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2024年3月13日，中国科学院动物研究所曲静研究组、刘光慧研究组联合中国科学院北京基因组研究所张维绮课题组在Developmental Cell在线发表了题为“The sirtuin-associated human senescence program converges on the activation of placenta-specific gene PAPPA”的研究论文。该研究深度...
华中农业大学郑波教授课题组开发蛋白家族系统发育分析新方法
郑波 蛋白家族 发育分析
2022/11/26
2022年7月20日，华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室郑波教授课题组在Briefings in Bioinformatics在线发表了题为“CProtMEDIAS: clustering of amino acid sequences encoded by gene families by MErging and DIgitizing Aligned Sequences”的研究论文。该论...
中国科学院上海营养与健康研究所李于研究组发表转录因子ATF/CREB蛋白家族调控肝脏糖脂代谢与细胞生长的综述论文（图）
李于 转录因子ATF/CREB 蛋白家族 肝脏 糖脂代谢 细胞生长
2021/2/26
2021年2月20日，中国科学院上海营养与健康研究所李于研究员在国际学术期刊Diabetes在线发表题为“Regulation of hepatic metabolism and cell growth by the ATF/CREB family of transcription factor”的综述论文。文章系统性地总结了转录因子ATF/CREB蛋白家族在肝脏糖脂代谢、细胞生长以及肿瘤中的相关...
研究表明鸟类丢失了许多在其他脊椎动物中保守的功能基因。人类与小鼠缺失这些功能基因通常会致死或致病，而鸟类并不表现出相应病症。因此，探索鸟类如何应对基因缺失引起的生化与生理功能丧失，对理解鸟类适应进化与人类疾病具有重要意义。此方面目前有两种假说：1. 功能基因缺失与鸟类特化性状有关，如丢失UCP1和KIRREL2基因可能造成鸟类非颤抖性产热丢失和低肾小球滤过率。2. 近缘基因或同源多拷贝基因可能为丢...
人类微生物组中新发现数千种小蛋白家族
阿尔茨海默氏症 癌症疗法 微生物蛋白
2022/3/2
据《细胞》杂志近日报道，研究人员在人类微生物组中发现了 4000 多个新的小蛋白家族。这项研究是通过识别和编目将小微生物蛋白与人类疾病联系起来的第一个 “关键步骤”。
植物载脂蛋白(lipocalins)是一类起源于绿藻、在低等植物和高等植物中广泛存在的蛋白家族, 分为载脂蛋白和类载脂蛋白两亚类。该蛋白定位于细胞膜和叶绿体, 暗示其参与植物的生长发育和抗逆响应过程。本文综述了近年来该家族蛋白的起源、蛋白结构、亚细胞定位, 以及在非生物逆境抗性和脱落酸(ABA)合成代谢中的生理功能与作用机制。该家族蛋白可能参与维持细胞膜的稳定性、脂类结合与转运、叶绿体中叶黄素循环...
C1q蛋白家族的结构、分布、分类和功能
胶原样区 C1q球状结构域 补体系统 模式识别受体
2013/10/30
C1q蛋白家族由众多含C1q结构域的蛋白组成, 从细菌到高等哺乳动物中都有分布。这类蛋白由一条信号肽、胶原样区(Collage-like region, CLR)和C1q球状结构域(Globular C1q domain, gC1q)组成。C1q蛋白家族根据其结构特点, 可分为三大类分子：C1q、C1q-like和ghC1q。C1q是补体经典途径的起始分子, 能够识别免疫复合物, 启动补体系统经典...
豌豆蚜Acyrthosiphon pisum是一种重要的刺吸式害虫， 其分泌的唾液对取食寄主植物和传播植物病毒有重要的作用。为了探讨蚜虫唾液蛋白的功能， 本研究克隆了在豌豆蚜唾液腺高表达的一个未知功能的蛋白家族， 该家族包括13个基因， 编码14种蛋白， 其中4个基因在唾液腺高表达。这个家族是蚜虫特有的蛋白家族， 富含半胱氨酸， 有14个半胱氨酸高度保守， 其中6个半胱氨酸形成3个保守的CXXC结...
拟南芥PHD-finger蛋白家族的全基因组分析
PHD-finger 拟南芥 基因家族
2009/10/15
PHD-finger 蛋白是一类广泛存在于真核生物中, 在基因转录和染色质状态调控方面有重要作用的锌指蛋白。目前在动物中对PHD-finger 蛋白的结构和功能方面的研究较为广泛和深入, 而在植物中仅有少数PHD-finger 蛋白的功能被阐明。通过SMART 和Pfam等数据库分析, 我们发现拟南芥中共有70 个PHD-finger蛋白, 其中大部分PHD-finger 蛋白的功能未知。本文通过...
凝血因子Ⅸ/凝血因子Ⅹ结合蛋白家族的研究进展
抗凝剂 凝血因子Ⅸ/Ⅹ结合蛋白 蛇毒 钙离子
2008/7/8
凝血因子Ⅸ/Ⅹ结合蛋白家族是近来发现的C型动物凝集素超家族中一个亚家族.它们存在于蝰科蛇毒中，不具有酶活性，通过与凝血因子Ⅸ或凝血因子Ⅹ结合来延长凝血时间.在钙离子存在下结合在凝血因子Ⅸ/Ⅹ分子中γ-羧基谷氨酸区域.它们彼此之间具有很高的序列同源性，都是由两条同源的肽链通过一对二硫键相连.两条肽链都具有C型糖识别区的二硫键构型，各含一个钙离子结合位点.其中habu凝血因子Ⅸ/Ⅹ结合蛋白的晶...
摘要基于隐马可夫模型，利用已知丝氨酸羧肽酶（Serine Carboxypeptidases, SCP）氨基酸序列作为训练集，搜索拟南芥全蛋白质组数据库，鉴定了54个推定的SCPL（丝氨酸羧肽酶类，Serine Carboxypeptidase-Like）基因，详细分析了各基因的结构特征、染色体定位与编码的蛋白质序列，发现7个可能最近发生复制事件的基因簇聚区，并且其SCPL基因广泛存在交替剪接方式...
摘要通过隐马尔柯夫模型(Hidden Markov model，HMM)，对粳稻(Oryza sativa L.ssp. japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索，结果获得 8 个 14-3-3 蛋白的同源序列，其中发现 4 个新基因。通过对所有粳稻的 14-3-3 蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(Expression Sequence Tags，ESTs) 进一步比对，为 14-3-3...
金属硫蛋白家族内的结构域拼接
金属硫蛋白 发酵 神经生长抑制因子 结构
2007/12/22
摘要 金属硫蛋白(Metallothioneins,MTs)由结构独立且功能明显区别的β，α两个结构域组成。神经生长抑制因子(NeuronalGrowthInhibitoryFactor,GIF)双名金属硫蛋白-Ⅲ(MT-Ⅲ)，是神经系统中第一个被鉴定的具有神经元生长抑制功能的蛋白，而β－结构域为其功能结构域。为深入系统地研究MTs，尤其是GIF及其结构域的结构与功能，我们构建了金属硫蛋白家族内结...
甲基化CpG结合蛋白家族研究进展
2007/12/19
摘要 甲基化CpG结合蛋白家族是一类能与甲基化CpG岛特异性结合并相互作用的蛋白质，它们具有共同的甲基化CpG结合域(methyl-CpG-binding domain , MBD)，并与组蛋白去乙酰化酶、组蛋白乙酰化酶、组蛋白甲基化酶和DNA甲基转移酶有着广泛的联系，将DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质构象改变紧密联系起来，在X染色体失活、印记基因沉默和肿瘤细胞抑癌基因沉默中发挥关键性的枢纽作用。...