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东北地理所在大豆氨基酸转运蛋白基因家族分析取得进展（图）
大豆氨基酸 蛋白 基因 分析
2024/4/28
大豆（Glycine max (L.) Merr.）是一种重要的经济和油料作物，全球约30%的食用油和69%的膳食蛋白质来自大豆。大豆蛋白质因富含人类必需的8种必需氨基酸，被誉为“最理想的蛋白来源之一”，较动物蛋白具有低热量、不含胆固醇、无激素和抗生素超标风险等优点。在我国，豆油在占植物油食用消费的50%左右，豆粕在饲料蛋白中的占比达80%。我国过度依赖国外大豆进口（约85%）主要是由于用于动物的...
南京农业大学专利：一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法
南京农业大学 宏基因组 溯源土壤 耐药基因污染
2023/11/28
本发明公开了一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法，其步骤为：步骤一、构建非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤二、封装非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤三、土壤样品DNA抽提和建库；步骤四、采用Illumina测序技术完成土壤样品的宏基因组测序；步骤五、对测序数据进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据；步骤六、对质控数据进行耐药基因定量分析；步骤七、不同样品的耐药基因丰度总体比较分析并可视化...
南京农业大学专利：一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法
南京农业大学 土壤细菌 遗传元件 宏基因组
2023/11/28
本发明公开了一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法，其步骤为：步骤一、构建MGEs数据库；步骤二、构建非冗余蛋白质集合；步骤三、使用Reads Mapping的方法对非冗余蛋白质集合进行MGEs信息注释，获取MGEs物种溯源信息；步骤四、通过筛选并去除冗余后构建MGEs物种溯源数据库；步骤五、对MGEs物种溯源数据库封装，搭建分析平台；步骤六、采集环境样品进行DNA抽提建库，用Illum...
中国科学院大连化学物理研究所专利：一种细胞内纳米粒子表面蛋白质环冠的稳定同位素标记分析方法
中国科学院大连化学物理研究所 专利 细胞 纳米粒子 表面蛋白质环冠 稳定同位素 标记分析
2023/11/9
本发明的目的在于提供一种细胞内纳米粒子表面蛋白质环冠的稳定同位素标记分析方法。它通过将细胞内的蛋白质进行稳定同位素的重标标记来区分纳米粒子上吸附的其他蛋白质。通过鸟枪法蛋白质组学技术进行检测时，得到的由包含稳定同位素标记的肽段鉴定到的蛋白和由不含稳定同位素标记的肽段鉴定到的蛋白分别来自细胞和血浆，从而可以准确的鉴定和分辨细胞内纳米粒子表面的蛋白质环冠的组成成分。该方法第一次实现了细胞内纳米材料表面...
本发明涉及蛋白质的在线富集，洗脱，荧光标记，检测的微型装置。本装置由微流体控制系统、微型激光诱导荧光检测系统、微流控芯片、进样阀、连接管路和接口、数据采集处理等部分组成。蛋白质样品被芯片通道中的富集柱富集，洗脱同时在线荧光标记，经激光诱导荧光检测。本发明的优点是，将样品预处理过程、荧光标记及检测实现在线集成化，省去离线分析方法中的繁琐步骤，大大缩短了样品处理时间，并实现了高灵敏度检测；整个装置体积...
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样，恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点，导致下游的数据处理分析更为困难繁琐，亟需发展可高效处理多样的蛋白质组学数据的下游分析工具。
广州健康院开发定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具（图）
蛋白质 数据分析
2023/11/8
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其它组学方法一样，恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点，导致下游的数据处理分析更为困难繁琐，亟需一个可高效处理多样的蛋白质组学数据的下游分析工具。
中国科学家领衔创建新的全基因组分析方法并发现人类在早、中更新世过渡期经历严重的群体瓶颈（图）
基因 分析 群体瓶颈
2023/11/30
2023年9月1日，国际学术期刊Science在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李海鹏研究组与华东师范大学脑功能基因组学研究所潘逸萱研究组合作的题为“Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle Pleistocene transition”的最新研究成果。该研究创建了快速极小时间溯祖（Fi...
科学家利用大规模基因组关联分析确定青光眼风险位点
基因组 关联分析 青光眼 风险位点
2024/1/16
青光眼是导致不可逆失明的主要原因，是一种高度遗传相关的人类疾病。过去的全基因组关联研究已经为最常见的原发性开角型青光眼确定了100多个风险位点。澳大利亚昆士兰医学研究院伯格霍夫医学研究所利用大规模、多特征全基因组关联分析确定了数百个青光眼风险位点。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Large-scale multitrait genome-wide associ...
【分析化学学术报告】Mass Spectrometric detection of membrane-bound proteins and their noncovalent interaction partners（图）
membrane-bound proteins noncovalent
2023/6/20
【分析化学学术报告】Mass Spectrometric detection of membrane-bound proteins and their noncovalent interaction partners
近日，中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所基因组学团队副研究员张帆研发了名为CRISPRimmunity的分析服务平台。该平台是识别CRISPR相关重要分子事件以及用于基因编辑调节器的交互式网络服务器。相关研究成果发表在Nucleic Acids Research上。
中国科学院合肥研究院研发出面向CRISPR的综合分析预测工具及平台（图）
合肥 预测工具 蛋白 基因
2023/6/9
2023年6月6日，中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所基因组学团队研究员张帆研发了名为CRISPRimmunity的分析服务平台。该平台是识别CRISPR相关重要分子事件以及用于基因编辑调节器的交互式网络服务器。相关研究成果发表在Nucleic Acids Research上。
蛋白质作为疾病生物标志物和药物靶点在现代生物医学中具有举足轻重的作用，蛋白质组学是分析生物体内所有蛋白质的组成与定量的有效手段。传统的蛋白质组检测的是整块组织或分离后的细胞中的蛋白表达水平，失去了空间位置信息。然而，由于组织异质性，组织中不同细胞表达的蛋白种类和数量可能存在显著性差异，获得组织空间定位的蛋白表达图谱有助于解析组织微环境、肿瘤异质性，并在疾病的精细化诊断、药物选择及预后评估等方面发挥...
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员、秦洪强研究员团队开发了表征蛋白质中组氨酸残基反应活性的蛋白质组学分析新方法。该工作筛选并获得了具有组氨酸优异反应效率的α, β-不饱和醛探针，发展了基于烯醛探针的组氨酸标记技术和可逆酰肼化学富集方法，通过蛋白质组定量技术实现了人类蛋白质组中的组氨酸反应活性的高效表征。
中国科学院大连化学物理研究所开发出精氨酸二甲基化蛋白质组分析新方法（图）
精氨酸 二甲基化 蛋白质
2022/10/21
2022年10月19日，中国科学院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队和上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪研究员团队合作，将硼酸化学引入到甲基化蛋白质组分析方法中，并巧妙利用了精氨酸残基上不同修饰基团的位阻差异，实现了高效的精氨酸二甲基化肽段富集，显著提高了蛋白质甲基化的分析能力；利用此新方法，系统分析了蛋白质分相过程中精氨酸二甲基化的变化，揭...