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天津工业生物所开发新型大肠杆菌光/暗诱导高效表达系统（图）
系统 酶蛋白 基因
2024/6/18
大肠杆菌在生物基化学品及酶蛋白生产中具有广泛的应用。乳糖操纵子系统是大肠杆菌中调控基因表达的重要组成部分，其中阻遏蛋白LacI通过结合操纵序列来抑制基因的转录。诱导剂IPTG通过与LacI结合，解除其抑制作用，从而调控基因表达。然而，IPTG对菌体生长有一定的抑制作用，且价格较昂贵，诱导不可逆（只能开不能关，不能震荡诱导）。
JIPB | 中国农业大学农学院玉米研究中心自主知识产权的CRISPR/Cas12i.3基因编辑系统在黍稷中成功实现基因编辑（图）
CRISPR Cas12i.3 基因编辑系统 黍稷
2024/5/21
前期，中国农业大学自主研发出了基因编辑技术底盘工具CRISPR/Cas12i和CRISPR/Cas12j，并分别在玉米、水稻、小麦等作物中建立了基因编辑技术体系。为了进一步拓展该工具的应用范围，团队选取了起源于我国且最为古老的农作物黍稷 (又称糜子) 为研究对象，开展基因编辑技术体系建立的研究。黍稷作为抗逆先锋作物，具有出色的节水耐旱、耐盐碱、耐瘠薄等特点。同时，黍稷还具有丰富的营养价值、较强的环...
天津工业生物所揭示细胞氨基酸组成存在系统水平约束（图）
细胞氨基酸 系统 蛋白质
2024/5/14
在生物学研究中，细胞内的氨基酸组成（AACell）对于生物体的功能和适应性至关重要。尽管单个蛋白质的氨基酸组成（AAP）和蛋白质表达水平在不同条件下会有显著变化，但细胞内总蛋白质的氨基酸组成（AACell）的稳定性却鲜为人知。这一领域的研究对于理解生物体如何在环境变化中调整其代谢和蛋白质表达具有重要意义。
基因组系统解析工具开发研究取得重要进展（图）
解析工具 非模式 海洋生物
2024/4/16
近日，中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具（PanSyn，https://github.com/yhw320/PanSyn）。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
2024年2月1日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）沈义栋研究组、吴立刚研究组与北京大学、中国科学院上海营养与健康研究所（中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所）韩敬东研究组的合作研究成果：“Tissue-specific profiling of age-dependent miRNAomic ch...
中国科学院研究揭示ABIN1蛋白通过I-型干扰素信号调控造血系统发育疾病新机制（图）
蛋白 系统发育 骨髓增生
2023/12/5
2023年11月27日，中国科学院上海营养与健康研究所章海兵研究组等在《科学进展》（Advanced Science）上，在线发表了题为ABIN1 (Q478) is required to prevent hematopoietic deficiencies through regulating type I IFNs expression的研究论文。研究发现，泛素结合蛋白ABIN1通过泛素结合...
2023年11月17日，国家纳米科学中心丁宝全研究员课题组在利用DNA纳米机器递送基因编辑系统进行靶向基因治疗方面取得重要进展。研究成果以A DNA Origami-Based Gene Editing System for Efficient Gene Therapy in Vivo为题，发表在Angew. Chem. Int. Ed.杂志上（DOI: 10.1021/anie. 2023150...
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域，即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域...
2023年8月29日，中国农业大学国家玉米改良中心、玉米生物育种全国重点实验室赖锦盛教授团队在Plant Biotechnology Journal 上在线发表了题为“Targeted large fragment deletion in plants using paired crRNAs with type I CRISPR system”的研究论文。该研究利用Type I CRISPR系统，...
近日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心周斌研究组在npj Regenerative Medicine上，在线发表了题为Functional ProTracer identifies patterns of cell proliferation in tissues and underlying regulatory mechanisms的最新研究成果。该研究改进并优化了先前工作的增殖追踪系统Pr...
2023年8月23日，国际学术期刊American Journal of Human Genetics在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李昕研究组题为“An RNA informed dosage sensitivity map reflects intrinsic functional nature of genes”的研究论文。该研究提出了新的基因剂量约束的度量方法，并基于此提出孟德尔遗...
中国农业科学院生物技术研究所微生物智能设计与合成创新团队联合国内外研究机构开发出一种在真菌中实现多顺反子表达的系统，提升了真核细胞工厂合成工农业高价值化学品的原创设计能力。近日，相关研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》上。
兰科石仙桃属植物（Pholidota Lindl. ex Hook.）分布于亚洲热带、亚热带地区，世界约有30种，我国产约15种。该属植物具有重要的经济价值。其中，有些类群为传统中药材，俗称石橄榄。然而，以往由于采样不足、缺乏足够的信息位点及有限的基因组信息，该属和近缘属间的关系和系统地位尚不清楚以及石仙桃属的分类问题尚存在争议。
引导编辑系统（Prime editor, PE）作为目前应用灵活、前景广阔的新型基因组编辑工具，可以实现植物基因组任意碱基的替换以及小片段的插入和删除，并在与位点特异性重组酶耦合时展现出高效精准大片段定点插入的潜力。由于PE在植物中的编辑效率偏低，目前虽有多项研究通过不同策略来提升植物引导编辑系统的效率，但这些改进的引导编辑器依然存在位点偏好明显、普适性较差等问题，并且大多数优化集中在水稻和玉米等...
2023年6月8日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞课题组在国际期刊核酸研究（Nucleic Acids Research）发表题为 “Global transmission of broad-host-range plasmids derived from the human gut microbiome” 的文章。该工作深度分析并揭示了大量人肠道质粒，首次鉴定出一系列未知的宽...