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基于PCR-DGGE和拟杆菌(Bacteroides)16S rRNA的岩溶地下水粪便污染来源示踪研究:以重庆南山老龙洞地下河系统为例
岩溶地下水 粪便污染 大肠菌群 拟杆菌 PCR-DGGE
2016/12/7
岩溶地下水的微生物污染日益严重,其来源的研究得到国际学术界的广泛关注.本研究以重庆南山老龙洞岩溶地下河系统为对象,采用滤膜法监测地下水中的总细菌、大肠杆菌、粪大肠菌及粪链球菌等微生物指标,以拟杆菌(Bacteriodes)为指示细菌,采用PCR-DGGE示踪地下水中大肠杆菌/粪大肠杆菌的来源.结果表明,老龙洞地下河流域各类细菌含量严重超标,总细菌数为10~2.9×107CFU·mL-1,大肠菌群总...
逆转录定量PCR选择性检测环境样品中的活性分枝杆菌
RT-qPCR 分枝杆菌 活性菌 环境样品
2015/3/9
以分枝杆菌(Mycobacterium spp.)为研究对象,建立了一种逆转录定量PCR(Reverse transcription quantitative PCR,RT-qPCR)方法,选择性检测环境样品中的活性分枝杆菌.研究结果表明,稳定期(48~144 h)分枝杆菌细胞内hsp65基因的RNA转录稳定,单位细胞内hsp65的cDNA含量约为1拷贝,以此作为活性分枝杆菌的定量依据,达到快速确...
水传病原微生物PCR-纳米金显色快速检测方法
水传病原微生物 DNA检测 紫外可见光谱 PCR反应
2014/8/5
水传病原微生物是腹泻等肠胃疾病发病的主要原因,而发展快速、有效的检测方法对于控制和减少该类微生物的传播风险十分重要.因此,本文研究了PCR反应结合不修饰的纳米金颗粒(Gold nano-particles, AuNPs)显色检测方法的最佳盐浓度、探针含量、PCR反应条件等,并从纳米金制备、病原菌种类、检测特异性等方面进行考核,确定了最优检测条件为:10 μL PCR扩增产物混合20 pmol探针,...
生物强化SBR系统中苯胺降解菌Pseudomonas otitidis strain JY9在降解苯胺废水过程中发挥重要作用.本研究根据该菌株的邻苯二酚1,2双加氧酶(C12O)的基因序列,设计特异引物,扩增特异片段并克隆到PGM-T载体中,以此重组质粒为参照,系统活性污泥中提取的总DNA为模板,应用实时荧光定量PCR方法定量检测该菌在苯胺废水生物强化SBR系统中的丰度变化.同时应用高效液相色谱法...
生物强化SBR系统中苯胺降解菌Pseudomonas otitidis strain JY9在降解苯胺废水过程中发挥重要作用.本研究根据该菌株的邻苯二酚1,2双加氧酶(C12O)的基因序列,设计特异引物,扩增特异片段并克隆到PGM-T载体中,以此重组质粒为参照,系统活性污泥中提取的总DNA为模板,应用实时荧光定量PCR方法定量检测该菌在苯胺废水生物强化SBR系统中的丰度变化.同时应用高效液相色谱法...
采用Biolog和PCR-DGGE技术对椒江口6个站位表层沉积物群落水平的微生物代谢功能和以16S rRNA基因标记的细菌遗传多样性进行分析,并对其代谢功能和群落结构与沉积物污染物等参数进行冗余梯度分析(Redundancy gradient analysis,RDA)和典范对应分析(Canonical correspondence analysis,CCA).Biolog分析结果表明,微生物群落...
Semi-Quantitative PCR for Quantification of Hepatotoxic Cyanobacteria
Cyanobacteria Microcystis Competitive PCR mcyB cpcBA
2013/3/11
Blooms of microcystin-producing cyanobacteria are a problem worldwide. Microcystin is a liver hepatotoxin commonly found in bodies of water and is produced mainly by the genus Microcystis. The aim of ...
实时荧光定量PCR对A2/O短程硝化系统内氨氧化菌的定量分析
实时荧光定量PCR 氨氧化菌 A2/O工艺 短程硝化
2012/10/31
通过控制好氧区低DO浓度以及缩短好氧实际水力停留时间(actual hydraulic retention time,AHRT),在处理低C/N比实际生活污水的A2/O工艺中,成功启动并维持了短程硝化反硝化;系统亚硝酸盐积累率稳定维持在90%左右,氨氮去除率在95%以上。通过提取富集氨氧化菌(ammonia oxidizing bacteria,AOB)的基因组DNA,经两次常规PCR扩增和琼脂糖...
PCR-DGGE技术解析A2/O工艺好氧单元中微生物群落结构
PCR-DGGE 活性污泥系统 微生物群落结构 优势菌
2012/6/19
GE方法,追踪了汉沽工业废水处理中好氧工艺的活性污泥系统中微生物群落结构动态变化过程及其微生物群落结构组成。研究结果表明:系统中的微生物群落结构随水质变化而变化,随着培养时间的延长,微生物群落结构趋于稳定,分别属于5大类群,与γ、δ、α、ε变形杆菌(Proteobacterias)、芽孢杆菌(Bacilli)的亲缘关系较近。其中γ变形杆菌是该废水处理过程中的主要菌群,包括Pseudomonas s...
PCR-DGGE技术用于处理苯乙烯废气的生物滴滤塔中微生物优势菌种解析
恶臭废气 苯乙烯 PCR-DGGE 微生物
2012/6/20
采用生物滴滤塔能够有效去除含苯乙烯恶臭气体,塔内微生物中含有大量的球菌和杆状菌。采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究处理苯乙烯恶臭气体的生物滴滤塔填料表面的微生物,结果表明,去除苯乙烯生物滴滤塔中有5种菌为降解苯乙烯的优势菌种;通过16S rDNA基因扩增测序同源性比对,结果显示嗜甲基杆菌属(methylophilus)丰度为50.5%,2种变形菌属(alpha pro...
研究了温度对A2/O装置中硝化细菌群落结构的影响,旨在为工艺改进及优化调控提供依据.从A2/O装置的泥水混合液中采集微生物样品并提取微生物总DNA,使用特定引物对从总DNA中扩增出目标DNA片段,然后对扩增的DNA片段进行DGGE,并对凝胶进行染色和条带统计分析,通过聚类分析构建不同温度下硝化菌群间的相似性关系.结果表明,AOB菌在温度>25 ℃时,群落结构比较稳定,此时NH4+-N去除率高达95...
采用套式PCR检测水库产毒微囊藻
微囊藻 套式PCR 水库 微囊藻毒素
2009/6/3
根据所测定的微囊藻毒素合成酶mcyB基因的部分核苷酸序列,设计并筛选出两对特异性引物,用于产毒微
囊藻的套式PCR检测。套式PCR针对毒素基因的检测结果与ELISA针对微囊藻毒素的检测结果相一致,但灵敏度
更高。套式PCR的检测下限达1一lO个微囊藻细胞/反应。采用套式PCR对广东l2个主要供水水库的247份水样
进行了产毒微囊藻检测,共检出阳性水样82份,阳性率为33.2% 。这些阳性水样...
采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术对脱臭生物滤池中填料生物膜微生物群落结构进行了研究.生物滤池对臭气中的污染物随驯化时间逐渐增强,去除率从50%升高到89%.对2种填料树皮和秸秆上生物膜的分析结果表明,滤池内微生物多样性随运行时间先降后升,从1.6~1.9上升到2以上;而2种填料上微生物的相似性逐渐增加,表明随着驯化进程,生物填料上的微生物能够利用臭气污染物进行生长,并随运行时间逐渐趋于丰...