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RNA编辑作为一种重要的共/转录后修饰,能够诱导内源性及外源性RNA序列的核苷酸发生改变。这种变化在几乎所有细胞生命的众多生物过程中发挥重要作用,并与包括癌症在内的多种人类疾病息息相关。在后生动物中,主要的RNA编辑类型包括A-to-I与C-to-U两种,分别由ADAR和APOBEC家族酶催化。除催化活性外,作为RNA结合蛋白的ADARs和APOBECs还可以直接与RNA底物相互作用,从而对内源性...
Asymptotic distribution of motifs in a stochastic context-free grammar model of RNA folding
Asymptotic distribution of motifs stochastic context-free grammar model of RNA folding Biomolecules
2012/5/2
We analyze the distribution of RNA secondary structures given by the Knudsen-Hein stochastic context-free grammar used in the prediction program Pfold. We prove that the distribution of base pairs, he...
McGenus: A Monte Carlo algorithm to predict RNA secondary structures with pseudoknots
McGenus Monte Carlo algorithm RNA secondary structures pseudoknots
2012/4/28
We present McGenus, an algorithm to predict RNA secondary structures with pseudoknots. The method is based on a classification of RNA structures according to their topological genus. McGenus can treat...
定量RT-PCR中人干细胞因子的RNA-CRS的构建
基因表达定量 定量RT-PCR 人干细胞因子基因
2008/9/3
一种适用于定量RT-PCR、用ExonucleaseⅢ部分酶切剔除技术,构建人干细胞因子(hSCF)基因的RNA竞争性参考标准(RNA-CRS)的新方法:用RT-PCR技术,从HepG2细胞中扩增出全长人hSCF cDNA,并克隆入质粒pGEM-T获重组的pGEMSCF载体,经ExonucleaseⅢ和S1核酸酶适当处理,以导致hSCF cDNA中一小片段缺失,由此获得重组pGEMSCF...
叶绿体中低分子量核糖体RNA的制备
叶绿体 低分子量核糖体 RNA
2008/1/18
高等植物叶绿体中的70S核糖体,是由50 S大亚基和30S小亚基所组成的。前者含有23S RNA,后者含有16S RNA,两者均属高分子量 r RNA['1。此外,50S大亚基中还含有两个低分子量的RNA,即5S与4.5S RNA"','], 5S RNA 大约含有120个核昔酸[37,分子量约为4 X 10' 道尔顿,为真核与原核生物所共有,也为高等植物叶绿体核糖体和细胞质核糖体所同时共有。 4...
RNA诱导沉默复合体中的生物大分子及其装配
RNA诱导沉默复合体 装配 Dicer Argonaute蛋白 R2D2
2007/12/26
摘要在RNA干扰机制中,双链RNA诱导同源RNA降解的过程依赖于RNA诱导沉默复合体(RISC)的活性。RISC由Dicer酶,Argonaute蛋白,siRNA等多种生物大分子装配而成,对这些大分子的结构和功能进行深入细致的研究,有助于进一步了解RISC的形成过程、作用方式,以及阐明整个RNAi过程的作用机制。研究表明,RISC中的Dicer具有RNaseIII结构域,在RNAi的起始阶段负责催...