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中国科学院昆明植物研究所兰属植物DNA条形码研究取得新进展（图）
兰属植物 DNA条形码
2022/12/5
物种准确鉴定是开展生物多样性保护、资源可持续利用和系统演化研究的重要前提和保障。兰属（Cymbidium）植物，特别是国兰，包括春兰、惠兰、建兰、墨兰、莲瓣兰等，叶态优美且具有浓郁的甜香味，深受东亚各国人民喜爱，其中不少种类在我国已有两千多年的栽培历史，具有较高的经济、文化、保护和研究价值。该属以中国为分布中心，约70个物种。其物种的准确鉴定，有利于新品种的选育和野生物种的保护与监测，但该属物种的...
Plants are marvelous chemists, the gardenia's DNA shows（图）
Plant marvelous chemists gardenia DNA shows
2020/7/3
Plants are some of nature's most extraordinary chemists. Unlike animals, they can't run from predators or pathogens. They can't uproot to seek out mates or spread their seeds. Instead, they manufactur...
表观遗传修饰尤其是DNA甲基化和组蛋白修饰在基因表达调控中起重要“开关”作用。前期研究证实蒺藜苜蓿(Medicago truncatula) MtMYBS1是参与植物盐胁迫应答的重要功能基因。本文采用反转录PCR (RTPCR)、重亚硫酸盐测序PCR (BSP)和染色质免疫沉淀(ChIP)等技术分析了MtMYBS1在盐胁迫过程中的表达、DNA甲基化及组蛋白修饰状态。盐胁迫下伴随着MtMYBS1的上...
以菊花的扦插生根苗为试材, 在缺氮和适氮水培条件下, 分别使用甲基化抑制剂(5-azaC)和甲基供体(SAM)处理菊花根系, 测定处理后基因组DNA甲基化水平变化、根系构型相关参数、根系硝态氮含量以及NO3-转运蛋白基因CmNRT1.1、CmNRT2.1、CmNAR2.1的相对表达量。结果表明, 在适氮条件下, 5-azaC处理的菊花根系DNA甲基化水平降低, 根系总直径、总表面积及总体积增大; ...
种子活力和DNA甲基化关系的研究进展
种子活力 DNA甲基化 激素 表观遗传
2018/11/22
种子活力在发育中逐渐形成, 成熟期随着水分的减少, 种子获得最大活力。期间发生了许多重要的生理生化反应, 如营养物质大量积累、酶和mRNA的钝化等, 为种子活力的保持和萌发做好准备。植物中有20%~30%的核基因组DNA胞嘧啶处于甲基化状态, DNA甲基化可以调节基因的表达, 维持植物基因组稳定。而植物的DNA甲基化状态在不同器官、不同组织、甚至发育的不同阶段都是不同的, 这与遗传和外界环境的刺激...
对山葡萄(Vitis amurensis)种质资源样品的ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK序列进行PCR扩增及测序, 优化PCR反应的退火温度, 比较各序列的扩增效率、测序成功率、品种间和品种内的差异及barcoding gap图, 使用BLAST和NJ树法比较不同序列的鉴定能力, 最终从5条DNA片段中筛选出可用于山葡萄种质资源鉴定的DNA条形码通用序列。结果表明, 在采集...
一个参与拟南芥DNA去甲基化过程候选基因的定位与功能分析
拟南芥 rll1 图位克隆 DNA去甲基化
2018/12/26
以转基因拟南芥(Arabidopsis thaliana) Col-LUC为亲本材料, 把它的种子进行甲基磺酸乙酯(EMS)诱变, 在M2代幼苗中筛选出一株荧光降低的候选突变体, 命名为rll1 (reduced LUC luminescence 1), 此突变基因对应的野生型基因位点因此被命名为AtRLL1位点。该突变体在生长发育方面表现出明显矮化、角果较短、叶片较小的发育缺陷表型。遗传学分析表...
应用SELEX技术检测水稻RFL转录因子的DNA结合位点
水稻 转录因子 SELEX DNA结合位点
2018/6/28
FLORICAULA/LEAFY是植物特有的转录因子, 其可以通过调控下游基因的表达对植物的发育起到调控作用。水稻(Oryza sativa)中的同源基因RFL (Rice FLORICAULA/LEAFY)能够调控多个发育过程, 包括开花、叶间期以及枝梗和颖花分化。指数富集配体的系统进化(SELEX)技术已经被广泛应用于体外筛选转录因子的DNA结合位点。应用SELEX技术检测水稻RFL的DNA结...
不同单株叶籽银杏DNA甲基化水平与模式的MSAP分析
叶籽银杏 DNA甲基化 MSAP分析 表观遗传学
2013/9/4
以叶籽银杏和普通银杏叶片为试材,利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于叶籽银杏全基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平对11株叶籽银杏和1株正常银杏的胞嘧啶甲基化水平和模式进行评估。结果表明,从36对MSAP选扩引物中,选出14对MSAP引物组合,共扩增产生2766条清晰可辨且可重复的DNA条带,产生3种类型的甲基化条带。在全部扩增位点中,检测到叶籽银杏基因组...
Integration and characterization of T-DNA insertion in upland cotton
cotton (Gossypium hirsutum L.) deletion of border genetic transformation transgene copy vector integration
2014/2/24
Copy numbers were evaluated by real-time quantitative PCR, and 149 junctions of T-DNA were isolated by thermal asymmetric interlaced PCR from 92 independent transgenic cotton lines transformed by Agro...
Range-wide chloroplast and mitochondrial DNA imprints reveal multiple lineages and complex biogeographic history for Douglas-fir
chloroplast mitochondrial DNA imprints biogeographic history for Douglas-fir
2011/12/31
The contemporary genetic structure of species offers key imprints of how organisms responded to past geological and climatic events, which have played a crucial role in shaping the current geographica...
系统发育群落生态学是近年兴起的一个重要生态学研究分支, 它以群落生态学为基础并引入了系统发育的分析方法, 全面动态地反映了群落中物种内和物种间的相互作用关系, 揭示了群落格局形成的生态学过程, 研究了生物多样性的形成及维持机制。巴拿马BCI (Barro Colorado Island)样地的成功例子说明, 在固定样地进行长期的群落生态与系统发育研究切实可行且极具意义; DNA条形码的快速兴起对这...
甘露醇对拟南芥基因组DNA甲基化的影响
拟南芥 DNA甲基化 甘露醇 MSAP
2011/11/7
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料, 研究不同浓度甘露醇处理下拟南芥幼苗生长发育及其基因组DNA的甲基化水平和变化模式。结果表明, 用50、100、150和200 mmol·L―1甘露醇处理拟南芥种子会对拟南芥幼苗的形态特征和生长态势产生影响; 甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism, MSAP...
对锦葵科植物样品的ITS、ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列进行PCR扩增和测序, 比较各序列的扩增效率、测序成功率、种内和种间变异的差异以及barcoding gap图, 使用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力, 进而从这些候选序列中筛选出较适合锦葵科植物鉴别的DNA条形码序列。结果表明, ITS序列在采集的锦葵科植物11个种26个样品中的...