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中国科学院深圳先进院开发出相控阵全息声镊在体操控细胞新技术（图）
隔空取物 全息声镊操控 气囊细菌群
2023/6/9
“隔空取物”是人类的梦想。这种科幻超能力现被超声科技实现并可望用于治病救人。2023年6月8日，中国科学院深圳先进技术研究院研究员郑海荣团队开发出一种相控阵全息声镊操控技术，在生物体及血流中实现了对含气囊细菌群的无创精准操控和高效富集，在动物模型中实现了肿瘤靶向治疗应用。相关研究成果以In-vivo programmable acoustic manipulation of genetically...
根际益生菌是微生物肥料的主要菌种来源，高效的根际定殖是其发挥各种植物益生功能的前提。根际益生菌的定殖包括根际趋化、根系粘附和根表生物被膜形成三个主要的过程，每一步都是由信号介导的菌-植互作驱动的。有效铁是根际环境中的稀缺资源，菌、植双方都在极力获取，根际益生菌在根表形成生物被膜需要铁元素，主要通过分泌铁载体从根际土壤中争夺。根际益生菌一旦在根表定殖形成生物被膜，则可通过其铁载体和生物被膜基质系统持...
丝状放线菌是一类具有重要工业应用价值的菌株，可以生产例如红霉素、阿霉素等高附加值的天然产物。但野生菌株天然产物的生产能力往往很低，难以满足工业化生产的需求，目前工业上普遍使用的天然产物生产菌株往往经过了长时间多轮次的理性或非理性改造。对于无法进行基因工程改造的工业放线菌来说，随机诱变等非理性手段是最常用的提升菌株性能的方法。但是此类方法往往正突变率很低，需要借助强有力的高通量筛选方法来辅助菌株筛选...
中国科学院遗传与发育生物学研究所汪迎春研究组解析蓝细菌碳代谢蛋白质调控网络并揭示组氨酸激酶Hik8参与碳氮平衡的调控（图）
汪迎春 解析 蓝细菌碳代谢 蛋白质调控 氨酸激酶 碳氮平衡
2023/7/6
碳代谢是光合生物的核心代谢，涉及众多蛋白质的协同运作和调控。在蓝藻中，参与碳代谢的蛋白质其表达受到多种因子的调控，包括RNA聚合酶σ因子SigE、组氨酸激酶Hik8、Hik31和其质粒上的同源蛋白Slr6041，以及二元信号系统的响应应答因子Rre37。然而，目前还不完全清楚这些调控因子是如何特异或协同调控参与碳代谢的蛋白或蛋白质网络。
近十年来，荧光激活液滴分选技术（FADS）快速发展，已成为一种强大的超高通量筛选工具，广泛应用于酶、代谢产物和抗体筛选。高灵敏度荧光偶联策略（FCSs）是FADS应用拓展的关键技术，可将酶活性、代谢产物浓度、抗体亲和力等性质与荧光信号进行偶联，实现目标物质定量检测，是FADS应用发展关键环节之一。截止目前，一系列FCSs已经被开发，极大地扩展了FADS的应用（图1）。
20223年5月17日，陈义华研究组与深圳湾实验室唐啸宇研究组合作在Microbiome发表文章，题为Human？associated bacteria adopt an unusual route for synthesizing 3？acetylated tetramates for environmental adaptation ，揭示了muc生物合成基因簇（BGC）通过形成内酰胺键产生吡...
中国农业科学院作科所解析荞麦立枯丝核菌抗性分子机制（图）
解析 荞麦立枯丝核菌 分子机制 植物细胞
2023/6/10
2023年4月29日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队利用多组学方法揭示了茉莉酸诱导的黄酮类物质代谢参与调控苦荞对立枯丝核菌抗性的分子机制，为荞麦抗病分子育种提供了理论基础和重要基因资源。相关研究成果在线发表于《植物细胞（The Plant Cell）》上。
链格孢菌是一种典型的腐生性病原真菌。其不同病理小种的感染，可以导致许多重要经济和农作物严重的病害，其中包括烟草赤星病、马铃薯早疫病、棉花轮斑病等。目前，人们对植物抵御链格孢菌的抗病反应过程知之甚少。中国科学院昆明植物研究所研究团队以渐狭叶烟草为模式，结合了转录组分析、基因沉默和基因编辑，以及植物病理学等研究手段，发现了一个植物在抵御链格孢菌的抗病过程中调控多重信号及抗病植保素Scopoletin的...
2023年4月28日，中国农业科学院兰州兽医研究所草食动物细菌病团队在《The FASEB Journal》正式在线发表了题为“ EptA of Riemerella anatipestifer mediates phenotypes involved in colistin resistance and virulence”的研究论文。该研究揭示了鸭疫里默氏杆菌（ R. anatipest...
中国科学院深圳先进技术研究院噬菌体培养组解析肠道“暗物质”（图）
噬菌体培养 解析肠道 暗物质 肠道细菌
2023/8/7
2023年4月12日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞课题组与戴磊课题组合作在Cell Host & Microbe发表题为“Large-scale phage cultivation for commensal human gut bacteria”的最新研究成果，该工作首次建立了大规模肠道主要共生细菌噬菌体培养组技术，利用噬菌体培养物解析了肠道细菌和噬菌体长期共存的机制，并展...
中国科学院上海有机所在富硫细菌环肽的生物合成研究中获进展（图）
上海有机所 富硫细菌环肽 生物合成
2023/5/8
核糖体肽是自然界通过翻译后修饰化学创造的一类结构复杂、活性优良的肽类天然产物。许多有广泛应用的抗生素，如乳酸链球菌素和硫链丝菌素，均通过翻译后修饰化学从20种天然氨基酸构成的简单多肽转化而来。中国科学院上海有机化学研究所刘文课题组长期从事富硫细菌环肽的翻译后修饰化学研究，剖析了相关肽的主链骨架修饰、氮杂核心环的形成以及非天然氨基酸的引入等酶促反应过程（J. Am.Chem.Soc.2020, 14...
甲烷是仅次于二氧化碳的全球第二大温室气体，百年尺度内单分子增温效应是二氧化碳的近30倍，对全球变暖有重要贡献。微生物驱动的甲烷氧化过程对削减甲烷释放扮演着关键角色，其中好氧甲烷氧化菌长期被认为依赖氧气作为电子受体、以甲烷为唯一碳源和能源生存。近年来许多研究表明好氧甲烷氧化菌在厌氧环境中依然大量存在，甚至具备转录活性，这些发现预示着全球甲烷汇可能被大量低估。然而，好氧甲烷氧化菌的厌氧生存机制和生态贡...
中国科学院上海营养与健康所武爱波研究组构建呕吐毒素重要靶动物安全性评价体系（图）
武爱波 真菌毒素 细菌
2023/11/30
2023年3月7日，中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究组在国际学术期刊Journal of Hazardous Materials在线发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol-induced intestinal flora disorders, dysfunction and organ damage in broilers and pigs”的论文。该研究在真菌毒素脱...
Toll/Interleukin-1 Receptor (TIR) 结构域蛋白在原核生物和真核生物中普遍存在，主要功能是介导免疫反应和细胞死亡。植物TIR免疫受体作为NAD+裂解酶发挥功能，产生信号小分子激活下游的脂肪酶类似蛋白EDS1而引起免疫和细胞死亡。除了激活EDS1的信号小分子，植物TIR降解NAD+还生成cADPR的同分异构体。目前结构已解析的cADPR同分异构体包括2’cADPR和3‘...