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浙江大学生命科学研究院2022年4月7日陆华松实验室在Nature Cell Biology合作发文揭示DNA损伤压力下PAPR1介导转录凝聚体动态调控的新机制（图）
陆华松 DNA损伤压力下 PAPR1介导 转录凝聚体 动态调控
2022/10/25
2022年4月7日，浙江大学生命科学研究院陆华松实验室与美国加州大学伯克利分校周强教授团队合作在Nature Cell Biology在线发表了题为“Poly(ADP-ribosylation) of P-TEFb by PARP1 disrupts phase separation to inhibit global transcription upon DNA damage”的研究论文。该工作...
DNA与B-PDEAEA自组装过程的分子动力学模拟
DNA 自组装 分子动力学模拟
2019/4/18
通过分子动力学模拟，研究DNA/B-PDEAEA纳米颗粒的自组装过程。模拟结果表明，在自组装过程中静电相互作用是主要驱动力；在相同氮磷比的条件下，随着DNA碱基对数目的增加，更易于形成稳定的纳米颗粒。在相同碱基对数目的条件下，随着氮磷比的增加，更趋向于形成稳定的纳米颗粒。
Rapid Production of Single-Stranded Sequencing Template from Amplified DNA Using Magnetic Beads
Single-Stranded Sequencing Magnetic Beads
2015/12/17
We present a powerful, general method for producing a pure preparation of single-stranded DNA (ssDNA) sequencing template from doublestranded DNA (dsDNA) amplified using the polymerase chain reaction ...
A DNA ALGORITHM FOR THE BATIMETRIC MAPPING IN THE LAGOON OF VENICE USING QUICKBIRD MULTISPECTRAL DATA
Remote Sensing Bathymetry Mapping High resolution
2015/7/29
During the last decade, several studies have focused on the use of passive multispectral remote sensing to derive the bathymetry in
coastal zone. In particular, data acquired with the SPOT and the L...
荧光光谱法研究拜复乐与小牛胸腺DNA的作用机理
拜复乐 小牛胸腺DNA 荧光光谱法 作用机理
2014/3/16
用荧光光谱法研究了拜复乐（MXFX）与小牛胸腺DNA（ctDNA）之间的相互作用。在pH=7.4的Tris-HCl缓冲溶液中，MXFX的荧光激发峰和发射峰分别位于291 nm和462 nm。ctDNA的加入对MXFX的荧光有静态猝灭作用，这种荧光静态猝灭作用是由ctDNA和MXFX结合引起的，作用力为氢键或范德华力，结合常数为1.28×105 L/mol（25 ℃）。采用离子强度的影响、碘离子猝灭...
合成了以水杨醛甘氨酸席夫碱（Sal-GlyK）、邻菲罗啉（Phen）和2，2’-联吡啶（Bipy）为配体、Eu3+、La3+为中心的配合物。对其进行了元素分析和摩尔电导、红外光谱及紫外吸收光谱测定，推测配合物的组成分别为RE（Sal-Gly）（NO3）·2H2O和RE（Sal-Gly）（Phen）（NO3）·H2O、RE（Sal-Gly）（Bipy）（NO3）·H2O（RE3+=Eu3+，La3+...
丁二酰化壳寡糖稀土配合物与鲱鱼精DNA相互作用的电化学及光谱学研究
丁二酰化壳寡糖 稀土 配合物 鲱鱼精DNA
2014/3/16
采用紫外光谱和循环伏安法，研究了丁二酰化壳寡糖稀土配合物（BCS-La、BCS-Nd）与鲱鱼精DNA之间的作用方式。BCS-La、BCS-Nd的存在导致Fe（CN）63-/4-探针分子峰电流下降，式量电位正移，表明BCS-La、BCS-Nd和探针分子与DNA之间存在竞争性作用；BCS-La和BCS-Nd分子都是通过插入方式与DNA相互作用。在一定的扫描速率范围内（0.01~0.2 V/s），在BC...
DNA折纸术是近年来提出的一种新颖的DNA自组装方法, 是DNA纳米技术和DNA自组装领域的重大研究进展之一. 与传统的DNA自组装技术不同, DNA折纸术通过一条长的环状单链DNA与一系列预设计的短链DNA片段碱基互补配对, 构造出高度复杂的二维纳米图案和三维纳米结构. 与传统纳米自组装方法相比, DNA折纸术构造的二维、三维纳米结构, 具有更佳的精细程度和可控性, 而且其实验条件要求低, 操作...
DNA纳米自组装的研究进展及应用
DNA纳米技术 DNA纳米自组装 DNA折纸术 DNA计算
2014/2/17
DNA纳米技术是一种自下而上的分子自组装模式，由分子构造为起点基于核酸分子的物理和化学性质自发地形成稳定结构，遵循严格的核酸碱基配对原则，使得DNA被用作构建结构的材料基元而不是在活细胞中那样作为遗传信息的载体. 通过合理地设计碱基链来达成精密控制的纳米级复杂结构的目的，研究人员在这个领域已经建立起诸多二维、三维的复杂纳米结构以及各种具有不同功能的分子机器，比如DNA计算机. 本文总结了近年来DN...
DNA和RNA具有精确的分子识别能力以及强大的信号存储能力. 利用DNA/RNA分子的生物学特性来构建分子级别的逻辑门并实现逻辑运算是近年来计算机科学和分子生物学交叉产生的新兴领域, 引起了研究者的广泛关注. 本文介绍了利用DNA/RNA分子的酶活性、结构特性来构建逻辑门的方法, 探讨了将单一逻辑门整合成复杂的逻辑运算的途径. 并且对于DNA/RNA逻辑门在体外检测和体内诊疗等生物医学中的应用进行...
利用磁镊研究促旋酶与DNA的结合
促旋酶 DNA 超螺旋 单分子
2013/8/21
促旋酶(gyrase)在原核生物的生命活动中扮演着重要的角色, 它是已知拓扑异构酶中, 唯一能够向DNA引入负超螺旋的酶. 本文中, 我们利用磁镊(magnetic tweezers)对促旋酶和DNA的相互作用进行了单分子实时观测. 实验发现, 在不加入ATP时, 促旋酶能够同时与两段DNA(G片段和T片段)结合, 但这种结合较弱, 施加0.7 pN的外力就能逐渐破坏两者的结合; 但加入高浓度的诺...
2012年1月5日，清华大学医学院颜宁教授研究组、生命学院施一公教授研究组以及美国普渡大学朱健康教授合作在《科学》在线发表论文，报道转录激活因子样效应蛋白（TALE）特异识别DNA的分子机理。
A new perspective on renormalization: invariant actions, a dynamical DNA
A new perspective a dynamical DNA
2011/9/5
This is a note to a quantum field theorist, interpreting the “Mallat” transformation (i.e., group invariant scattering) [1]. First the characteristics of the transformation are examined, and related t...
Conduction of DNA molecules attached to a disconnected array of metallic Ga nanoparticles
Conduction of DNA molecules disconnected array of metallic Ga nanoparticles
2010/11/17
We have investigated the conduction over a wide range of temperature of DNA molecules deposited across slits etched through a few nanometers thick platinum lm. The slits are insulating before DNA d...