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Briefings in Bioinformatics丨杨力团队开发RNAlight工具用于多类型RNA的亚细胞定位预测研究（图）
杨力团队 RNA亚细胞 生物医学研究院 核苷酸序列
2023/4/14
RNA亚细胞定位与其生成、加工和功能密切相关（1,2），因此，解析RNA的亚细胞定位对其功能研究至关重要。利用传统的实验生物学方法，如FISH和细胞组分分离后鉴定等可以有效的发现目的RNA的亚细胞定位，但是其通量较低、且不同实验方法的特异性也会导致某些RNA无法被准确定位。近期，结合亚细胞RNA组分分离和后续高通量测序分析，大量的RNA亚细胞定位信息被报道，利用这些数据并结合机器学习和深度学习的方...
上海兽医研究所宠物团队总结了RNA病毒调控宿主核糖体的机制（图）
RNA病毒调控 宿主核糖体
2022/12/13
2022年11月29日，中国农业科学院上海兽医研究所伴侣动物生物安全风险预警及防控技术团队回顾了RNA病毒调节宿主的核糖体机制，特别是RNA病毒诱导形成宿主形成病毒蛋白翻译所需的特定型核糖体（heterogeneous ribosomes）机制的研究进展，为研究病毒蛋白翻译机制提供新的思路。相关成果以“Ribosomal Control in RNA Virus-Infected Cells”为题...
Annual Review of Cell and Developmental Biology丨杨力研究员受邀合作发表环形RNA长篇年鉴综述（图）
杨力研究员 生物医学研究院 生物化学
2023/4/14
2022年10月，复旦大学生物医学研究院杨力研究员受邀与国际同行在Annual Review of Cell and Developmental Biology期刊正式发表了题为“Biogenesis and Regulatory Roles of Circular RNAs”的长篇年鉴综述论文。该论文从同类型环形RNA的研究历程入手，将众多同类型的环形RNA依据其生成加工机制进行了系统分类，并针...
近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的人类长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）数据库LncBook 2.0正式上线。该研究内容以“LncBook 2.0: integrating human long non-coding RNAs with multi-omics annotations”为题在国际学术期刊Nucle...
2022年11月22日，国际学术期刊 Cell Reports 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）鲍岚研究组的最新研究进展“ m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF1/3 and facilitating mRNA translat...
2022年11月22日，国际学术期刊 Cell Reports 在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）鲍岚研究组的最新研究进展“ m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF1/3 and facilitating mRNA translat...
2022年11月18日，《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心刘宏涛研究组撰写的题为CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternative splicing的研究论文。该研究揭示了蓝光和环境温度通过CRY2-CIS1-FLM信号...
2022年11月18日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心刘宏涛研究组题为“CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternative splicing”的研究论文，本文揭示蓝光和环境温度通过CRY2–CIS1–FLM信号通路调节开花...
2022年11月18日，国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心刘宏涛研究组题为“CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternative splicing”的研究论文，本文揭示蓝光和环境温度通过CRY2–CIS1–FLM信号通路调节开花...
细胞内RNA作为指导蛋白质翻译的模板，受到了多种调控和修饰。不同的情况下，基因产生的转录本表达水平会发生改变，乃至产生不同的转录异构体，进而形成多种蛋白质亚型。在RNA转录本水平进行研究，可以更加精准地描绘癌症转录组的改变。然而，目前大部分的研究是在基因水平，而忽视了RNA转录本的多样性，尚未有研究系统性地分析大规模人源癌细胞系的转录本图谱，并揭示其调控及与抗肿瘤药物敏感性的关系。
新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证
新冠病毒 细胞RNA 微生物学 病毒甲基化
2023/5/29
据物理学家组织网2022年11月9日报道，通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集，巴西圣保罗联邦大学（UNIFESP）的科学家首次证明，新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。
In recent years, scientists who study gene expression in cells have used a method that essentially pins a tail on RNA and tracks their whereabouts. However, certain types of RNA evade the process. Now...
中国科学院分子植物卓越中心等发现新型植物RNA低温感受器（图）
分子植物 植物RNA 低温感受器
2022/11/2
低温胁迫是限制植物分布的主要环境因素之一，感知低温信号是植物适应寒冷环境的基础。植物在低温中呈现出生长减缓、开花延迟等表型以适应低温环境。鉴定植物的冷感受器是解析植物低温感知分子机制的关键。
低温胁迫是限制植物分布的主要环境因素之一，感知低温信号是植物适应寒冷环境的基础。植物在低温中呈现出生长减缓，开花延迟等表型以适应低温环境，鉴定植物的冷感受器是解析植物低温感知分子机制的关键。
中国科学院分子植物科学卓越创新中心杨小飞研究组合作发现新型植物RNA低温感受器（图）
杨小飞 转基因植物 低温感受器
2023/11/18
低温胁迫是限制植物分布的主要环境因素之一，感知低温信号是植物适应寒冷环境的基础。植物在低温中呈现出生长减缓，开花延迟等表型以适应低温环境，鉴定植物的冷感受器是解析植物低温感知分子机制的关键。