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真核细胞的m6A RNA修饰是一种广泛存在的可逆的动态修饰，是mRNA中含量最丰富的非末端修饰。近年来，大量的研究揭示了m6A的甲基转移酶和去甲基化酶的表达异常导致的关键基因的m6A RNA修饰的变化的在各种生理和病理过程中发挥了重要作用。然而甲基化酶和去甲基化酶造成的m6A整体水平的变化通常难以实现对不同的靶基因的精细调控，也难以形成细胞特异的甲基化模式。目前已有包括miRNA、转录因子和H3K...
RNA调控遗传信息新通路现身 可为多研究提供理论支撑
RNA 遗传信息 新通路
2021/4/8
中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组发现哺乳动物中RNA调控异染色质形成的新机制，相关研究成果近日发表于《自然》杂志。该研究发现带有一种化学修饰的RNA，能够“监视”并关闭“外来序列”的DNA。研究提出RNA调控遗传信息的新通路，还证明这一通路在干细胞维持中的重要功能，为分子生物学、遗传学、细胞生物学、再生医学等诸多研究提供基础理论支撑。
2021年3月30日，中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组、北京大学现代农学院王玉秋博士和中科院遗传与发育研究所李家洋课题组合作在《Nucleic Acids Research》发表了题为"Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis thaliana"的论文。论文系统检测了模式植物拟南芥中多种RNA上的2'氧甲基化修饰谱，并对指导修饰的sn...
2021年3月30日，中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组、北京大学现代农学院王玉秋博士和中科院遗传与发育研究所李家洋课题组合作在《Nucleic Acids Research》发表了题为"Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis thaliana"的论文。论文系统检测了模式植物拟南芥中多种RNA上的2'氧甲基化修饰谱，并对指导修饰的sn...
近日，浙江大学出版社印刷出版了北京基因组研究所（国家生物信息中心）合作著作的生命科学著作《RNA 甲基化表观转录组学》，该著作入选“中国基础研究前沿”丛书。表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰，基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来基于DNA和蛋白质修饰，可逆RNA甲基化修饰研究引领第三次表观遗传学修饰研究浪潮。RNA存在150余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式，鉴定R...
南方科技大学翟继先团队开发植物单细胞核全长RNA检测技术（图）
植物；单细胞；核全长；RNA检测
2021/10/14
近日，南方科技大学生命科学学院生物系副教授翟继先团队开发了一种不经过原生质体直接检测植物单细胞核全长转录组测序方法，相关成果以“FlsnRNA-seq: protoplasting-free full-length single-nucleus RNA profiling in plants”为题发表在基因组学领域知名学术杂志Genome biology上。
衰老是人类疾病的最大危险因子之一，随着世界人口老龄化情况的日趋严重，如何在衰老的同时保持健康的状态成为了一大亟需探索和解决的难题。长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类广泛参与人类疾病发生机制的调控元件，且在过去的研究中发现，lncRNA与衰老有着密切的关系。为了深入了解人群寿命延长的分子机制，孔庆鹏课题组以百岁老人及其家庭成员为研究对象，对121个个体（包...
2021年2月9日和12日，中科院上海营养与健康研究所杨力研究组受邀在SCIENCE CHINA Life Sciences和Methods杂志分别发表题为“Fast and Furious: insights of back splicing regulation during nascent RNA synthesis”的综述论文和“CIRCexplorer pipelines for cir...
2021年1月29日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）杨运桂研究组和中国医学科学院病原生物学研究所王健伟研究组合作在Cell Discovery杂志上发表题为“N6-methyladenoine regulates RNA abundance of SARS-CoV-2”的研究成果，利用特异性m6A抗体，绘制了SARS-CoV-2病毒RNA的精细表观转录组修饰图谱，并发现敲低宿主甲基...
2021年1月19日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）杨荟研究组、美国纪念斯隆凯特琳癌症中心Dinshaw J. Patel研究组和分子细胞卓越中心丁建平研究组合作，在国际学术期刊Molecular Cell在线发表题为“Structural basis for self-cleavage prevention by tag:anti-tag pairing com...
CRISPR-Cas13系统细菌和古细菌中是通过单个Cas蛋白降解外源入侵RNA的获得性免疫系统，相应的效应蛋白Cas13在crRNA介导下序列特异性识别并切割单链RNA，被激活的同时还会非特异性切割周围环境中的RNA。Cas13是近年来一种新兴的RNA编辑工具，在不改变基因组序列的前提下，可以进行RNA水平的敲低、RNA的定点编辑、RNA的定位等，在基因和RNA的功能研究、疾病诊断和靶向治疗等方...
RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，简称RdRP）是一类独特的核酸聚合酶，在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用，是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠，其整体结构多样性较高，但其催化核心区的三维结构则较为保守，因此RdRP兼具多样性和保守性。由于RNA病毒的宿主范围几乎囊括了所有细胞...
线粒体、溶酶体、内质网等多种细胞器组成的结构相对独立、功能紧密联系的细胞内膜系统，高效支撑了机体正常生理活动功能。细胞内膜系统失调导致细胞代谢稳态失衡，胞内信号网络调节异常，造成不可控的细胞恶性调控，促使肿瘤等恶性疾病发生。
天然免疫反应为机体抵御病毒、细菌等外界病原体的入侵提供了第一道防线。当病毒的核酸及蛋白产物等病原相关分子模式被细胞表面的模式识别受体，通过多种接头蛋白激活共同的下游激酶TBK1，进而催化干扰素调控因子IRF3的磷酸化，启动下游I型干扰素的表达。干扰素的产生对于机体维持稳态至关重要，干扰素产生不足则机体无法有效抵抗病毒感染，而过多的干扰素则会造成机体组织损伤，甚至自身免疫病的发生发展。因此如何精密调...
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲组合作在Nature Review Molecular Cell Biology发表长非编码RNA功能及调控机制的综述论文
陈玲玲 非编码 RNA功能 调控机制
2020/12/31
2020年12月23日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 （生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组合作在Nature Review Molecular Cell Biology 在线发表了题为“Gene regulation by long non-coding RNAs and its biological functions”的综述文章。该文章系统论述了长非编码RNA的生成、亚细...