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Nucleic Acids Res | 北京大学基础医学院李扬课题组和周源课题组合作揭示mRNA表观修饰调控人胚胎干细胞维持自我复制的新机制（图）
李扬课题组 周源课题组 北京大学基础医学院
2023/8/14
2023年7月27日，北京大学基础医学院细胞生物学系李扬课题组和医学生物信息学系周源课题组合作在Nucleic Acids Research（IF=14.9）杂志在线发表了题为“NAT10-mediated N4-acetylcytidine mRNA Modification Regulates Self-Renewal in Human Embryonic Stem Cells” （NAT10...
DNA加合物损伤可以由多种外源因子诱导产生，包括阳光中的紫外线、顺铂等化疗药物、香烟和汽车尾气中的苯并芘以及来自霉变食物的黄曲霉素B1等。它们会干扰DNA复制和转录，诱导突变和细胞死亡，最终导致癌症及其它疾病。
浙江大学生命科学研究院2022年5月30日黄俊实验室在Nucleic Acids Research上发文报导了RNF4调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制（图）
黄俊 复制叉翻转 维持基因 分子机制
2022/10/25
2022年5月30日，浙江大学生命科学研究院黄俊实验室在Nucleic Acids Research杂志上在线发表了题为“RNF4 controls the extent of replication fork reversal to preserve genome stability”的研究论文，揭示了细胞调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制。
Alastair Murchie-陈东戎课题组《Nucleic Acids Research》报道Twister核酶的新生物学功能（图）
环状RNA 陈东戎课题组 生物学 肠血吸虫病
2023/4/14
核酶指有催化功能的RNA。Twister核酶是生物信息学揭示的天然自剪切核酶，分布广泛且催化效率高，被应用于核糖开关、环状RNA表达载体等分子工具的研究，但目前Twister核酶的天然生物学功能未知。
浙江大学生命科学研究院2021年6月14日任艾明实验室在Nucleic Acids Research发文阐明黄嘌呤核开关复合物结构及调控机制（图）
任艾明 黄嘌呤核 开关复合物 金属离子介导
2022/10/25
2021年6月14日，浙江大学生命科学研究院任艾明课题组与奥地利因斯布鲁克大学Ronald Micura课题组合作在Nucleic Acids Research杂志上发表题为“Insights into xanthine riboswitch structure and metal ion-mediated ligand recognition”的研究论文，报道了特异性结合黄嘌呤的天然核开关NMT...
浙江大学生命科学研究院2021年6月9日方东实验室在Nucleic Acids Research发文阐明H3K36me2甲基转移酶NSD1在活性增强子区域内调控机制（图）
甲基转移酶 神经细胞瘤
2022/10/25
H3K36甲基化是生物体内重要的组蛋白修饰之一。其中H3K36me3的研究较多，主要在基因区富集，功能包括调控转录起始[1]，pre-mRNA的剪切，异常转录的抑制，RNA m6A修饰和DNA修复等。而H3K36me2目前研究较少，在基因区和基因间区都有富集，通常与其他组蛋白修饰协同调控基因的表达。之前的研究发现NSD1介导的H3K36me2可以抑制全基因组内H3K27me3的扩增[2]，从而间接...
与RNA和蛋白质一样，DNA具备酶的活性，尽管这一特性目前只在体外得到确认。在DNA的众多酶活特性中，可水解切割DNA的DNA（DNA水解自切酶）因其具备作为新型基因编辑工具的潜能受到更多关注。现有的DNA水解自切酶都是从人工合成的包含随机序列（N）的单链（ss）DNA文库中筛选得到的；大约十年前，耶鲁大学的Breaker团队建立了一套强大的体外筛选策略，借助环化酶CircLigase催化线性DN...
黄胜林课题组《Advanced Science》和《Nucleic Acids Research》揭示环形RNA癌症特异表达和作用并构建RNA剪接位点数据库（图）
环形RNA 癌症 肽 生物学
2023/4/17
RNA 剪接（RNA splicing）是真核生物 RNA 转录后加工的必要环节，是导致转录组多样性和复杂性的关键步骤。不同的 RNA 剪接方式可产生不同类型的剪接位点，包括线性剪接位点、反式剪接位点（环形RNA）和融合位点（融合基因）。因此，一个基因往往可产生多种形式的转录本，阐明转录本的具体信息，是了解基因结构和功能机制的重要基础。其中，环形RNA是一类具有特殊环状结构的RNA分子。目前研究表...
细胞的命运决定受到转录因子与表观遗传因子的协同调控，例如胚胎干细胞的多能性维持，既需要关键转录因子的正确结合（如OCT4, SOX2, NANOG等），又需要对启动子和增强子活性的精确调控，两者密不可分。它们如何协同作用是亟需解决的科学问题。基因的启动子、超级增强子和过度活化的增强子上，都会有组蛋白甲基化H3K4me3及附近的H3K4me1的共同存在。那么这两种甲基化状态，到底是不同的甲基化酶催化...
Vibrational Stark Effect Probes for Nucleic Acids
ternary complex precipitation europium pyridine-2,6-dicarboxylate fluorescence
2016/5/24
The vibrational Stark effect (VSE) has proven to be an effective method for the study of electric fields in proteins via the use of infrared probes. To explore the use of VSE in nucleic acids, we inve...