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巨核细胞（Megakaryocyte，MK）是骨髓中产生血小板的血细胞，血小板在止血、伤口愈合以及炎症反应中具有重要的作用。然而目前血小板输注完全依赖于健康供者捐献，随着血小板输注需求量的增加，供者来源短缺，血小板难以在体外长期保存，血小板的输注存在巨大的供应缺口。而巨核细胞的多倍体化对于血小板产生非常重要，是高效生成功能性血小板的重要保障。因此解析巨核细胞多倍体化调控机制对于突破血小板再生技术瓶...
中国科学院北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能（图）
基因 分子细胞 核酸结
2024/4/7
2024年4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability的研究论文。该研究揭示了三...
2023年2月29日，国家自然科学基金委员会发布了2023年度中国科学十大进展。中国科学院动物研究所成果“揭示人类基因组暗物质驱动衰老的机制”入选。人类基因组是生命活动的“密码本”，它控制器官再生和机体稳态，亦影响器官退行及衰老相关疾病的发生。在该密码本中，素有“暗物质”之称的非编码序列约占98%，其中约8%为内源性逆转录病毒元件，为数百万年前古病毒整合到人类基因组中的遗迹。古病毒序列在衰老过程中...
基因治疗新方法可像“开关”一样精准控制基因表达
基因 蛋白质 RNA分子
2024/1/29
基因治疗对于遗传病患者来说是一种很有前景的治疗方案，但技术挑战仍然存在：表达治疗蛋白质的细胞会被患者的免疫系统作为“入侵者”攻击、消灭或中和，从而使治疗无效。2024年1月2日，美国贝勒医学院一研究团队在《自然-生物技术》发表其研究成果，通过修饰RNA分子，能够像打开电灯开关一样精准调控哺乳动物的基因表达，从而克服上述挑战。
肺癌是全球癌症致死的首位原因，而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%，是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型，5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比，小细胞肺癌的治疗手段单一，患者总生存率低。分子表征与组学研究不足，限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展，迄今为止，仅有少量针对小细胞肺癌临床样本的基因组研究被报道。小细胞肺癌普遍存在TP53和RB1的失活突变。缺乏驱动突变使得研究难以通过基因...
中国科学院水生生物研究所万种原生生物基因组计划取得阶段性进展（图）
生物基因 细胞 真核生物
2023/11/23
原生生物（Protist）是一大类单细胞真核生物的集合，包括单细胞真核藻类和原生动物等，组成了原生生物界。原生生物具有高度多样性，广泛分布于各类水环境中，在生态平衡、物质和能量循环、环境健康、动植物疾病发生等方面发挥重要作用。它们是水生态系统的重要组分，是重要的初级生产力和氧气的制造者、碳循环的关键参与者，是水产动物的优良饵料、人类的营养品、生物能源，是水环境的“哨兵”、水华和赤潮的重要元凶，是人...
广州地化所：发展了单细胞SIP-反向基因组学技术定向识别-分离-培养功能微生物（图）
细胞 基因 定向识别 分离
2024/1/10
微生物是地球上最为丰富且分布最为广泛的生命形式，在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中至关重要的环节，其中，降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物，是有机污染物降解的执行者。因此，深入研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性，并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定代谢功能”的活体菌株资源，以提升有机污染物去除效率，是业界长期追求的目标，亦是环境微生物...
中国科学院水生所揭示等位基因依赖表达和功能差异调控硅藻碳储存和生长的新机制（图）
基因依赖 硅藻碳储存 细胞 真核
2023/11/23
硅藻是一类自养的单细胞真核藻类，能够高效的将太阳能转化为化学能贮存起来，是主要的初级生产者，约占海洋总固碳量的40%，为地球提供了20%的初级生产力，相当于整个热带雨林的净初级生产量。三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）是硅藻研究的模式种，在特定的环境条件下以油脂（主要是甘油三酯，TAG）的形式将碳和能量储存起来。目前认为它仅有无性生殖方式，具有生长快、易培养、单位面积...
北京基因组所（国家生物信息中心）合作揭示调控灵长类心脏衰老的乙酰化开关（图）
纤维性颤动 细胞分化 基因编辑
2023/11/21
衰老是心血管疾病的首要危险因素，可导致心脏结构异常和功能衰退，如室壁肥厚、舒张功能障碍、纤维性颤动等。这些年龄相关的心脏变化往往会增加多种心脏疾病的患病率，进而影响人类健康和寿命。随着全球人口老龄化形势日益严峻，探索人类心脏衰老的核心机制，制定相应的预警、预防和治疗策略变得尤为重要。
2023年8月25日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）张维绮研究组联合中国科学院动物研究所刘光慧研究组和曲静研究组，阐述了天然免疫蛋白MAVS在调控人干细胞衰老方面的分子机制。这项研究揭示了MAVS在不依赖于天然免疫应答的情况下，通过维持线粒体结构功能稳态，对人干细胞的衰老调控发挥重要作用。相关成果以“MAVS antagonizes human stem cell senescen...
微生物单细胞全基因组测序是微生物学研究和生物技术产业的强大工具，但其核心技术瓶颈是如何实现精确到一个细菌细胞的高活性且高覆盖度的基因组DNA扩增。针对这一微生物业界共性技术瓶颈以及试剂行业的“卡脖子”问题，青岛能源所单细胞中心张佳副研究员等通过蛋白质理性设计和过程工程，发明了HotJa Phi29 DNA聚合酶，进而开发了名为iSGA（Improved Single-cell Genome Amp...
中国科学院生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制（图）
生物物理 基因 细胞功能
2023/7/16
2023年7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增强子（enhancer）作为调控基因转录的重要元件，往往需要通过远距离染色质环化与目标启动子（pr...
华大基因技术总监唐冲博士做客整合生物学前沿论坛（图）
华大基因 唐冲 整合生物学 单细胞测序
2024/4/28
2023年6月9日下午，第47期整合生物学前沿论坛在农科楼C205报告厅举行。华大基因技术总监唐冲博士应邀做客，并作了题为“单细胞测序中的速度和RNA结构动力学”的精彩报告。论坛由生命科学技术学院/生物医学与健康学院李礼研究员主持。
202年6月8日，中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨运桂研究组、蔡军研究组和中国科学院数学与系统科学研究院张世华研究组合作在Nature Communications 杂志上发表了题为“Spatiotemporal transcriptomic atlas reveals the dynamic characteristics and key regulators of planar...
急性髓系白血病(AML)是一种常见的血液系统恶性癌症，其治愈率低、预后较差，5年生存率仅为30-35%, 且AML患者对药物治疗的反应存在高度异质性。部分老年、复发难治的高危AML患者，不适合接受标准剂量的诱导化疗。一项I期临床试验结果表明，利用DNA甲基化酶抑制剂阿扎胞苷(AZA)进行表观干预5天后，再使用高剂量阿糖胞苷联合米托蒽醌(HiDAC-Mito)进行治疗，是一种有效且耐受性良好的治疗方...