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上海应物所等在DNA双螺旋结构介导的电荷传递方面获进展（图）
DNA双螺旋 电荷传递 单分子层
2012/9/28
电荷如何沿着DNA双螺旋结构传递是引起广泛关注和争议的问题，它对于生物电子学的发展具有重要意义，并预示着通过DNA构建分子电路的前景。近期，中国科学院上海应用物理所物理生物学实验室通过与美国亚利桑那州立大学和上海微系统与信息技术研究所传感技术联合国家实验室合作，发展了一种固定在金电极表面的三维DNA纳米结构框架，为DNA双螺旋结构介导的界面电荷耦合传递提供了新的证据。研究DNA双螺旋结构介导的界面...
DNA拓扑异构酶Ⅱ的多态转换模型
DNA拓扑异构酶Ⅱ 主方程 稳态 无机磷
2011/7/29
DNA拓扑异构酶Ⅱ是一种分子马达，它利用ATP水解产生的化学能，切断一条双链DNA片段(G segment)，并让另一条双链DNA片段(T segment)从缺口处通过。对DNA拓扑异构酶Ⅱ的工作循环研究将有助于阐明其工作机理。本文根据已有实验资料，利用主方程方法构建了DNA拓扑异构酶Ⅱ状态转变的随机跃迁模型，求得系统各态的稳态解。进而推导出稳态下无机磷(Pi)浓度随时间的变化，得到DNA拓扑异构...
p53-Mdm2相互作用在DNA损伤的细胞响应方面起着非常重要的作用。最新实验结果表明，在受到各种辐射损伤而引起DNA损伤后，细胞中的p53蛋白浓度在单体细胞和群体细胞情况下，表现为非衰减振荡和衰减振荡两种不同的动力学行为。通过研究p53 -Mdm2负反馈回路的非线性动力学，分析了各种（特别是DNA损伤，p53和Mdm2浓度三者之间的）动力学关系，提出了一个能同时描述这两种不同动力学行为的非线性模...
DNA计算机是计算机科学和分子生物学互相结合、互相渗透而产生的新兴交叉研究领域.目前已取得较大进展.DNA计算机是以编码的DNA序列为运算对象，通过分子生物学的运算操作以解决复杂的数学难题.DNA计算机的重要特点是信息容量的巨量性和密集性，和处理操作的高度并行性，通过强力搜索策略迅速得出正确的答案，从而使其运算速度大大超过常规计算机的计算速度.介绍了DNA计算机的近期进展和工作原理及其分子生物...
考虑碱基对之间的非紧邻相互作用、涨落的序列依赖效应和非对称涨落,提出了DNA构象的统计力学模型,给出了DNA柔性的新定义。作为模型的应用,对12种三核苷酸重复序列的动力学柔性作了预测。理论预测与其它方法得到的结论比较,有很好的一致性。对模型和结论的理论意义作了讨论。A STATISTICAL-MECHANICAL MODEL OF DNA FLEXIBILITYA statistical-mech...