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寄生原生动物线粒体与适应性进化
寄生原生动物 线粒体 多样性 适应性进化
2010/4/20
真核生物的线粒体一般具有一定的典型的结构和功能。然而，在单细胞的寄生原生动物中却不断发现从数量、结构到功能均与典型线粒体明显不同的线粒体，表现出线粒体的巨大可塑性和丰富的多样性。该文对寄生原生动物中这些多样的线粒体进行了概述，并对形成这种多样性的根本原因，即这些生物对寄生生活微氧或无氧环境线粒体所发生的种种适应性进化进行了分析探讨。
甲胎蛋白分子演化的生物信息学分析
甲胎蛋白 类白蛋白基因家族 生物信息学 进化
2009/11/19
甲胎蛋白（AFP）是类白蛋白家族成员蛋白之一，在生物个体发育以及肝癌发生发展中起重要作用. 为了研究AFP的系统发生，并以此探讨系统发育与个体发育的关系，运用生物信息学手段，分析了不同物种中类白蛋白家族成员的进化关系，并对各分子的白蛋白结构域进行了进化归类.同时，对不同物种的白蛋白（ALB）和AFP之间包含启动子、抑制子和增强子在内的约14?kb的核苷酸序列进行了比较分析. 研究从系统发育的角度阐...
羚牛线粒体DNA和系统进化研究
羚牛 线粒体DNA 多态性 系统进化
2009/10/28
用8种限制酶分析了5种牛科动物，羚牛、黄牛、水牛、绵羊和山羊的线粒体DNA 的多态性。依据数学模型计算这5种动物间的遗传距离，在此基础上构建了UPG 和NJ两种分子系统进化树。结果表明：羚牛与牛和羊的分化时间分别为4．02 Ma和3．72 Ma，因此将羚牛归入羊亚科较为合理。
鸡球虫mt COⅠ基因片段序列的克隆与系统学分析
鸡 球虫 艾美耳球虫 细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基 序列分析 系统进化
2009/8/27
利用扩增的鸡球虫线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基（mt COⅠ）基因片段，对鸡柔嫩艾美耳球虫（Eimeria tenella）、毒害艾美耳球虫（E. necatrix）、巨型艾美耳球虫（E. maxima）、堆形艾美耳球虫（E. acervulina）、变位艾美耳球虫（E. mivati）进行系统进化研究。提取5种球虫12个株的总DNA，利用合成的引物进行PCR扩增和序列分析，将得到的序列登录GenB...
线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育
系统发育 D-loop 东方鲀属
2009/8/26
东方鲀属的红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中，利用东方鲀属11种鱼类（18尾）的D-loop基因序列，对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后，分析中D-loop序列有841个位点，其中395个位点为可变位点，267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）、最大似然法（ML）和贝叶斯方法构建了分子系统...
被子植物镜像花柱及其进化意义
被子植物 繁育系统 镜像花柱 进化
2009/7/21
镜像花柱是指花柱在花水平面上向左(左花柱型)或向右(右花柱型)偏离花中轴线, 是一种花柱多态现象, 可根据左、右花柱花在植株上的排列式样划分为单型镜像花柱和二型镜像花柱两类, 或根据镜像花柱和雄蕊的排列方式划分为雌雄互补镜像花柱和非雌雄互补镜像花柱两类。镜像花柱现象已在被子植物11个科的部分种类中进行了报道, 它在保护功能型雄蕊和雌蕊、通过自交产生繁殖保障效应以及通过减小雌雄功能间干扰、提高异交率...
Myostatin三维结构模建及分子进化分析
肌肉生长抑制素基因 分子进化 同源模建
2009/7/2
Myostatin(MST)为肌肉生长负调节因子，其功能受抑制可导致肌肉量增加。对MST核酸序列进行序列比对，构建进化树；采用同源模建方法首次模建MST成熟肽生物活性二聚体的四级结构，并预测MST与其受体ActRIIB的相互作用模式。进化树将肌肉生长抑制素基因（MSTN）分成4个亚家族：哺乳动物MSTN，鸟类MSTN以及鱼类MSTN 1和2。MST受纯化选择作用，在不同物种的直系同源基因具有较高...
大量研究显示，细菌与真核生物中的许多氨酰-tRNA合成酶(aaRS)在一些细菌与真核生物中的基因进化机制与模式、氨酰化途径、结构与功能的进化模式等方面往往有着明显的差异。通过对这些差异的深入研究，对于理解蛋白质的结构、功能的进化将是非常有帮助的。虽然，造成这些差异的本质，目前仍不清楚，但是，所有的这些差异似乎提示，在细菌与真核生物的一些基本生命活动过程中的某些方面，可能还存在着目前尚未被人们所认识...
斑纹薄鳅(Leptobotia zebra)最初是由Wu（1939）描述的一个新种，当时定名为斑纹沙鳅(Botia zebra)，后来Chen（1980）根据眼下刺不分叉将其改归为薄鳅属的物种。本研究通过对线粒体DNA细胞色素b基因序列的测定和分析，发现斑纹薄鳅和薄鳅属（除斑纹薄鳅）物种间的平均遗传距离为0.177，和中华沙鳅属物种美丽沙鳅(Sinibotia pulcher)的平均遗传距离仅为0...
长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析
大弹涂鱼 细胞色素b RAPD,种群遗传结构 长江口
2009/6/25
应用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术及细胞色素b（Cytｂ）基因序列，分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼（Boleophthalmus pecinirostris）群体遗传结构及种群历史，结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平很高。（1）RAPD分析结果：从100个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物，对长江口九段沙湿地、浙江舟山定海、福建霞浦群体各20个体进行RAPD分析，3个群...
疣螈属的红瘰疣螈（Tylototriton shanjing）和棕黑疣螈(T. verrucosus) 的物种界限一直不清楚。测定了来自中国西南地区14个地点的T. shanjing和T. verrucosus共40只标本的线粒体DNA Cyt b基因(753 bp)。结果表明：（1）用邻接法、最大简约法和贝叶斯法等3种系统发育分析法分别重建棕黑疣螈种组系统发育树的拓扑结构不支持T. shanji...
大壁虎不同地理居群的遗传变异与分化
大壁虎 遗传变异 遗传分化 细胞色素b基因
2009/6/25
以线粒体细胞色素b (Cyt b) 基因作为分子标记，对中国广西12个地区，以及越南和老挝大壁虎(Gekko gecko) 进行序列测定，获得Cyt b基因424 bp的序列片段，共有7个单倍型。以白脊壁虎和沙虎为外群，用邻接法和最大简约法构建了大壁虎不同地理种群的系统发育关系，其结果显示中国广西4个不同单倍型黑大壁虎之间的平均遗传距离为0.20%—1.20%，越南红大壁虎与老挝红大壁虎之间的平均...
本文参照龟类近缘种的线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）控制区（control region，CR）及邻接序列，设计了二对特异引物，采用PCR和测序技术，获得了大鳄龟(Macroclemys temminckii)、小鳄龟(Chelydra serpentina)和平胸龟(Platysternon megacephalum)mtDNA CR区序列，其长度分别为1089 b...
测定了4个种（红蹼树蛙、黑蹼树蛙、白斑小树蛙和红吸盘小树蛙）共11个种群的16S rRNA基因片段。双斑树蛙、马来棱皮树蛙、越南棱皮树蛙以及日本溪树蛙的同源序列通过GenBank检索获得。去除所有插入、缺失及模糊位点后，比对序列长度为500 bp, 其中变异位点115个, 简约信息位点92个。以日本溪树蛙为外群，运用Bayesian法、MP法和ML法构建了系统发育树。结果表明红蹼树蛙和白斑小树蛙在...
厚壳贻贝养殖群体与野生群体线粒体DNA的遗传分析(英文）
厚壳贻贝 群体分化 遗传多样性 线粒体DNA COI基因
2009/6/23
采用线粒体DNA COI基因序列对厚壳贻贝2个养殖群体与2个野生群体的遗传多样性进行了研究。4个群体共获得30个单倍型。结果显示：在养殖群体中单倍型的数量和遗传多样性要比野生群体的低，可能是由于只有少量的有效父母本对养殖群体的遗传变异有贡献所致。养殖群体与当地野生群体之间也未发生显著的遗传分化，可能是因为它们之间存在基因流。在今后厚壳贻贝养殖过程中，本研究可以用在对养殖群体进行遗传监测，从而保证养...