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龚洵团队在苏铁属的分子系统发育框架研究上取得进展（图）
龚洵 苏铁属 分子系统 植物
2018/6/15
苏铁属(Cycas)是现存现存苏铁类植物中分布最广、种类最多的一个属，且多数物种被列入IUCN红色名录，处于濒危状况。该属共有115种，主要分布在亚洲东部以及东南部、大洋洲以及周围岛屿、非洲东部及马达加斯加岛的热带亚热带区域。以往的系统学研究结果表明，苏铁属在苏铁类植物中最先分出，和苏铁目其他9属构成姐妹群关系；然而以往研究主要针对苏铁目下属间的分子系统发育关系，所涉及的苏铁属种类较少。因此，苏铁...
苏铁属的分子系统发育框架研究取得进展（图）
苏铁属 分子系统发育框架
2018/6/12
中国科学院昆明植物研究所特色观赏植物新品种选育与产业化示范团队物种濒危机制与保护遗传学研究组与泰国东芭热带植物园、深圳仙湖植物园、美国加州科学院以及台湾国立中山大学等单位合作，选取苏铁属90%的材料（100个接受种、7个亚种以及9个分类地位尚不确认成立的材料）为内类群，以银杏和苏铁目其他9属的材料为外类群，基于4个叶绿体片段(psbA-trnH，trnL-trnF，trnS-trnG和psbM-t...
【目的】对在中国有分布的库蚊属Culex种(亚种)的COⅠ序列和ITS2序列进行测序，构建和讨论这些种(亚种)的分子系统发育关系。【方法】测定了库蚊属20个种(亚种)的COⅠ和ITS2序列，并从NCBI数据库中下载了库蚊属另外20个种(亚种)的COⅠ和3个种(亚种)的ITS2序列。对库蚊属40个种(亚种)的COⅠ序列和其中23个种(亚种)的ITS2序列进行碱基构成、种间遗传距离和饱和度分析，并对C...
中国科学院昆明植物所首次构建牛肝菌科分子系统发育框架
中国科学院昆明植物所 牛肝菌科 分子系统 发育框架
2014/3/26
记者从中科院昆明植物研究所了解到，该所杨祝良研究组历经十多年材料搜集，并在前人研究的基础上，与国内外研究人员合作，首次较清晰地构建了牛肝菌科分子系统发育框架。该研究成果日前发表于《真菌多样性》。
荨麻科（Urticaceae）是被子植物一个中等大小的科，约有54属，2000余种，广泛分布于两半球的热带地区，延伸至温带，其中热带的亚洲是该科的多样性分布中心。荨麻科的很多种类有重要的经济价值、药用价值和生态价值，但由于其很多重要分类性状极其微小，不易观察，因此自该科1789年成立以来，其科下系统关系一直存在争议，亟待进行深入研究。
首次测定、分析了七种海洋纤毛虫（固着目、缘毛亚纲：团结蛤表单缩虫、拟杯状伪钟虫、糙面伪钟虫、倪氏聚缩虫、交替聚缩虫、羽状聚缩虫、中华拟聚缩虫）的rRNA转录间隔区-5.8S rRNA基因（ITS1-5.8S-ITS2）序列。结果显示：七种纤毛虫的5.8S区序列遗传相似度为0.9102—0.9811。ITS1和ITS2区的序列变异性大于5.8S区，遗传相似度分别为0.4201—0.9293，0.51...
《中国植物志》依照恩格勒系统, 将芸香科Rutaceae中的芸香亚科Rutoideae及飞龙掌血亚科Toddalioideae分列为两个亚科, 但形态及化学比较的结论支持将这两个亚科合并为芸香亚科Rutoideae; 而分子系统研究结果亦进一步支持合并, 并显示我国的吴茱萸属Euodia品种应按Hartley的处理, 分别置于吴茱萸属Tetradium和蜜茱萸属Melicope。另一方面, 九里香...
测定了中国锦鸡儿属Caragana各属下分类群20个代表种的ITS、trnL-F和trnS-G序列。基于3种DNA片段的单独分析所获得的系统发育树具有相似的拓扑结构; 3种片段的合并分析提高了各分支的支持度, 并获得了相似的系统发育树。落轴亚属subgen. Caragana的种类构成了一个在系统树上首先分化出来的单系分支, 与形态特征和地理分布的研究一致。短齿系ser. Occidentales...
蝗科高级阶元的分子系统发育(英文）
系统发育 蝗科 16S rDNA 12S rDNA
2009/6/23
迄今，蝗科内各分类阶元之间的系统发生关系大部分是未知的。本文用12S rDNA和16S rDNA两个基因的联合序列(795 bp)数据，以锥头蝗科的锥头蝗为外群，重建了分子系统树。研究结果表明，在12S rDNA与16S rDNA组成的联合数据中，转换的替代速率明显比颠换的替代速率高得多，核酸的替代已经发生了饱和。分子系统树表明：斑翅蝗亚科是一单系群，该亚科是一个合法的亚科，但斑腿蝗亚科和蝗亚科都...
基于线粒体DNA（mtDNA）中CoI基因的部分序列（1 300 bp）对雀形目雀科（Fringillidae）36种鸟类进行系统发育分析。对数据集构建NJ树、Bayes树和ML树。对建树结果进行分析，发现铁爪鹀（Calcarius lapponicus）与鹀属（Emberiza）鸟类的亲缘关系比其他雀科的鸟类更近；支持蓝鹀（Latoucheornis siemsseni）隶属于鹀属的观点；证实了...
蝗总科部分种类16S rDNA的分子系统发育关系
蝗总科 16S rDNA 分子系统发育
2008/2/1
摘要 摘 要：将自测的我国直翅目蝗总科8科8个种和从互联网GenBank中
检索到相关物种的线粒体基因组16S rDNA序列片段进行同源性比较，计算核苷酸使用频率，并构建分子系统树。在获得的480 bp的序列中，A+T约占70.7%，G+C为29.3%，颠换取代（transversion）的速率大于或接近转换取代（transition）的速率，其中188个核苷酸位点存在变异。研究结果表明：在直翅...
双壳纲动物核糖体RNA 18S-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and its Application in Phylogenetic Analysis
ITS1 18S RNA 遗传多样性 双壳纲
2008/1/20
摘要
测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明，该序列在种间存在很高的多态性，长度从558 bp到784 bp不等，碱基差异百分比在10.7%~61.7%之间， ITS1序列同源性很低，有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9%~23.7%之间，变化主要是碱基的转换。用邻接法（NJ）构建了8个种的18S部分序列（约240 bp...
DNA在鸟类分子系统发育研究中的应用
鸟类 分子系统发育 线粒体DNA 核DNA
2007/12/20
鸟类分子系统发育研究中常用的DNA技术有DNA杂交、RFLP和DNA序列分析等。DNA杂交技术曾在鸟类中有过大规模的应用，并由此诞生了一套新的鸟类分类系统。在鸟类的RFLP分析中，用的最多的靶序列是线粒体DNA。DNA序列分析技术被认为是进行分子系统发育研究最有效、最可靠的方法。在DNA序列分析中，线粒体基因应用最广泛，但由于其自身的一些不足，近年来，不少学者把目光投向了核基因，将线粒体基因和核基...
纤毛虫分子系统发育学的研究进展
纤毛虫 分子系统发育学 SSrRNA基因序列
2007/12/11
在回顾纤毛虫分子系统发育学产生发展历史的基础上．介绍了随后加年中RFLP、RAID和DNA序列分析等分子生物学技术作为该学科的主要研究方法在种群遗传多样性与进化、种上阶元系统发育学两方面取得的研究成果和近期研究进展．最后在探讨纤毛虫分子系统发育学存在的一些问题和解决方法的同时，预测了纤毛虫分子系统发育学今后将极大地推动真核生物的起源与进化、内共生等重要生物进化问题的研究。
基于18S rDNA的蝗总科分子系统发育关系研究及分类系统探讨
18S rDNA的蝗总科分子 发育
2007/12/10
将自测的我国直翅目蝗总科7科7种和从GenBank中下载的17种直翅目昆虫的18S rDNA序列片段进行了同源性比较，用似然比检验的方法对序列比对结果进行了碱基替代模型的选择，以蚱总科的Paratettix cucullatus和蜢总科的Stiphra robusta作外群，用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建了分子系统树。在获得的1 849 bp的序列中，有205个变异位点，74个简约信息位点； ...