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中国科学院地理科学与资源研究所专利:植物根系动态监测系统
Journal of Systematics and Evolution (JSE) 2024年第3期发表了海南大学王华锋教授团队题为“New insights into infrageneric relationships of Lonicera (Caprifoliaceae) as revealed by nuclear ribosomal DNA cistron data and plas...
东南亚是全球生物多样性最为丰富的地区之一,该地经历了中新世以来复杂的地质气候变迁,其生物多样性演化历史备受生物地理学研究的关注。兰科兰属(Cymbidium Sw.)是东南亚的代表类群,主要分布在中国西南山地至东南亚群岛,延伸可分布至澳大利亚东北部,约60余种。其中,兰属中的春兰、建兰、寒兰等地生兰被称为“国兰”,具有非常高的经济和观赏价值。由于早期研究取样比例低或基因序列信息位点不足...
东南亚是全球生物多样性最为丰富的地区之一,该地经历了中新世以来复杂的地质气候变迁,其生物多样性演化历史备受生物地理学研究的关注。兰科兰属(Cymbidium Sw.)是东南亚的代表类群,主要分布在中国西南山地至东南亚群岛,延伸可分布至澳大利亚东北部,约60余种。其中,兰属中的春兰、建兰、寒兰等地生兰被称为“国兰”,具有非常高的经济和观赏价值。由于早期研究取样比例低或基因序列信息位点不足...
水穗草科(Hydrostachyaceae)是非洲特有的激流植物类群,由于其特殊的形态特征和变异较大的DNA序列,很难找到与其亲缘关系较近的其它植物类群。历史上水穗草科曾被放在三个关系相差很远的类群中——金虎尾目(Malpighiales)、唇形目(Lamiales)和山茱萸目(Cornales),其在被子植物中的系统位置一直以来存在较大争议。
小麦是全世界主要的粮食作物之一,其产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量,是育种改良地重要的选择性状,挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制,对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚,穗发育关键基因挖掘及作用机制的研究尚处于初步阶段。 2024年2月4日,中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组通过结合多...
硫(S)元素在自然界中广泛分布,是植物生长发育所必需的功能元素之一,对于维持植物正常的生命活动和生态系统功能和稳定性具有重要作用。目前对于元素生物地理格局的研究主要局限于碳、氮、磷三种大量元素或单一的植物器官(如叶或根),对硫的研究也大多限制于特定地区的有限物种,对基于自然群落的不同尺度、物种、器官的硫含量、硫密度和硫储量的空间格局与调控机制仍不清楚。此外,采用全面、准确和匹配的数据集是提高区域或...
实蕨属是一个泛热带属,主要分布于亚洲和大洋洲岛屿,具有匍匐或短直立的根茎,其叶片顶部常具芽胞,可着地生根行无性繁殖,并具有二形叶片,喜生于山谷水沟旁、密林下阴湿处或攀附于岩石或树干基部,是林下植被的重要组成部分。本属曾被归入实蕨科Bolbitidaceae、舌蕨科Elaphoglossaceae、藤蕨科Lomariopsidaceae中,目前被广泛接受为鳞毛蕨科Dryopteridaceae舌蕨亚...
随着越来越多的基因序列被运用于系统发育重建中,基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题,同时也是进化生物学家面临的重要挑战。基因树冲突主要是指物种在不同DNA序列所构建的系统发育树上,系统学位置的不一致。已有的研究表明,大量生物类群均存在基因树冲突现象,如植物类群的壳斗科(Fagaceae)、蔷薇科(Rosaceae)、苋科(Amaranthaceae s.l)以及动物类群的两栖动物(Am...
随着越来越多的基因序列被运用于系统发育重建中,基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题,同时也是进化生物学家面临的重要挑战。基因树冲突主要是指物种在不同DNA序列所构建的系统发育树上,系统学位置的不一致。已有的研究表明,大量生物类群均存在基因树冲突现象,如植物类群的壳斗科(Fagaceae)、蔷薇科(Rosaceae)、苋科(Amaranthaceae s.l)以及动物类群的两栖动物(Am...
2023年7月28日,中国科学院武汉植物园东非植物区系与分类学科组的科研人员经过全面的资料查询和数据整理,利用质体基因组测序、组装、注释和构建分子系统发育树等手段,对鞭寄生科(Hydnoraceae)鞭寄生属(Hydnora)植物开展了系统发育研究。相关成果以“Phylogenetic and comparative analyses of Hydnora abyssinica plastomes...
自然杂交在植物中广泛存在。杂交通常伴随着染色体组加倍,即异源多倍化事件。杂交和多倍化都可以对植物的适应性进化及物种形成产生重要影响,一直以来是进化生物学领域的研究热点。近年来,系统发育基因组学的广范应用及快速发展为植物(尤其是一些快速分化的植物类群)的系统发育及进化历史研究提供了很好的机遇。
近日,中国科学院昆明植物研究所科研人员与华盛顿大学Richard Olmstead展开合作,对亚洲醉鱼草属植物进行了全面的取样和物种倍性信息测定,同时利用浅层测序数据,对亚洲醉鱼草属植物每个样品进行了叶绿体全基因组组装、nrDNA序列构建、低拷贝核基因构建以及单核苷酸多态性(SNP)的挖掘。本研究通过核质冲突、基因树不一致、贝叶斯聚类等分析方法结合物种倍性信息,推测了亚洲醉鱼草属植物复杂的的网状演...
中国科学院华南植物园研究员葛学军与华南农业大学博士姚纲、英国邱园博士William J. Baker等多家单位研究人员展开合作,基于对棕榈科在属级层面近乎全面的取样并采用叶绿体系统发育基因组学分析,在棕榈科属级层面系统发育基因组学研究方面取得新进展。相关研究发表于BMC Biology。
2023年来,系统发育基因组学(Phylogenomics)的广泛应用为众多疑难生物类群系统关系的解析提供了极大帮助,进一步深化了人们对于“生命之树”(Tree of Life)的理解与认识。对于被子植物(有花植物)类群,大量系统发育基因组学研究的开展使得目与科级水平的系统关系不断解析并逐渐稳定,然而对于科下属级水平的研究还存在较大欠缺,尤其对于被子植物中的一些大科,目前相关研究主要集中于对亚科与...

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