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美国绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱
美国 小鼠全脑 单细胞 空间转录组图谱
2024/1/15
美国麻省理工学院和布罗德研究所的科研人员绘制出小鼠全脑高分辨率单细胞空间转录组图谱，为深入理解大脑结构与功能提供了重要基础。该团队基于109万个高质量空间分辨单细胞基因表达定义出小鼠大脑更精细的组织区域，绘制出的大规模分子空间图谱囊括了超100万个细胞及其基因表达特征、空间坐标、分子细胞类型、分子组织区域类型，以及遗传操作可及性。相关研究成果发表于《Nature》期刊。
科研人员揭示植物愈伤组织全能性建立的转录调控机制（图）
中国科学院 植物研究所 植物细胞 全能性 转录调控 The Plant Cell
2023/10/27
植物细胞具有很高的全能性，它赋予了植物器官在活体或培养条件从头再生新的器官和完整植株的能力。基于细胞全能性发展起来的植物离体再生体系已被广泛应用于遗传转化和基因编辑等植物生物技术中。在经典的植物离体再生体系中，生长素诱导的多能性愈伤组织形成是离体再生的第一步，被认为是植物细胞获得全能性的关键过程，对于不定芽或根的从头再生是必需的。研究表明，植物根干细胞因子在生长素诱导愈伤组织形成过程中的异位激活代...
科学家揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱
小鼠胚胎 器官形成初期 时空转录图谱
2024/1/16
胚胎正常发育需要基因表达的时空调控。单细胞技术的发展使研究早期胚胎调控具有更高的分辨率，如对小鼠胚胎发育过程中多数细胞状态的详细分子定义。德国马克斯·普朗克分子遗传学研究所等机构揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryo...
科学家开发时空转录组学并在亚细胞水平揭示RNA动力学图谱
时空转录组学 亚细胞水平 RNA动力学图谱
2024/1/16
细胞转录组的时空调节对细胞内蛋白质的正常表达及细胞功能至关重要。然而，由于现有转录组学方法不能同时获得时间和空间数据。美国麻省理工学院研究团队开发了时空转录组测序技术，并应用于探究RNA的生成、转运和降解速率，在亚细胞水平揭示RNA的动力学图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为：Spatiotemporally resolved transcriptomics rev...
科学家开发了一种能够实现表观遗传组-转录组联合分析的新技术
表观遗传组 转录组 联合分析
2024/1/17
单细胞多组学，尤其是染色质可及性表观遗传和转录组同时测序分析，不仅可以鉴别细胞类型和状态，还可以揭示控制基因表达的机理，被视为单细胞组学分析的极致利器。而随着空间组学的兴起，空间多组学技术（spatial multi-omics）是否可以同时分析基因表达和基因调控机制，已成为全球瞩目热点，还曾被《Nature》杂志展望为2022年最值得期待的七项技术之一。
国外科学家发现大脑皮层神经发生的表观转录调控新机制
大脑皮层 神经发生 表观转录调控
2024/1/18
表观转录组被发现参与调控包括RNA转录、剪切、转运、翻译、稳定性、降解、折叠等各个方面的RNA代谢过程，调节发育、衰老以及肿瘤发生等多种生物学过程。多项研究发现，表观转录组在哺乳动物神经系统中发挥了多种多样的调控作用，但研究主要集中在mRNA的N6-腺苷酸甲基化（m6A）修饰上，其他类型的RNA化学修饰功能尚待研究。近日，美国宾夕法尼亚大学在《Cell Stem Cell》发表题为“Epitran...
我国科学家构建非洲猪瘟病毒感染的全景式细胞转录图谱
非洲猪瘟病毒 全景式细胞转录图谱 病原体
2022/6/15
非洲猪瘟病毒（ASFV）是非洲猪瘟的病原体，它具有高度传染性和致命性，严重危害全球养猪业。然而，目前尚无针对ASFV的商用疫苗和抗病毒药物，ASFV感染的发病机制亦不明确。近期我国科学家构建了ASFV感染的全景式细胞转录图谱，揭示了病毒在宿主细胞内复制的调控模式。研究成果发表在《美国科学院院刊》（PNAS），标题为“Transcriptome profiling in swine macropha...
南方科技大学生命科学学院翟继先课题组应用纳米孔单分子测序揭示拟南芥全基因组转录终止图谱（图）
南方科技大学生命科学学院 翟继先课题组 纳米孔单分子RNA测序 拟南芥 转录终止图谱 全基因组 Genome Biology
2022/10/20
近日，南方科技大学生命科学学院副教授翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。相关成果以“Landscape of transcription termination in Arabidopsis revealed by single-molecule nascent RNA sequencing”为题发表在国际知名学术期刊Genome Biology上。
八个转录因子促干细胞变身“类卵细胞”
转录因子 干细胞 类卵细胞
2020/12/17
人类可以在实验室中“制造”卵子吗？根据英国《自然》杂志16日发表的一项干细胞最新研究成果，日本科学家团队证明：一组8个转录因子，可以在实验室中将小鼠干细胞转化为类卵细胞。这些发现进一步加深了人类对卵子发育的理解，在应用角度上，。
热带生物医学组学大数据李霞教授研究团队在《Cancer Research》杂志发表题为“LncSpA: LncRNA Spatial Atlas of Expression across Normal and Cancer Tissues”文章（SCI 9.727，JCR一区）。长链非编码RNA（Long non-coding RNAs, LncRNAs）在维持细胞形态和组织功能中发挥重要的作用，...
转录增加核糖核蛋白组装的协同作用（图）
转录增加 核糖核 蛋白组装 协同作用
2019/12/19
近日，美国霍普金斯大学等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transcription Increases the Cooperativity of Ribonucleoprotein Assembly”的文章，揭示了转录增加核糖核蛋白组装的协同作用。
近日，美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transcriptional Basis of Mouse and Human Dendritic Cell Heterogeneity”的文章，发现小鼠和人类树突细胞异质性的转录基础。树突细胞（dendritic cell，DC）在协调获得性免疫中起着非常重要的作用，它们具有启动T细胞反应并将其分化为效应家族的独特能...
研究人员揭示乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子网络和细胞谱系关系
乳腺细胞发育 细胞状态特异性 转录因子 细胞谱系
2019/11/13
2019年10月8日，美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcriptional Regulators and Lineage Relationships”，利用最前沿...
2019年9月16日，PNAS杂志在线发表了约翰霍普金斯大学医学院肖杰博士团队的研究成果，题为“Spatial organization of RNApolymerase and its relationship with transcription in Escherichia coli”。该工作揭示了RNA聚合酶（RNAP）簇的特征及其在细胞内空间分配模式不仅依赖于rRNA合成，并且更可能决定...