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近日,动物科技学院张智英教授团队在原核Argonaute蛋白在体内环境(in vivo)具有DNA干扰属性的研究取得重要进展。研究论文以“Prokaryotic Argonaute Protein from Natronobacteriumgregoryi Requires RNAs To Activate for DNA Interference In Vivo”为题在《mBio》上发表。动科学...
2022年3月3日,生物所微生物蛋白设计与智造团队与国内外多家科研单位开展合作,成功构建人工智能预测模型MPEPE,基于深度学习和分子进化的策略模拟分析异源基因在大肠杆菌中表达,提高了异源蛋白在大肠杆菌中的表达量。该研究促进了对基因序列与蛋白可溶性表达之间关系的认识,并为酶蛋白的理性分子设计提供了新方法。相关研究成果发表在《计算与结构生物技术期刊(Computational and Structu...
近日,华理刘昌胜院士/屈雪教授团队利用电化学组装实现胶原结构与功能的仿生定制。该成果以“电化学组装一种具有动态和自适应性的胶原熔融微纤态”为题发表在科学子刊《科学-进展》上。
高水分挤压技术作为一种新兴食品挤压技术,具有高效绿色经济等优点,可生产出具有类似动物肉的纤维结构和质地的产品,满足消费者对高蛋白产品的需求。但高水分挤压过程中,蛋白原料凝胶特性、挤压参数与挤出物纤维结构的构效关系尚不清晰,阻碍了产品纤维结构调控与品质提升。
中国科学技术大学刘海燕教授、陈泉副教授团队采用数据驱动策略,开辟出一条全新的蛋白质从头设计路线,相关成果以“用于蛋白质设计的以主链为中心的神经网络能量函数”为题于北京时间2022年2月10日发表于Nature。
近日,国际学术期刊PNAS(《美国科学院院报》)在线发表了中国科学院武汉病毒研究所与合作单位的最新研究成果。论文题为“A prototype protein nanocage minimized from carboxysomes with gated oxygen permeability”。该研究从头设计构建了一种氧气通透性可调控的人工蛋白纳米笼(protein nanocage,PNC)结构...
分子水平的蛋白质识别在疾病的早期诊断和治疗中具有重要的意义。一般来说,蛋白质可以通过质谱和免疫分析等手段进行鉴定。随着研究的深入,人们对蛋白质的分析已从对一级序列的研究延伸到通过观测蛋白质结构的变化来理解蛋白质的功能。然而,低丰度的蛋白质病理变化很可能被宏观手段所获得蛋白质集成信息所掩盖,无法捕捉到单个蛋白质的异常结构特征。目前开发一种能够识别不同的蛋白质,并区分由配体/药物结合和融合等过程引起的...
谷歌DeepMind团队研发的阿尔法折叠2(AlphaFold2)使用最新的人工智能算法对蛋白质结构实现了接近实验精度的精准预测。复旦大学复杂体系多尺度研究院教授马剑鹏团队与上海人工智能实验室合作,近日在国际知名刊物《生物信息学简报》上发表论文,显示其蛋白质侧链预测算法(OPUS-Rota4算法)精度显著超越了谷歌团队的阿尔法折叠算法。
近日,中科院合肥研究院健康所杨良保研究员、王宏志研究员团队与合肥研究院强磁场中心王俊峰研究员团队在新冠病毒相关蛋白检测方面取得进展,设计出利用新冠病毒表面S蛋白受体结合域(RBD)构筑热点,配合表面增强拉曼光谱(SERS)完成高灵敏、特异性、快速检测RBD的新方法,该成果发表在国际分析领域期刊Analytical Chemistry上。
2021年11月2日讯/生物谷BIOON/---复杂的多细胞生物会遭受无数的细胞应激,这些应激可以通过细胞内在的适应和修复机制来控制。未能从中恢复的细胞会激活导致细胞受控死亡或细胞衰老的途径,从而限制了肿瘤转化的风险。越来越多的证据表明,细胞间的交流在应对细胞应激方面也发挥着重要作用。例如,经历DNA损伤的细胞展示促进淋巴细胞识别的细胞表面配体,并分泌吸引髓样细胞的细胞因子。此外,经历细胞衰老的细...
蛋白质疗法是指基于外源蛋白质或多肽等生物分子而实现细胞生物学功能的调控、疾病的治疗等作用。相比于基因/化学治疗,蛋白质疗法不会引起永久性的基因改变和严重的不良反应。这样,蛋白质疗法在抗肿瘤治疗领域有着不可替代的地位。然而,由于蛋白质自身的独特属性,比如:大尺寸、亲水性、膜不通透性和易降解等特点。迄今为止,所有临床批准的蛋白质药物靶点仅限于细胞外环境中的配体或细胞表面的疾病靶点。考虑到人类~70%的...
蛋白质的结构稳定性尤其是热稳定性对其行使生物功能至关重要。疏水作用以及蛋白质构象熵对应的熵效应是维持蛋白质稳定性的重要物理基础。近年来研究表明蛋白质在生物体内的稳定性和活性受到细胞周期的调节,从而造成不同阶段中基因转录和代谢水平的差异。同时,生物系统中显著的温度波动和温度梯度,特别是线粒体中的高温也会对蛋白质结构稳定性产生影响。此外,在细胞中其他生物大分子和细胞膜的非特异性相互作用也可能影响蛋白质...
2021年10月17日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自英国剑桥大学、德国柏林夏里特医院和亥姆霍兹慕尼黑中心等研究机构的研究人员基于不同人类疾病在人类基因组中的共同起源,发现了这些疾病之间的数百种联系,从而挑战了依照器官、症状或临床特点进行的疾病分类。他们产生了关于人类血液中循环的数千种蛋白的数据,并将这些数据与遗传数据相结合,构建出显示影响这些蛋白的遗传差异如何将看似不同的疾病以...
在自然界中,细胞是一切生物体结构和功能的基本单位,对细胞及组织器官的人工模拟构筑及功能整合是近年来超分子组装领域重要研究内容之一。目前,通过生命功能组装,构建基于磷脂、聚合物、以及无机纳米粒子等系列人工细胞研究工作,不仅为当今自然科学尚未解决的重大科学难题之一“生命的起源”提供新的化学研究视角,也为进一步实现“无生命”组装体材料朝向“生命”组装体材料的跨越提供了重要理论基础。
近日,北京大学化学与分子工程学院、北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、深圳湾实验室高毅勤教授课题组与华为联合推出蛋白质多序列比对(Protein MSA)数据集,希望在标准化的数据集基础上,支撑研究人员开发先进的AI模型,加深对蛋白质结构、功能和进化的认知,并进行蛋白设计与改造。此数据集将发布于华为云AI Gallery平台,相关代码及数据集说明将依托于华为全场景AI计算框架MindSp...

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