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SARS病毒基因组的多态性
SARS相关冠状病毒 基因组 多态性
2008/2/8
摘要对SARS病人粪便样本直接测序，得到SRAS-CoVBJ202全基因组序列(AY864806)。应用比较基因组研究方法对GenBank中公布的115株SARS-CoV基因组序列以及BJ202进行分析。以GZ02序列为参照，发现2个以上基因组中同时存在单核苷酸多态（SNP）位点共278个。多态位点在SARS-CoV基因组中呈偏态分布，大约一半突变位点（50.4%,140/278）发生在基因组3′...
冠状病毒的新成员----SARS-CoV的基因组特性
SARS-CoV 基因组特性 冗余分析
2008/1/23
2003年3月，人类发现一种新的冠状病毒SARS-CoV，这种病毒是非典型性肺炎(SARS）的病原体。SARS-CoV的基因组序列已经由包括中国科学家在内的全世界的科研人员测定完成。该文对国际报道的SARS病源的基因序列进行了收录，阐述了SARS-CoV基因组的基本特性：SARS-CoV的基因组长约28～30 kb，与冠状病毒科的基因组长度相符合，其中包括11个编码序列，基因组的组织方式也与其他冠...
SARS冠状病毒全基因组序列初步分析
SARS冠状病毒 多序列比对 蛋白质序列分析 生物信息学
2008/1/23
对已经完成全序列测定的12个SARS病毒基因组进行了多序列比对，发现序列主体部分29708 b具有99.82%的相同碱基，除2个序列各有5个和6个碱基的缺失外，其余部分共有42个位点核苷酸碱基的差异，其中28个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变。利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具，分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像，推测了可能产生的结构和功能改变，为进一步生物学实...
SARS-Cov及其他冠状病毒基因组比较分析The Genome Comparison of SARS-CoV and Other Coronaviruses
严重急性呼吸系统综合征(SARS) 冠状病毒 多态 进化
2007/12/30
摘要摘要：对病毒种内和种间基因组的比较分析能获得很多关于病毒起源与演化的信息。对17株SARS-CoV的种内基因组变异分析发现共有137个变异位点，估算出SARS-CoV的突变率为8.04×10-3核苷酸替换/位点/年。变异位点在基因组上的分布不均匀，变异位点最多的是基因组中编码S1蛋白的区域，而在编码依赖于RNA的RNA聚合酶区域中几乎没有变异位点。核苷酸和氨基酸替换的偏性预示变异可能不仅仅是由...
SARS-CoVS基因表达及纯化
SARS S蛋白 表达纯化 血清检测
2007/11/5
严重急性呼吸道综合症是由一种新的冠状病毒SARS-CoV引起的.作者通过PCR扩增得到了S蛋白的6个编码片段,并利用表达载体pET28a(+)在E.coli BL21中进行了原核表达.通过亲和层析纯化了包含大部分ACE2结合区域的S蛋白片段(S4).ELISA分析结果表明S4与SARS病人恢复期血清具有良好的反应能力.
SARS病毒S蛋白的原核表达与DNA疫苗的构建
2007/7/25
严重急性呼吸综合征(SARS)的病原体为SARS冠状病毒[1]。其中S蛋白是病毒外壳组分，是SARS- CoV的主要表面抗原，也是病毒和宿主细胞受体结合及病毒诱发机体产生抗体或细胞免疫反应的重要因子。刺突(spike, S)蛋白属于I型膜蛋白，它是SARS-CoV结构蛋白中最大的，含1 255个氨基酸残基，相对分子质量为139 170 kD[2]。S蛋白前体在宿主的细胞质中合成以后会被切成两个部分...
SARS冠状病毒N基因的扩增与克隆
2007/7/25
2003年4月16日，WHO正式确认SARS冠状病毒是SARS感染的病原体。生物信息学分析和病毒学研究表明，SARS冠状病毒不属于任何已知的冠状病毒家系，是一类新型病毒[1][2]。SARS病毒颗粒周围环绕着象日冕一样的圆环，圆环之上和外壳表面分布着大大小小的蛋白。但对感染致病起重要作用的可能是6种关键蛋白：E蛋白、S蛋白、M蛋白、N蛋白、多聚酶和3CL蛋白水解酶[2][3]。本研究应用自行设计的...
抗SARS冠状病毒S1蛋白N端249至667的单克隆抗体的制备与鉴定
2007/7/25
A novel coronavirus has been identified as the ma-jor cause of sever acute respiratory syndrome (SARS)[1][2][3], but the biological functions of this SARS-associated coronavirus (SARS-CoV) remain curr...
SARS冠状病毒多聚酶基因临床检测方法的建立
2007/7/25
自2002年11月中旬以来，先后在广东和世界一些国家和地区流行一种以发热(>38 ℃)和咳嗽(主要是干咳)为主要症状、少数可以很快出现呼吸困难甚至呼吸衰竭、肺部病变进展迅速的急性非典型肺炎，后来被世界卫生组织(WHO)命名为严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome， SARS)[1][2]。由于SARS主要经飞沫传播，对于与患者密切接触者传染率很...