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香港大学开发全球首个筛选精确基因编辑工具平台
生物医学 香港大学医学院 基因编辑工具
2023/7/17
香港大学医学院(港大医学院)2023年6月19日公布，研究团队开发了全球首个筛选精确基因编辑工具平台，目前已就该技术提交专利申请。
放线菌能生产种类繁多的次级代谢产物，微生物发酵是人们获取这些天然产物的重要手段。对于某一目标产品，野生菌株的产量一般难以满足工业生产的要求，需要经过长期的菌株驯化以提升产量。小分子生物传感器与液滴微流控的组合已被证明是放线菌菌株改造和高通量筛选的有效手段。然而，在菌株驯化过程中，目标产物的产量往往是阶段上升的，而大多数生物传感器仅能在一定的操作范围内响应目标化合物，难以支持从野生菌株到工业菌株多阶...
天津工业生物所开发基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术（图）
碱基编辑 全基因组 定位靶基因
2023/2/7
通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选，从宏观基因组层面系统的研究基因型与表型的对应关系，是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选，混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选，显著提高通量。近年来，CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编程、易追踪的优势，已逐渐被应用于全基因组规模混合文库的构建与筛选中。但基于DNA双链断裂（Double...
通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选，从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系，是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选，混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选，显著提高通量。近年来，CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编程、易追踪的优势，已逐渐被应用于全基因组规模混合文库的构建与筛选中。但基于DNA双链断裂（Double ...
Nature Protocols在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组撰写的研究论文（Screening circular RNAs with functional potential using the RfxCas13d/BSJ-gRNA system）。该研究阐释了研究组建立的基于CRISPR-Cas13技术的环形RNA筛选新方法。
近日，北京大学生命科学学院和博雅辑因宣布成立基因编辑高通量筛选平台，旨在进一步推动基因编辑技术在生命科学领域的探索和应用，助力基础研究和成果转化，并支持生命科学领域的人才培养。基因编辑高通量筛选平台挂牌仪式在北京大学生命科学学院吕志和楼举行。
近日，陕西省微生物研究所万一研究员领导的分子生物学研究团队在药学领域JCR一区期刊Frontiers in pharmacology在线发表研究论文。该论文从秦岭天然产物库中筛选到一系列黄酮类化合物作为D类β-内酰胺酶OXA-48的抑制剂，对其构效关系进行分析，并联合抗生素在体内、外有效遏制耐药细菌的生长。
中国科学院兰州化学物理研究所天然产物中酶抑制剂筛选研究取得进展（图）
酶抑制剂 筛选 低共熔溶剂 碱性DES
2022/5/19
天然产物具有资源丰富、安全有效、环境友好和毒副作用小等特点，是天然酶抑制剂的重要来源之一。从天然产物中筛选有效、低毒、价廉的酶抑制剂具有重要意义。
上海科技大学物质科学与技术学院季泉江课题组与合作者开发细菌靶向遗传筛选新方法（图）
细菌 靶向 遗传筛选 新方法
2021/9/15
近日，上海科技大学物质科学与技术学院季泉江课题组与中山大学的骆观正课题组合作，在Cell Reports发表了题为“Targeted genetic screening in bacteria with a Cas12k-guided transposase”的文章，报道了名为Site-specific Transposon-Assisted Genome Engineering （STAGE，定...
苏州大学剑桥-苏大基因组资源中心的研究团队利用开发的基于机器学习（卷积神经网络）识别同步化参数的人工智能算法，设计了能系统化和自动化识别小鼠活动及饮食昼夜节律的筛选器。他们与来自国际上14个科研机构的团队合作，针对国际小鼠表型分析联盟的野生型小鼠数据开展了生物钟相关功能基因高通量筛选研究。研究团队通过对750个突变小鼠品系的活动和饮食数据进行筛选，发现了5个可能影响小鼠昼夜节律同步化的基因（Slc...
人类基因组中有多少个衰老调控基因？这些基因参与衰老调控的分子机制是什么？能否在分子层面“操控”这些基因以延缓机体的衰老？围绕这些衰老领域亟待解决的重要科学问题，我国学者提出了新的解决方案。
中科院天津工业生物技术研究所孙周通研究员带领的酶分子工程与工业生物催化研究团队围绕这一技术问题，通过显色剂筛选，建立了一种新的酮类物质的高通量检测方法。通过使用荧光染料对甲氧基-2-氨基苄胺肟（PMA）可以快速测定多种结构的酮类化合物。该检测方法具有灵敏度高（μM级别）、拟合度强（R2>0.9）、底物谱广（可检测四大类20余种酮类物质）、背景噪音低、显色稳定等优点，且可以用于全细胞或体外酶催化体系...
2018年11月5日，北京大学生命科学学院魏文胜课题组在Nature Biotechnology杂志在线发表了题为“Genome-wide screening for functional long noncoding RNAs in human cells by Cas9 targeting of splice sites”的研究论文。作为强大的基因编辑工具，CRISPR/Cas9系统能够在蛋白...
我国科学家NC发文：基于稀有密码子筛选氨基酸高产菌株
科学家 稀有密码子 氨基酸 高产菌株
2018/9/20
北京时间9月6日，北京理工大学霍毅欣教授团队在《自然—通讯》杂志（Nature Communications）在线发表了题为“Utilization of rare codon-rich markers for screening amino acid overproducers”的研究论文，建立了一种基于稀有密码子的氨基酸高产菌株筛选策略，为氨基酸高产机制的解析与高产菌株的构建提供了创新思路。该...
近日，中国农业科学院棉花研究所棉花抗逆鉴定课题组创建了一种简单高效的耐盐相关内源基因编辑突变体筛选方法，应用CRISPR/Cas9系统精确有效地编辑棉花的两个耐盐相关的内源基因，为棉花的基因功能研究和分子育种提供了新思路。相关论文在线发表于《科学通报（Scientific Reports）》上。