搜索结果: 1-15 共查到“知识库 遗传学 转录”相关记录39条 . 查询时间(0.101 秒)
Whole-body regeneration of planarians is a natural wonder but how it occurs remains elusive. It requires coordinated responses from each cell in the remaining tissue with spatial awareness to regenera...
青藏高原作为世界高原之最，低氧是人类居住的主要压力。世居于世界屋脊之上的高原藏族，成为所有高原人群中低氧适应能力最强的一个民族。藏族不仅在血氧运输中表现出较大的优势，在婴儿出生体重和成活率上也优于同海拔其他人群。前期基因组研究发现EPAS1、EGLN1及PPARA为代表的低氧通路相关基因在藏族人群中受到强烈选择，然而这些相关选择位点目前尚难以直接解释藏族人群包括生育能力在内的诸多低氧适应性表型。
研究人员开发空间转录组生物组织亚结构解析新工具（张世华等）（图）
空间转录组 结构解析 空间域 STAGATE
2022/4/25
近年来，空间转录组学（Spatial Transcriptomics，简称ST）的突破性进展使得研究人员在全基因组层面测量组织切片中特定空间位点的基因表达信息成为可能，这为研究人员破译组织的空间结构，理解复杂的生物学功能提供了条件。组织切片中具有相似基因表达空间模式的区域形成组织中特异的亚结构（简称为空间域）。精确破译空间域是空间转录组数据解析中最基本和关键的环节。然而，适用于单细胞异质性识别的经...
本研究旨在了解湖羊FSHR基因5'-UTR序列特征和转录因子调控，为揭示湖羊FSHR基因转录调控机制提供依据。采集3只成年湖羊母羊的心、肝、脾、肺、肾、胃、肌肉、大肠、小肠、子宫和卵巢11种组织，采用PCR扩增和克隆测序技术获得湖羊FSHR基因5'-UTR序列，生物信息学方法分析其序列特征，RT-PCR技术分析转录因子PAX4在湖羊11种组织中的表达情况；合成湖羊PAX4基因过表达载体pcDNA3...
转录组测序研究三角帆蚌珍珠颜色相关基因
三角帆蚌 珍珠颜色 差异表达 转录组测序
2019/1/21
为筛选影响三角帆蚌珍珠颜色的候选基因，采用转录组测序平台Illumina HiSeqTM 2500对蚌壳珍珠层颜色为紫色和白色的三角帆蚌中央膜组织进行高通量测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释，并进行差异基因聚类分析。结果显示，获得干净数据共72 800 581 bp，拼接获得了89 529个Unigene，差异表达基因...
WRKY基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子, 参与植物许多生理生化过程, 如植物发育、代谢以及生物和非生物胁迫。目前, 已在多种植物中鉴定出WRKY基因家族, 但是关于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.) WRKY基因家族的系统分析鲜有报道。文章利用生物信息学方法, 从蒺藜苜蓿全基因组中共鉴定出93个WRKY基因, 包括81个标准的WRKY基因(19个Ⅰ型基因, 49个Ⅱ...
樟树(Cinnamomum camphora )是樟科植物的一个代表种, 具有材用、药用、香料、油用和生态环境建设等多种用途。叶精油中富含利用价值极高的樟脑、芳樟醇、1,8-桉叶油素、异-橙花叔醇和右旋龙脑等萜类化合物。依据叶精油中主要成分的种类和含量, 可将樟树划分为脑樟、芳樟、油樟、异樟、龙脑樟5种化学类型。文章采用Illumina HiSeq™ 2000高通量测序技术, 对5种化...
油桐是我国重要的木本油料植物, 过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种, 与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道。文章采用RNA-seq技术对油桐种子油脂合成的3个不同时期的转录组进行比较, 获得了大量差异表达的Unigene序列。在此基础上, 通过GO分类和Pathway富集性分析将这些差异表达Unigene归类于128个代谢途径, 其中包含与油脂合成相关的脂肪酸生物合成和甘油磷脂代谢...
间充质干细胞(Mesenchymal stem cells, MSCs)是一种多能性细胞, 可分化为软骨细胞、脂肪细胞、肌细胞等不同世系细胞。一些世系特异性转录因子, 如Runt相关转录因子2 (Runt related transcription factor 2, RUNX2)、过氧化物增殖子激活型受体γ (Peroxisome proliferator-activator receptor ...
第二代测序技术不仅推进了基因组学的研究, 而且也广泛应用到转录组学的研究中。原核生物转录组学的研究方法主要有Tiling芯片和RNA-seq, 后者因其较高的覆盖率和分辨率以及越来越低廉的成本而逐渐被更多的研究单位采用。根据对mRNA富集方法或rRNA去除方法的不同, 目前RNA-seq方法主要有6种, 其中dRNA-seq由于采用了5′单磷酸依赖的外切酶, 可以特异性地降解加工过的转录本, 从而...
毛竹MYB转录因子PeMYB2的克隆与功能分析
毛竹 PeMYB2 非生物胁迫 转基因
2013/10/30
YB类转录因子在调控逆境应答基因的表达起着重要的作用,是最大的植物转录因子之一。文章通过同源基因克隆方法和RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术,以毛竹幼苗为材料, 获得一个MYB类转录因子,命名PeMYB2。氨基酸序列分析表明,PeMYB2具有典型的R2R3-MYB特征,N端含有两个串联重复保守结构域, C端含有一个膜蛋白DUF3651; 进化树分析表明...
小鼠内耳发育核心转录因子的保守性及调控网络的比较分析
内耳发育 转录因子 调控网络
2013/10/30
脊椎动物内耳发育中,Six1、Six4、Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5、Gbx2、Irx2/3、Msx1等基因作为核心调控基因参与听基板的诱导过程。文章通过生物信息学方法,对小鼠内耳发育的核心转录因子进行保守性分析并研究其相互调控关系,得到小鼠内耳发育过程中核心转录因子的基因调控网络。与文献中已知的小鼠内耳发育基因调控关系相比, Pax2、Pax8、Foxi1、Dlx5基因在内耳发育中仍...
植物HD-Zip转录因子的生物学功能
HD-Zip转录因子 生物学功能 基因表达 蛋白互作 激素途径
2013/10/30
HD-Zip转录因子属于Homeobox蛋白家族, 是植物特异转录因子, 由高度保守的HD(Homeodomain)结构域和Leu zipper(Zip)元件组成, 前者与DNA特异结合, 后者介导蛋白二聚体的形成。HD-Zip转录因子家族包括4个亚家族(HD-Zip Ⅰ-Ⅳ), 其成员通过与其他蛋白互作、参与激素介导的信号途径, 从而调控植物生长发育、光形态建成、花发育、果实发育和植物对逆境应答...
拟南芥灰霉病抗性相关转录因子
灰葡萄孢菌 转录因子 防卫反应 调控机制
2013/10/30
病原菌的侵染激发植物大量防御响应基因的表达, 其中转录因子在协调庞大的抗病防御网络中发挥重要作用。灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)是最具破坏力的死体营养型病原真菌之一, 在农业生产上造成严重的经济损失。文章综述了ERF(Ethylene response factors)、WRKY、MYB等家族中参与灰霉病防御反应的转录因子的功能研究进展。转录因子通过复杂的mRNA或蛋白水平的互作方...