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蛋白质位点特异性糖基化的定量分析对于生理病理机制探索,疾病诊断和预后标志物的筛选以及抗体药物的开发尤为重要。随着基于质谱(MS)的分析方法和解析软件的发展,蛋白质组范围内大规模完整糖肽的鉴定取得了长足进步。但与之相配套的完整糖肽定量仍存在许多问题:由于糖肽的微观不均一性,糖肽信号比裸肽信号更难识别,完整糖肽定量的准确度和缺失值数都会受到影响;基于数据依赖采集(DDA)策略的糖蛋白组学定量水平受限于...
以往认为中心法则中DNA主要发挥模板的作用而信使RNA(mRNA)则扮演着信息传递者的角色。mRNA表观修饰的发现拓展了mRNA的功能。在RNA水平上的转录后修饰可通过顺式或者反式机理调控基因表达,对细胞功能、细胞命运决定至关重要。尽管科学家们长时间以来了解RNA上存在转录后修饰,而这些修饰直到近年来才被认为从另一层面增加了基因表达调控的复杂性。迄今为止,RNA上共发现有多于150种化学修饰,包括...
2022年2月23日,厦门大学林圣彩,张宸崧及邓贤明共同通讯在Nature 在线发表题为“Low-dose metformin targets the lysosomal AMPK pathway through PEN2”的研究论文,该研究显示临床相关浓度的二甲双胍抑制溶酶体质子泵 v-ATP 酶,这是葡萄糖饥饿后 AMPK 激活的中心节点。该研究合成了一种光活性二甲双胍探针,并将 PEN2(γ...
生命科学学院、生物治疗国家重点实验室朱晓峰课题组2021年12月2日在Nature Communications (2021, 12:7030)发表了题为“Catalytic flexibility of rice glycosyltransferase OsUGT91C1 for the production of palatable steviol glycosides”的研究论文,报道了糖基...
蛋白质位点特异性糖基化的精准解析对于研究蛋白质糖基化功能、发现疾病潜在标志物及药物靶标十分重要。大规模、高准确性完整糖肽解析一直是蛋白质后修饰分析领域极具挑战性的工作。近年来,完整糖肽解析在生物质谱分析及计算糖蛋白质组领域都取得了重要进展;然而,目前解析方法仍有明显的局限性:大部分工具无法对糖链鉴定进行质控,尤其是复杂的糖型;检索速度慢;无法对多个糖基化位点精准定位;无法鉴定含有修饰糖单元的完整糖...
真核生物基因转录可分为起始,延伸和终止过程。其中终止过程涉及聚合酶减慢速度至停止,然后从基因组上解离。但相关研究比较有限,没有明确的分子机制模型。
RNA的甲基化具有多种生物学功能,在生物体内参与重要生命过程的核糖体RNA和转运RNA都是高度甲基化;信使RNA(mRNA)的帽子结构的鸟嘌呤有N-7甲基的;近年的研究发现: mRNA的内部的碱基的甲基化参与多种生物学功能的调控,这些研究已逐渐演化成一个全新的学科称为表观转录组学(Epitranscriptome)。目前研究中在生物体内催化RNA甲基化的都是蛋白质,它们利用体内普遍存在的硫腺苷甲硫...
蛋白质糖基化修饰的精准分析对于疾病机制研究、生物标志物发现,以及药物和疫苗开发至关重要。完整糖肽分析能获得特定糖基化位点与糖链的对应关系信息,是现代糖蛋白质组学研究中十分重要而极具挑战性的组成部分。目前,糖肽分析最常用的质谱采集模式是数据依赖性采集(DDA),存在母离子选择随机性的问题,其结果中存在较多的缺失值。近年来出现的数据非依赖性采集(DIA)模式能弥补DDA的缺点,已开始初步应用于糖蛋白质...

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