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2022年3月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自荷兰代尔夫特理工大学的研究人员提出了一种基于物理的模型，它建立了一个关于CRISPR-Cas9基因编辑如何运作的定量框架，并允许他们预测在哪里、以何种概率以及为何会发生靶向错误，即脱靶。这项研究使我们首次对当今最重要的基因编辑平台背后的机制有了详细的物理了解。相关研究结果于2022年3月15日发表在Nature Communic...
近期，中国科学院生物物理研究所研究员王艳丽课题组和中国科学技术大学教授龚为民课题组合作，在Nature Communications上，在线发表题为Structural basis for two metal-ion catalysis of DNA cleavage by Cas12i2的研究论文，报道Cas12i2-crRNA和Cas12i2-crRNA-DNA复合物的晶体结构，揭示Cas12...
中国科学院生物物理研究所揭示DNA甲基化维持的动态过程和调控机制及其对衰老和肿瘤发生过程中甲基化选择性丢失的贡献（图）
中国科学院生物物理研究所 DNA甲基化维持 动态过程 调控机制 衰老 肿瘤发生 甲基化 选择性丢失
2020/8/6
2020年6月24日，中国科学院生物物理研究所朱冰实验室以Kinetics and mechanisms of mitotic inheritance of DNA methylation and their roles in aging-associated methylome deterioration为题的研究论文，在线发表在Cell Research上。该研究解析了细胞有丝分裂中DNA甲基...
中国科学院生物物理研究所李国红课题组和朱明昭课题组合作——揭示组蛋白变体H2A.Z对DNA复制起始的调控机制（图）
中国科学院生物物理研究所 李国红 朱明昭 组蛋白变体 H2A.Z DNA 复制起始 调控机制
2020/1/7
2019年12月25日，生物大分子国家重点实验室的李国红课题组与感染与免疫院重点实验室的朱明昭课题组合作，在Nature上发表了题为“H2A.Z facilitates licensing and activation of early replication origins”的论文。该研究发现组蛋白变体H2A.Z能够通过H2A.Z-SUV420H1-H4K20me2-ORC1通路帮助在染色质进行...
天津医科大学宣成昊教授课题组《Cell Death Differ》揭示JMJD6以不依赖于其酶活性的方式调控DNA损伤应答的分子机制
天津医科大学 宣成昊 教授 Cell Death Differ JMJD6 不依赖 酶活性 DNA 损伤应答 分子机制
2019/10/24
天津医科大学基础医学院宣成昊教授课题组最近报道了JMJD6以不依赖于其酶活性的方式调控DNA损伤应答，相关研究成果于2019年7月发表在《Cell Death Differ》（2018年影响因子8.086，5年影响因子8.309），题目为“JMJD6 modulates DNA damage response through downregulating H4K16ac independently...
RNA干扰对基因的表达调控具有重要作用，并且在生物中普遍存在。Ago蛋白结合小RNA是RNA诱导的沉默复合体的核心组分，它们利用小的RNA引导链靶向互补配对的RNA分子，降解目的mRNA或者抑制目的mRNA的翻译。与真核Ago蛋白利用RNA引导链靶向RNA分子不同，大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引导链靶向DNA分子，具有DNA介导的DNA干扰作用。TtAgo是通过RNase H型机制剪切靶标...
生命机体内部有机生物大分子种类构造极其繁复，其运转却呈现出高度有序、协调和精妙的自我调控。在纷繁复杂的生物反应中，染色体DNA自组装、复制和应时启动转录处于细胞生命活动的中心位置。虽然人类基因组计划已经完成，但是数以亿计的DNA遗传信息凝聚在十几微米大小的细胞核内，目前，我们还没有能力清晰理解这些信息是如何被细胞利用、提取、整合并最终发布成效应蛋白质来应对正常生命活动和细胞内外信号刺激。这些基本调...
非同源末端连接（non-homologous end-joining, NHEJ）是哺乳动物DNA双链断裂（DNA double-strand break, DSB）的最主要也是最经典的修复方式。最新的NHEJ核心蛋白是近十年前发现的。通过与北京大学生命科学学院纪建国、高歌课题组生物物理所刘迎芳课题组，匹兹堡大学Li Lan课题组和哥伦比亚大学Shan Zha课题组合作，徐冬一课题组鉴定出了一个新...
世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
人类 胚胎 DNA 图谱
2014/7/28
2014年7月25日从北京大学第三医院获悉，该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作，绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》，影响因子达38.597。
中国科学院上海应用物理研究所发表DNA纳米结构生物应用的综述论文（图）
应用物理 DNA纳米结构 应用生物 遗传学
2014/7/22
DNA纳米技术利用核酸分子的强大识别能力来设计和构造功能纳米结构，这种新型纳米生物技术近年来获得了快速发展和广泛关注。近日，中国科学院上海应用物理研究所物理生物学研究室樊春海和黄庆课题组应邀在化学综述杂志Accounts of Chemical Research 以Physical and Biochemical Insights on DNA Structures in Artificial a...
中国科学院生物物理研究所等揭示羟甲基化DNA的特异识别机制（图）
生物物理 羟甲基化DNA 特异识别机制
2014/5/13
2014年5月8日，Molecular Cell杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所许瑞明研究组、朱冰研究组和华东师范大学翁杰敏研究组合作研究的成果，题目为Structural basis for hydroxymethylcytosine recognition by the SRA domain of UHRF2，该研究报道了5-羟甲基化胞嘧啶（5hmC）被UHRF2-SRA结构域特异识别的...
上海应物所等在DNA双螺旋结构介导的电荷传递方面获进展（图）
DNA双螺旋 电荷传递 单分子层
2012/9/28
电荷如何沿着DNA双螺旋结构传递是引起广泛关注和争议的问题，它对于生物电子学的发展具有重要意义，并预示着通过DNA构建分子电路的前景。近期，中国科学院上海应用物理所物理生物学实验室通过与美国亚利桑那州立大学和上海微系统与信息技术研究所传感技术联合国家实验室合作，发展了一种固定在金电极表面的三维DNA纳米结构框架，为DNA双螺旋结构介导的界面电荷耦合传递提供了新的证据。研究DNA双螺旋结构介导的界面...
生物物理研究所合作研究揭示DNA复制起始复合体亚基结构（图）
生物物理研究所 DNA复制起始 复合体亚基结构
2011/4/29
2011年4月18日，美国《国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中科院生物物理研究所刘迎芳研究员实验室与美国阿拉巴马大学Igor Chesnokov博士的合作研究成果：Structural analysis of human Orc6 protein reveals a homology with transcription factor TFIIB。
这一文章中报导了他们对DNA复制起始复合...