm2计算模型（图）
邵振 多样本ChIP-seq 数据分组 定量比较 MAnorm2 计算模型
2020/12/2
2020年11月19日，Genome Research在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所中科院计算生物学重点实验室（马普伙伴计算生物学研究所）邵振课题组的方法学论文“MAnorm2 for quantitatively comparing groups of ChIP-seq samples”，报道了其开发的新一代MAnorm2计算模型。该模型能够对多样本ChIP/ATAC-seq数据按照特...
Organ-on-a-chip mimics heart’s biomechanical properties
Organ-on-a-chip mimics heart biomechanical properties
2017/3/14
The human heart beats more than 2.5 billion times in an average lifetime. Now scientists at Vanderbilt University have created a three-dimensional organ-on-a-chip that can mimic the heart’s amazing bi...
近日，华南师范大学生物光子学研究院2013级博士研究生舒博文同学在微纳流控领域顶级期刊 Lab on a Chip上发表了原创性研究论文“A handheld flow genetic analysis system (FGAS): towards rapid, sensitive, quantitative and multiplex molecular diagnosis at the poi...
活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能，识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据，提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集，然后对核心集和粗糙集进行判别，最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中，得到了一些具有显著生物学意义的基因转...