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天津工业生物所开发出代谢途径计算及可视化平台CAVE（图）
代谢途径 计算生物学 合成生物学
2023/7/7
代谢工程可以通过基因改造将生物体内代谢通量重新定向到目标产物合成，从而构建高效工业菌株，实现化学品、药物和生物燃料的绿色生物制造。基因组尺度代谢网络模型（Genome-scale metabolic model，GEM）分析可以计算特定菌种中的产物合成最优途径，从而预测可能的代谢工程改造靶点。通量平衡分析（Flux balance analysis，FBA）是GEM分析中最广泛使用的途径设计算法，...
厌氧消化已被广泛证明是一种经济高效、且碳排放较低的餐厨垃圾处置手段。接种比(S/I)是影响厌氧消化稳定性的重要参数之一，对于批次反应器的启动以及甲烷和有机酸生成的定向调控具有重要意义。过高的S/I可能会导致毒性，破坏微生物之间的互营关系，并使反应器产生不可逆的酸化；而过低的S/I则会抑制厌氧消化过程中所需酶的诱导，使其难以达到最大的甲烷产量。目前，在不同的研究中，所得出的最优S/I各不相同。底物的...
中国科学院天津工业生物技术研究所研究员张大伟带领的蛋白质合成与微生物代谢研究团队与研究员林建平带领的酶设计平台团队合作，实现了在同一个蛋白模板上，建立糖酵解途径（EMP）和磷酸戊糖途径（PPP）中3个生物传感器。研究人员基于蛋白型生物传感器机理，以人源的次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶（HGPRT）为配体结合域，建立了磷酸戊糖途径中5-磷酸核糖-1-焦磷酸（PRPP）生物传感器，并以该蛋白作为模板，...
重庆医科大学医用有机课件第十九章 代谢途径中的辅酶。
我国科学家发现新型氮代谢途径
氮代谢途径 植物生理生态
2018/4/12
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所杨琛研究组利用动态代谢流量组与代谢组分析技术，首次发现了一条新型氮代谢途径——鸟氨酸—氨循环。专家表示，这一发现有助于合成生物学家设计和改造蓝藻、实现二氧化碳到生物燃料和化学品的直接转化，同时为理解和提高农作物的氮素使用效率提供新思路。该研究4月9日在线发表于《自然—化学生物学》。